See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor experiment packages

This page was generated on 2024-10-17 07:58:15 -0400 (Thu, 17 Oct 2024).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 15

1TCGAbiolinksGUI.data (3737)
2celldex (3571)
3ALL (3451)
4HSMMSingleCell (2914)
5airway (1926)
6geneLenDataBase (1839)
7scRNAseq (1762)
8pasilla (1018)
9sesameData (1001)
10tximportData (822)
11GSVAdata (797)
12TENxPBMCData (740)
13depmap (736)
14ChAMPdata (725)
15msigdb (663)

All experiment packages

All experiment package stats in one file: experiment_pkg_stats.tab

All experiment package download scores in one file: experiment_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor experiment repository (all packages combined)

4

4.10.1 (1)

A

a4Core (0)
a4Reporting (0)
aads.rnai (1)
ABAData (12)
abc (1)
abc.data (1)
ABHgenotypeR (1)
abind (15)
ace.fma (1)
acepack (3)
ACTIONet (1)
ActivePathways (1)
actuar (1)
ada (1)
adabag (1)
AdaptGauss (1)
adbcdrivermanager (0)
addinslist (1)
adductData (86)
ade4 (5)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adehabitat (1)
adehabitatLT (0)
adephylo (1)
ADGofTest (1)
aditools (1)
adjustedCurves (1)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admiralophtha (1)
admisc (13)
ADMM (0)
adSplit (1)
AER (1)
afex (2)
affxparser (1)
affy (1)
affycompData (77)
affycoretools (1)
affydata (444)
Affyhgu133A2Expr (54)
Affyhgu133aExpr (97)
Affyhgu133Plus2Expr (82)
affyio (1)
AffymetrixDataTestFiles (99)
Affymoe4302Expr (61)
Affymoe430Expr (1)
affyPLM (1)
AGHmatrix (0)
AgiMicroRna (0)
agricolae (10)
agridat (1)
agrmt (1)
AICcmodavg (1)
aigoraFitMini (1)
AIMS (0)
AIPW (1)
airr (1)
airway (1926)
akima (1)
alabama (1)
alakazam (1)
ald (0)
ALDEx2 (1)
aldvmm (1)
alembic (0)
AlgDesign (3)
alkahest.generic (0)
ALL (3451)
all (1)
allenpvc (3)
ALLMLL (166)
alluvial (1)
almanac (0)
alphahull (1)
alphashape3d (1)
alphavantager (1)
alpineData (12)
alr3 (1)
alr4 (1)
alsace (1)
altair (1)
altdoc (0)
amap (1)
AMARETTO (0)
ambient (1)
Amelia (1)
AmesHousing (1)
amgen.okta.client (1)
amgsafetyvis (1)
amlogger (1)
AmpAffyExample (64)
ANCOMBC (1)
ANCOMBCs (0)
AneuFinderData (114)
angrycell (1)
animation (2)
annaffy (1)
anndata (1)
AnnoProbe (1)
annotate (2)
AnnotationDbi (23)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (3)
AnnotationHubData (1)
annotatr (1)
anRichment (0)
anticlust (1)
antiProfilesData (84)
AnVIL (0)
anytime (5)
aod (2)
apcluster (1)
APCtools (1)
ape (53)
apeglm (1)
apex (1)
apexcharter (1)
APL (1)
apLCMS (1)
aplot (58)
appgen (1)
aqp (1)
aracne.networks (65)
archive (2)
ArchR (0)
argparse (13)
argparser (1)
argus.DS.Credentials (3)
argusDS.apc.utils (3)
argusDS.backtesting.engine (3)
argusDS.data (3)
argusDS.data.engineering (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (4)
argusDS.data.visualisation (1)
argusDS.database (2)
argusDS.DataValidation (1)
argusDS.DB.manager.utilities (2)
argusDS.distributions (1)
argusDS.driver.importance (2)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.FZ.utils (1)
argusDS.gamboostLSS (1)
argusDS.gamlss.distributions (1)
argusDS.gamlss.forecast (3)
argusDS.gamlss.modelling (3)
argusDS.gamlss.smoothers (1)
argusDS.gamlss.testing (3)
argusDS.gamlss.utils (2)
argusDS.GlobalSettings (1)
argusDS.model.testing (1)
argusDS.model.tools (3)
argusDS.model.validation (1)
argusDS.modeldb (1)
argusDS.possibility.curves.daily (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (2)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.S3 (2)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.signal.backtesting (0)
argusDS.signal.dataprep (2)
argusDS.signal.generation (0)
argusDS.smoothers (1)
argusDS.spread.trading.utils (3)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.studio.ml (1)
argusDS.studio.model.utils (1)
argusDS.Studio.MyStudio (2)
argusDS.Studio.permissions (2)
argusDS.Studio.utils (3)
argusDS.tabulator (2)
argusDS.trading.optimization (1)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.UI (2)
argusDS.utilities (1)
aricode (1)
arm (5)
aroma.affymetrix (8)
aroma.apd (8)
aroma.core (8)
aroma.light (1)
ArrayExpress (1)
arrayhelpers (1)
arrayop (1)
arrayQualityMetrics (0)
ARRmData (102)
arrow (24)
arsenal (1)
arules (4)
arulesViz (0)
ArvadosR (1)
arvupload (1)
ascii (1)
asciicast (1)
ASExtras4 (0)
AsgntDAMacro (1)
ash (6)
AshkenazimSonChr21 (32)
ashr (2)
asht (1)
ASICSdata (55)
AsioHeaders (6)
askpass (186)
ASMap (1)
asremlPlus (1)
assert (0)
assertive (1)
assertive.base (1)
assertive.code (1)
assertive.data (1)
assertive.data.uk (1)
assertive.data.us (1)
assertive.datetimes (1)
assertive.files (1)
assertive.matrices (1)
assertive.models (1)
assertive.numbers (1)
assertive.properties (11)
assertive.reflection (1)
assertive.sets (1)
assertive.strings (1)
assertive.types (12)
assertr (3)
assertthat (2)
AssessORFData (112)
ASSET (0)
AssotesteR (0)
astsa (1)
async (1)
ATACseqQC (1)
ATE (1)
ATR (1)
attachment (4)
attempt (1)
AUC (1)
AUCell (1)
audio (2)
audited (1)
auth0 (1)
av (1)
ava2 (2)
aws (1)
aws.ec2metadata (1)
aws.s3 (6)
aws.signature (6)
awsMethods (1)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (2)
AzureGraph (6)
AzureRMR (6)
AzureStor (1)

B

b64 (1)
babelgene (6)
babelmixr2 (1)
babelwhale (0)
babynames (1)
backbone (0)
backports (118)
BADER (0)
badger (0)
badminton (1)
baguette (0)
bain (1)
BalancedSampling (0)
ballgown (0)
bambu (0)
BART (0)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base2grob (1)
base64 (3)
base64enc (2)
base64url (1)
basefun (1)
basemaps (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
basilisk.utils (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
battenberg (1)
BayesFactor (2)
BayesFM (1)
bayesm (9)
bayesmeta (0)
bayesplot (13)
BayesPostEst (1)
bayesQR (1)
bayestestR (9)
BayesX (1)
baySeq (4)
BB (1)
BBmisc (1)
bbmle (15)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bccaEndometrial (1)
bcellViper (621)
bcp (1)
BDAtemplates (1)
bdsmatrix (15)
BE (1)
beachmat (1)
beadarray (1)
beadarrayExampleData (233)
BeadArrayUseCases (54)
BeadDataPackR (0)
BeadSorted.Saliva.EPIC (91)
beanplot (1)
beaver (1)
beepr (2)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkfdrData2019 (31)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (1)
benchr (1)
BentoBoxData (0)
berryFunctions (1)
Bessel (1)
bestglm (1)
bestNormalize (2)
beta7 (47)
betareg (1)
bettermc (1)
bezier (1)
BFpack (1)
BgeeDB (1)
BGLR (1)
bgs.ggtheme (1)
bgs.hephaistos (1)
bgs.hermes (1)
BH (230)
BIApylon (1)
BiasedUrn (14)
BIAutils (1)
bib2df (1)
bibtex (2)
biclust (0)
BIEN (1)
bife (1)
biganalytics (0)
bigassertr (1)
bigD (0)
bigdist (0)
BIGL (1)
biglasso (1)
biglm (4)
biglmm (1)
bigmemory (2)
bigmemory.sri (2)
bigparallelr (1)
bigreadr (1)
bigrquery (16)
bigsnpr (0)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutils (0)
bigutilsr (1)
billboarder (12)
binb (1)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (1)
binman (2)
binom (0)
binr (0)
bio3d (5)
biobank (1)
Biobase (10)
BioBase (1)
bioc::GenomeInfoDbData (0)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (5)
BiocFileCaches (1)
BiocGenerics (21)
BiocInstaller (1)
BiocIO (2)
BiocManager (313)
BiocNeighbors (3)
Bioconductor (1)
BiocParallel (20)
BiocSingular (2)
BiocStyle (1)
BiocVersion (25)
biocViews (1)
BiodiversityR (1)
BioEnricher (1)
Biogenerics (1)
BioGenerics (1)
BioImageDbs (31)
BioInstaller (1)
BioManager (0)
biomaRt (2)
biomartr (1)
biomformat (1)
biomod2 (1)
BioNet (1)
BioPlex (35)
biostat3 (1)
biostatR (0)
biostatUtil (0)
Biostring (1)
Biostrings (17)
biotmleData (63)
biotools (1)
BioVersion (1)
biovizBase (1)
BiplotML (1)
BiRewire (0)
birta (0)
biscuiteerData (99)
bit (67)
bit64 (23)
bitops (65)
bizdays (2)
bkbutils (1)
bladderbatch (539)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blimaTestingData (55)
blme (7)
blob (75)
blockcluster (1)
blockCV (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (0)
BloodCancerMultiOmics2017 (68)
bluster (1)
BlythStillCasellaCI (1)
BMA (1)
BMisc (1)
bmp (0)
bmspal (1)
bnlearn (2)
bodymapRat (157)
BOIN (0)
bold (1)
bookdown (42)
Boom (1)
boomer (1)
BoomSpikeSlab (1)
boot (84)
bootstrap (0)
botor (0)
box (11)
box.linters (1)
BPCells (1)
bpcp (1)
bRacatus (1)
BradleyTerry2 (1)
brainImageRdata (4)
brave (0)
breakpointRdata (132)
breastCancerMAINZ (115)
breastCancerMKI (0)
breastCancerNKI (113)
breastCancerTRANSBIG (104)
breastCancerUNT (89)
breastCancerUPP (122)
breastCancerVDX (191)
brew (68)
brgedata (94)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (0)
brickster (0)
BridgeDbR (1)
bridgesampling (0)
brio (168)
brms (1)
brmsmargins (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
bronchialIL13 (52)
broom (120)
broom.helpers (13)
broom.mixed (1)
broomExtra (1)
BrowserViz (1)
bs4Dash (12)
BSgenome (3)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (1)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (0)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (0)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (3)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.major (1)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (0)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (0)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (0)
BSgenome.Oaries.ENSEMBL.RambV2 (1)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (0)
BSgenomes (1)
bshazard (0)
bsicons (3)
bslib (388)
bsplus (1)
bsseq (1)
bsseqData (121)
bsts (1)
btergm (1)
bumphunter (1)
bupaR (1)
butcher (3)
bvls (0)
BWStest (2)

C

C50 (1)
ca (5)
CAbiNet (1)
cache (0)
cachem (292)
cAIC4 (1)
Cairo (21)
calibrate (1)
callr (254)
callthat (0)
CAM (1)
CAMERA (1)
campsis (1)
campsismod (1)
cancerdata (112)
candisc (1)
canvasXpress (1)
caper (1)
capsidr (1)
captioner (1)
capushe (1)
car (31)
carData (3)
Cardinal (1)
CardinalWorkflows (94)
caret (24)
caretEnsemble (14)
carrier (1)
CARTools (1)
casebase (1)
castor (2)
CATALYST (1)
catboost (1)
catdata (1)
Category (1)
caTools (15)
CATT (0)
causaldata (1)
CausalGPS (1)
cba (1)
CBDD (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (129)
ccdrAlgorithm (1)
ccDSM (1)
CCl4 (93)
ccTutorial (44)
cdcfluview (1)
cdip.datastore (1)
celarefData (33)
celda (1)
celldex (3571)
CellMapperData (47)
cellpypes (1)
cellranger (1)
cellxgene.census (1)
cem (1)
censored (1)
censReg (1)
CeTF (0)
ceu1kg (19)
ceu1kgv (14)
ceuhm3 (18)
cfToolsData (76)
cgam (1)
cgdsr (0)
cgdv17 (19)
CGHbase (1)
CGHcall (1)
cghMCR (0)
ChAMP (1)
ChAMPdata (725)
champdata (0)
changepoint (1)
chanmetab (1)
charmData (16)
checkmate (246)
checkr (1)
ChemmineOB (0)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
cheung2010 (16)
chevron (1)
ChIC.data (19)
chimera (0)
chimeraviz (0)
ChimpHumanBrainData (40)
ChIPComp (0)
chipenrich (0)
chipenrich.data (184)
ChIPexoQualExample (63)
ChIPpeakAnno (1)
ChIPQC (1)
ChIPseeker (0)
chipseq (0)
chipseqDBData (47)
ChIPseqR (0)
ChIPsim (0)
ChIPXpressData (134)
chk (6)
CHNOSZ (0)
chopsticks (0)
choroplethr (1)
chroGPS (0)
chromDraw (0)
ChromHeatMap (0)
chromote (14)
chromstaRData (119)
chromVAR (1)
chron (4)
cicero (1)
circlesize (0)
circlize (56)
circular (1)
cisPath (0)
CiteFuse (0)
citril (1)
Ckmeans.1d.dp (0)
clarabel (1)
class (48)
ClassDiscovery (1)
classInt (35)
cleanrmd (1)
cleanUpdTSeq (0)
cleaver (0)
cli (358)
cliapp (1)
CLIFF (1)
clinfun (1)
ClinicalQc (0)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clippda (0)
clipper (0)
clipr (20)
cliqueMS (1)
clisymbols (0)
CLL (233)
CLLmethylation (32)
clock (18)
Clomial (0)
Clonality (0)
clonotypeR (0)
clst (0)
clstutils (0)
clubSandwich (1)
clue (58)
CluMSIDdata (58)
cluster (93)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (4)
clustermq (5)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (3)
ClusterProfiler (1)
ClusterR (1)
clusterSim (1)
clusterStab (0)
ClusterTools (1)
clusthaplo (0)
clustifyrdatahub (42)
clustMixType (1)
ClustOfVar (1)
clustree (3)
clv (1)
clValid (1)
CMA (0)
cMap2data (185)
cmapR (1)
CMAverse (1)
cmdstanr (1)
cmocean (1)
CMplot (0)
cmprsk (4)
CmsAnalytics (1)
cn.farms (0)
cn.mops (1)
CNAnorm (0)
CNEr (1)
CNORdt (0)
CNORfeeder (0)
CNORfuzzy (0)
CNORode (0)
CNPBayes (0)
CNTools (0)
cnvGSA (0)
cnvGSAdata (52)
cnvgsadata (0)
CNVPanelizer (0)
CNVrd2 (0)
CNVtools (0)
coastr (1)
cobalt (2)
cobindR (0)
cobs (1)
CoCiteStats (0)
coda (25)
coda.base (1)
codelink (0)
codetools (91)
CODEX (0)
CoGAPS (0)
cogena (0)
cogeqc (1)
coGPS (0)
COHCAP (0)
COHCAPanno (84)
coin (2)
collapse (1)
collections (0)
coloc (20)
colonCA (66)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (12)
colorspace (115)
colortools (0)
coloRz (1)
colourpicker (12)
colourvalues (1)
cols4all (1)
ComBatFamQC (1)
combinat (1)
coMET (0)
commentr (1)
common (1)
CommonJavaJars (0)
commonmark (230)
compareDF (1)
compareGroups (1)
COMPASS (0)
compcodeR (0)
CompGO (0)
ComplexHeatmap (15)
complexheatmap (0)
ComplexUpset (1)
compositions (3)
CompQuadForm (0)
CompToxTools (0)
compute.es (1)
concaveman (1)
concrete (1)
condiments (1)
conditionz (1)
condMVNorm (1)
coneproj (1)
conf.design (1)
CONFESSdata (52)
config (28)
configr (1)
confintr (1)
conflicted (14)
confoundr (1)
connectapi (1)
ConnectivityMap (61)
connectwidgets (1)
conquer (3)
ConsensusClusterPlus (0)
consensusClustR (1)
consort (1)
ConsRank (1)
constructive (0)
contentid (2)
contfrac (1)
contingencytables (1)
conumee (1)
convert (0)
coop (1)
CoordinateCleaner (1)
copa (0)
COPDSexualDimorphism.data (58)
copula (3)
CopyhelpeR (68)
CopyNeutralIMA (35)
copynumber (1)
CopyNumber450k (0)
CopyNumber450kData (9)
CopywriteR (0)
coRanking (1)
CoRegNet (1)
Cormotif (0)
CorMut (0)
coRNAi (0)
corncob (1)
coro (1)
corpcor (3)
corpora (0)
correlation (4)
CORREP (0)
corrplot (19)
corrr (1)
COSG (1)
CoSIAdata (23)
COSMIC.67 (144)
cosmiq (0)
cosmosR (1)
COSNet (0)
countrycode (10)
coveffectsplot (0)
covr (23)
covRNA (0)
cowplot (108)
coxme (1)
coxphf (1)
CoxPhLb (1)
coxphw (1)
cplm (1)
cpm (1)
cpp11 (238)
cpvSNP (0)
cqn (1)
cranlogs (0)
crayon (177)
crch (1)
CRCL18 (31)
creatr (1)
credentials (49)
crew (4)
crew.cluster (1)
CRImage (0)
CRISPR.shinyapp (0)
crisprScoreData (182)
crlmm (0)
cronR (1)
crop (1)
crossdes (1)
crossmatch (1)
crosstable (1)
crosstalk (142)
crrri (0)
crrry (0)
crs (0)
crul (88)
csaw (0)
CSSP (0)
csv (1)
ctc (0)
ctsem (0)
cubature (2)
cubelyr (0)
Cubist (1)
cummeRbund (0)
curatedAdipoArray (28)
curatedAdipoChIP (30)
curatedAdipoRNA (31)
curatedBladderData (81)
curatedBreastData (112)
curatedCRCData (39)
curatedMetagenomicData (309)
curatedOvarianData (278)
curatedPCaData (17)
curatedTBData (33)
curatedTCGAData (533)
curl (461)
customProDB (0)
cutoff (1)
cvar (1)
cvAUC (1)
cvms (1)
CVST (1)
cvTools (1)
CVXR (2)
cxAnalysis (0)
cycle (0)
cyclocomp (23)
cydar (1)
cyphr (1)
cytofkit (1)
cytolib (1)
CytoMethIC (19)
CytoML (1)
CytoTRACE (1)
CytoTree (1)
Cytotree (1)

D

D2C (1)
d3heatmap (1)
d3r (1)
d3treeR (1)
DAAG (0)
daapr (1)
dada2 (0)
dae (1)
daff (1)
dagitty (1)
dagLogo (0)
DAISIE (1)
DALEX (1)
DALEX2 (1)
daMA (0)
DAMEfinder (1)
DAPAR (0)
DAPARdata (165)
dapr (1)
DARAtools (1)
DART (0)
DASiR (0)
dasnormalize.iomel (0)
dastools (1)
data.table (367)
data.tree (15)
DatabaseConnector (1)
dataCompareR (1)
DataEditR (0)
DataExplorer (1)
DataFerry (0)
dataframes2xls (1)
dataMaid (1)
datamods (13)
DataOmnio (1)
datapasta (1)
datapipeline (1)
dataRetrieval (1)
datasauRus (1)
DataVisualizations (1)
datawizard (13)
date (1)
DAVIDQuery (0)
davidTiling (47)
dbaccess (1)
dbarts (3)
DBChIP (0)
DBI (350)
DBItest (1)
dblplyr (1)
dblypr (0)
dbplyr (237)
dbscan (7)
dbx (8)
dcat (1)
DCchoice (1)
dcdatr (1)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
ddCt (0)
ddgraph (0)
ddpcr (1)
DDRTree (1)
debugme (2)
DECIPHER (1)
deconfectHelpers (1)
DeconRNASeq (0)
deconstructSigs (1)
decontam (0)
decor (1)
decoupleR (1)
decoupler (1)
DEDS (0)
Deducer (1)
deEndometrial (1)
deepregression (1)
deepSNV (0)
deeptime (1)
DEGraph (0)
degreenet (1)
DEGseq (0)
Delaporte (1)
DelayedArray (6)
DelayedMatrixStats (15)
deldir (60)
demuxmix (1)
dendextend (22)
dendroextras (1)
DendSer (1)
dendsort (0)
densEstBayes (8)
densityClust (1)
densvis (1)
DEoptim (1)
DEoptimR (27)
DEP (1)
depmap (736)
derfinder (0)
derfinderData (101)
derfinderHelper (0)
Deriv (4)
desc (133)
descr (1)
descsuppR (1)
DescTools (20)
DESeq (0)
DESeq2 (6)
designmatch (1)
DEsingle (1)
deSolve (14)
DeSousa2013 (51)
destiny (1)
devEMF (1)
devtools (33)
devutils (1)
DExMAdata (83)
DEXSeq (1)
dexus (0)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DFP (0)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (3)
DiagrammeRsvg (1)
dials (17)
DiceDesign (14)
DiceKriging (0)
diceR (1)
dichromat (6)
did (1)
DiffBind (1)
diffdf (0)
diffGeneAnalysis (0)
diffHic (0)
DiffLogo (0)
diffloop (0)
diffloopdata (39)
diffobj (4)
diffviewer (1)
digest (445)
diggit (0)
diggitdata (50)
digitalDLSorteR (1)
dimRed (1)
Dino (1)
diptest (4)
dir.expiry (1)
directlabels (4)
DirichletMultinomial (1)
discretecdAlgorithm (1)
DiscriMiner (1)
disk.frame (0)
dismo (1)
distances (1)
distill (1)
distory (1)
distr (1)
distr6 (1)
distributional (18)
distributions3 (0)
DistributionUtils (3)
distro (1)
dittodb (0)
dittoSeq (1)
DiurnalMRI (1)
dks (0)
DLBCL (117)
dlm (1)
dlookr (1)
dlstats (0)
dm (1)
DmelSGI (63)
DMRcaller (0)
DMRcate (1)
DMRcatedata (283)
DMRforPairs (0)
DMwR (1)
DNABarcodes (1)
DNAcopy (1)
DNAZooData (46)
dnet (1)
do (1)
DO.db (1)
doBy (4)
dockerfiler (1)
docopt (6)
DoE.base (1)
DoEstRare (0)
doFuture (1)
domainsignatures (0)
doMC (2)
domir (0)
doMPI (1)
DonaPLLP2013 (48)
donapllp2013 (0)
doParallel (12)
DOQTL (0)
doRedis (1)
doRNG (5)
dorothea (611)
DOSE (3)
Dose (0)
DoseFinding (1)
doseR (1)
doSNOW (2)
dotCall64 (11)
dotwhisker (1)
DoubleML (1)
DoubletFinder (1)
downlit (104)
downloader (1)
downloadthis (1)
dowser (1)
dparser (1)
dpbuild (1)
dpdeploy (1)
dpi (1)
dplyr (245)
dplyrb (1)
dpplyr (1)
dqrng (67)
drake (10)
drat (1)
drc (1)
drda (1)
DRDID (1)
dream (0)
DREAM4 (17)
dreamerr (1)
dressCheck (56)
drgee (0)
DriverNet (0)
DropletTestFiles (168)
DropletUtils (2)
DRR (1)
drugfindR (1)
DrugVsDisease (0)
DrugVsDiseasedata (159)
ds4psy (0)
dsb (1)
dslabs (1)
dspNgs (0)
dsQTL (17)
dsr (3)
DSS (0)
DT (225)
DTA (0)
dtplyr (33)
dttr2 (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (0)
duckdb (5)
duct.tape (1)
dunn.test (1)
DuoClustering2018 (96)
DupChecker (0)
dupRadar (0)
dv.teal (1)
DvDdata (52)
dwrPlus (1)
dyebias (0)
dyebiasexamples (61)
dygraphs (0)
dynamicTreeCut (1)
dynamite (0)
DynDoc (1)
dynfeature (0)
dynlm (1)
dynplot (0)
dynpred (0)
dynsbm (1)
DynTxRegime (1)
dynwrap (0)

E

e1071 (72)
eaf (0)
earth (3)
easierData (173)
easy.utils (1)
easyalluvial (1)
easyENTIM (1)
easypackages (1)
EasyqpcR (0)
easystats (3)
EatonEtAlChIPseq (59)
ebal (1)
EBarrays (0)
EBcoexpress (0)
EBImage (1)
EBSeq (0)
EBSeqHMM (0)
Ecdat (1)
ecfc (1)
Ecfun (1)
echarts4r (7)
ecodist (1)
ecoliLeucine (64)
ecolitk (0)
ECOSolveR (1)
ecospat (1)
Ecume (1)
EDDA (0)
edge (0)
edgeR (13)
EffectLiteR (1)
effects (1)
effectsize (8)
egg (6)
egor (1)
EGSEAdata (211)
eha (1)
eisa (0)
elasticsearchr (1)
ELBOW (0)
elevatr (2)
ellipse (24)
ellipsis (13)
elliptic (1)
ELMER (1)
ELMER.data (227)
EMAtools (1)
emayili (2)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (13)
emdist (1)
EMDomics (0)
emmeans (84)
EMMREML (1)
emoa (1)
emstreeR (1)
emtdata (34)
emulator (0)
enc (0)
encode (1)
ENCODEFig4Band4D (2)
encoDnaseI (14)
encryptr (0)
energy (1)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (0)
english (1)
enhancedvolcano (0)
EnhancedVolcano (1)
enmSdmX (1)
ENMTools (1)
EnrichedHeatmap (1)
enrichplot (2)
enrichPlot (1)
enrichR (2)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (0)
EnsDb.Hsapiens.v86 (1)
ensembldb (4)
ensemblVEP (0)
ensurer (1)
entropy (1)
envalysis (1)
ENVISIONQuery (0)
EnvStats (2)
Epi (3)
EpiDISH (1)
epigenomix (0)
EpiMix.data (81)
epimutacionsData (93)
EpiNow2 (3)
epiR (3)
EpiStats (0)
epitools (0)
epuRate (1)
eq5d (1)
equatags (1)
equate (1)
equivalence (1)
erccdashboard (0)
ergm (1)
ergm.multi (1)
erify (0)
erma (0)
errorlocate (1)
escape (1)
eset (1)
ESNSTCC (0)
esquisse (9)
estimability (31)
estimatr (1)
estmeansd (1)
estrogen (106)
etec16s (31)
etm (1)
eudysbiome (0)
eulerr (1)
EuPathDB (1)
europepmc (1)
evaluate (446)
EValue (3)
evd (4)
eventdataR (1)
eventPrediction (1)
eventTrack (0)
ewceData (252)
ewfutils (1)
Exact (2)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactextractr (1)
exactRankTests (2)
exams (0)
excelR (1)
ExiMiR (0)
exomeCopy (0)
ExomeDepth (1)
ExperimentHub (1)
ExperimentHubData (1)
expint (1)
explorase (0)
explore (1)
ExploreModelMatrix (0)
ExplorOMICS (1)
expm (23)
ExpressionView (0)
expss (3)
extraChIPs (1)
extraDistr (8)
extrafont (2)
extrafontdb (1)
extraInserts (0)
extraoperators (1)
extraTrees (0)
extRemes (1)

F

faahKO (333)
fabia (0)
fabiaData (43)
fable (1)
fabletools (4)
facopy.annot (6)
facsDorit (20)
factDesign (0)
factoextra (6)
FactoInvestigate (1)
FactoMineR (24)
Factoshiny (1)
fairhub.metadata (1)
fairhub.r.client (1)
fakepackage (1)
fANCOVA (3)
fansi (268)
FANTOM3and4CAGE (58)
faraway (1)
farms (0)
farver (154)
fastcluster (8)
fastDummies (22)
fasterize (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (26)
fastmap (205)
fastmatch (29)
fastmatrix (1)
fastqcr (1)
fastreeR (0)
fastseg (1)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (0)
faux (1)
fauxpas (1)
fBasics (3)
FCBF (1)
fCI (0)
FD (1)
fda (12)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (0)
fdrame (0)
fdrtool (5)
fds (6)
feasts (3)
feather (1)
feature (7)
FedData (0)
feisr (1)
FEM (0)
fenr (1)
fExtremes (7)
ff (14)
FField (1)
ffpe (0)
ffpeExampleData (62)
fftw (1)
fftwtools (1)
fGarch (6)
FGNet (0)
fgsea (1)
fhcmacro (1)
fibroEset (100)
fido (1)
FieldEffectCrc (28)
fields (7)
filehash (1)
filelock (87)
filesstrings (1)
finalfit (1)
FindMyFriends (0)
findpython (12)
fineimp (1)
FineR (1)
finetune (1)
fingerprint (1)
FIs (76)
FISHalyseR (0)
fission (233)
fit.models (1)
fitdistrplus (28)
fixest (1)
flagme (0)
flair (0)
flashClust (1)
Fletcher2013a (92)
Fletcher2013b (76)
flexclust (2)
flexdashboard (3)
flexmix (2)
flexsurv (1)
flexsurvcure (1)
flextable (30)
flipflop (0)
float (2)
flock (1)
flowAI (0)
flowBeads (0)
flowBin (0)
flowcatchR (0)
flowCHIC (0)
flowCL (0)
flowClean (0)
flowClust (1)
flowCore (1)
FlowCore (0)
flowCyBar (0)
flowDensity (0)
flower (1)
flowFit (0)
flowFitExampleData (14)
flowFP (0)
flowMap (0)
flowMatch (0)
flowMeans (0)
flowMerge (0)
flowPeaks (0)
flowPloidyData (60)
flowPlots (0)
flowQB (0)
flowQBData (5)
FlowRepositoryR (0)
FlowSOM (0)
FlowSorted.Blood.450k (343)
FlowSorted.Blood.EPIC (208)
FlowSorted.CordBlood.450k (55)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (58)
FlowSorted.CordBloodNorway.450k (41)
FlowSorted.DLPFC.450k (122)
flowStats (1)
flowTrans (0)
flowType (0)
flowUtils (0)
flowViz (0)
flowVS (0)
flowWorkspace (0)
flowWorkspaceData (186)
flux (1)
fma (1)
fmcsR (0)
FME (1)
fmeffects (0)
fmsb (1)
FMStable (1)
fmtr (1)
FNN (148)
focalCall (0)
foghorn (1)
fontawesome (105)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (1)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (26)
foreach (10)
forecast (9)
foreign (68)
forestmodel (1)
forestplot (1)
forestploter (1)
forge (1)
fork (1)
formatR (50)
formattable (1)
formatters (6)
Formula (18)
formula.tools (1)
forrester.metadata (0)
fortunes (1)
FourCSeq (0)
fourDNData (45)
fpc (64)
fpp2 (1)
fracdiff (5)
FragPipeAnalystR (1)
frailtypack (3)
FRASER (1)
freetypeharfbuzz (1)
fresh (13)
FrF2 (1)
FRGEpistasis (0)
frictionless (1)
frma (0)
frmaExampleData (68)
frmaTools (0)
fs (244)
FSA (1)
FSelectorRcpp (0)
fst (1)
fstcore (2)
ftExtra (1)
fTrading (1)
fucci (0)
FunciSNP (0)
FunciSNP.data (18)
fungible (1)
fUnitRoots (1)
funkyheatmap (1)
funModeling (1)
furniture (1)
furrowSeg (38)
furrr (15)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (209)
future.apply (182)
future.batchtools (1)
future.callr (5)
fuzzyjoin (1)
fuzzySim (1)
fwb (1)

G

g3viz (1)
GA (97)
gaga (0)
gage (0)
gageData (303)
gaggle (0)
gaia (0)
gam (14)
GAMBLR.results (1)
GAMBoost (1)
gamboostLSS (2)
gameofthrones (1)
gamlss (4)
gamlss.add (2)
gamlss.data (2)
gamlss.dist (5)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapminder (1)
gargle (55)
gaschYHS (42)
gaston (1)
GastrographPackage (1)
gatingMLData (20)
gaucho (0)
gausscov (1)
gbm (99)
gbRd (1)
gbutils (1)
gcatest (0)
gclus (1)
gCMAP (0)
gCMAPWeb (0)
gcrma (1)
gcspikelite (118)
gdata (22)
gDNAinRNAseqData (62)
gDRtestData (71)
gdsfmt (1)
gdsx (1)
gdtools (112)
gee (1)
geeasy (2)
geecc (0)
geepack (9)
geigen (0)
gemini (1)
gemma.R (0)
gemtc (0)
GenABEL (1)
GenABEL.data (1)
genArise (0)
GENE.E (0)
GeneAnswers (0)
GeneBreak (0)
GeneExpressionSignature (0)
genefilter (2)
genefu (0)
genekitr (0)
geneLenDataBase (1839)
genelendatabase (1)
GeneMeta (0)
GeneNetworkBuilder (0)
GeneNMF (1)
GeneOverlap (0)
geneplotter (1)
GeneralizedHyperbolic (2)
geneRecommender (0)
GeneRegionScan (0)
generics (27)
geneRxCluster (0)
GeneSelectMMD (0)
GeneSelector (0)
GENESIS (0)
geNetClassifier (0)
genetics (1)
GeneticsDesign (0)
GeneticsPed (0)
GENIE3 (0)
genoCN (0)
genomationData (99)
GenomeGraphs (0)
GenomeInfoDb (22)
GenomeInfoDbData (5)
genomeinfodbdata (1)
genomeIntervals (0)
GenomicAlignments (3)
GenomicDistributionsData (81)
GenomicFeatures (15)
GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18 (2)
GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9 (3)
GenomicFiles (0)
GenomicRanges (5)
GenomicTools (0)
GenomicTuples (0)
Genominator (0)
GenOrd (1)
genoset (0)
genotypeeval (0)
GenoView (0)
GenSA (2)
geobr (1)
geodata (1)
geodiv (1)
geohashTools (1)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonlint (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (8)
GEOmetadb (0)
geometries (22)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (0)
GEOquery (1)
geoR (1)
geos (1)
geosphere (13)
GEOsubmission (0)
GeoTcgaData (1)
gert (111)
gespeR (0)
gestalt (7)
gestate (1)
getip (2)
getopt (29)
GetoptLong (4)
getPass (3)
gettz (1)
GeuvadisTranscriptExpr (59)
geuvPack (7)
geuvStore (2)
geuvStore2 (8)
GEWIST (0)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (24)
ggalt (1)
gganimate (1)
GGBase (0)
ggbeeswarm (6)
ggbio (1)
ggbiploti (1)
ggbreak (0)
ggchicklet (1)
ggcorrplot (2)
ggdag (1)
GGdata (21)
ggdendro (18)
ggdensity (1)
ggdist (7)
gge (1)
ggeasy (1)
ggedit (1)
ggeffects (4)
ggExtra (7)
ggfittext (2)
ggforce (46)
ggformula (31)
ggfortify (2)
ggfun (74)
gggenes (1)
ggh4x (4)
gghalves (0)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (9)
ggiraphExtra (1)
gglm (1)
ggm (1)
ggmap (9)
ggmosaic (1)
ggmsa (1)
ggnetwork (1)
ggnewscale (59)
ggnewscales (0)
gGnome (1)
ggokabeito (1)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (395)
ggplot2movies (1)
ggplotify (32)
ggpmisc (7)
ggPMX (1)
ggpointdensity (6)
ggpp (8)
ggprism (2)
ggpubr (28)
ggRandomForests (0)
ggrap2 (1)
ggraph (36)
ggrastr (9)
ggrepel (286)
ggridges (47)
ggsci (70)
ggseqlogo (18)
ggside (6)
ggsignif (13)
ggspatial (1)
ggstance (3)
ggstats (7)
ggstatsplot (3)
ggsurvfir (0)
ggsurvfit (3)
ggtern (67)
ggtext (4)
ggthemes (16)
ggtree (15)
ggtreeDendro (0)
ggtreeExtra (1)
ggtut (16)
ggupset (1)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (3)
ggvis (1)
ggwordcloud (1)
gh (129)
ghpm (1)
ghql (0)
gifski (1)
GIGSEAdata (28)
gimme (1)
Giotto (0)
git2r (19)
gitcreds (23)
gitlabr (1)
gittargets (1)
GLAD (0)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
Glimma (1)
glmGamPoi (2)
glmGamPoiR (1)
GLMMadaptive (1)
glmmADMB (0)
glmmML (1)
glmmTMB (4)
glmnet (25)
glmnetUtils (12)
glmperm (1)
glmx (1)
GlobalAncova (0)
GlobalOptions (2)
globals (66)
globals, (0)
globaltest (0)
glpkAPI (1)
glue (177)
gmailr (2)
gMCP (0)
GMD (0)
Gmisc (1)
gmm (2)
gmnl (1)
gmodels (2)
gmp (19)
gmthemes (1)
gnm (1)
GO.db (3)
godmode (1)
goftest (2)
GOFunction (0)
golem (10)
golubEsets (259)
golubesets (0)
gongs (1)
goodpractice (1)
googleAuthR (3)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (42)
googlesheets (1)
googlesheets4 (49)
googleVis (2)
GOSemSim (2)
goseq (0)
goshawk (1)
GOstats (1)
gotop (0)
gower (17)
gpaExample (42)
GPArotation (11)
GPfit (1)
gplots (136)
gprofiler2 (3)
grafify (2)
gRain (1)
gralarkivar (1)
granny (1)
graper (1)
graph (1)
GraphGallery (1)
graphiQs (1)
graphite (1)
graphlayouts (60)
graphql (1)
graphsim (1)
grateful (1)
grates (3)
gratia (1)
gRbase (1)
greekLetters (1)
Greg (1)
greybox (1)
grf (0)
grid (1)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridpattern (1)
gridSVG (2)
gridtext (3)
grImport (1)
grImport2 (1)
grndata (50)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
GSA (1)
gsbDesign (0)
GSBenchMark (87)
gscounts (0)
gscreend (1)
gsDesign (1)
GSE103322 (41)
GSE13015 (36)
GSE159526 (27)
GSE62944 (72)
GSEABase (1)
GSEAbase (1)
gsignal (1)
gskb (6)
gsl (3)
gsmoothr (6)
gson (5)
gsrc (0)
gss (4)
gstat (1)
gsubfn (1)
GSVA (1)
GSVAdata (797)
gt (29)
gtable (230)
gtExtras (1)
gto (0)
gtools (60)
gtrellis (1)
gtsummary (3)
gtx (0)
gubraqsar (0)
GUniFrac (2)
gupio (1)
Gviz (2)
gwascat (1)
GWASdata (98)
GWASExactHW (7)
gwasrapidd (1)
GWASTools (0)
gwasvcf (1)
GWENA (0)
gWidgets (1)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (1)

H

h2o (5)
h5vcData (153)
HAC (0)
hahmmr (1)
hal9001 (1)
HandTill2001 (1)
haplo.stats (1)
HaploSim (0)
haplotrackR (1)
hapmap100khind (43)
hapmap100kxba (73)
hapmap500knsp (55)
hapmap500ksty (66)
hapmapsnp5 (192)
hapmapsnp6 (225)
harbChIP (50)
hardhat (56)
HardyWeinberg (0)
HarmanData (50)
HarmonizedTCGAData (36)
harmony (9)
hash (2)
haven (98)
HCAData (84)
HCATonsilData (47)
HD2013SGI (66)
HDCytoData (262)
hdf5 (1)
HDF5Array (13)
hdf5r (14)
hdf5r.Extra (1)
hdi (1)
HDInterval (12)
HDLSSkST (1)
HDmap (1)
hdnom (1)
HDO.db (1)
hdrcde (6)
healthyControlsPresenceChecker (25)
healthyFlowData (59)
heatmap.plus (1)
heatmaply (21)
HEEBOdata (55)
heemod (0)
HelloRangesData (92)
heplots (1)
here (2)
heritability (1)
Herper (0)
hetGP (1)
hexbin (21)
hexSticker (0)
hexView (1)
HGNChelper (1)
hgu133a.db (1)
hgu133abarcodevecs (34)
hgu133afrmavecs (5)
hgu133plus2.db (1)
hgu133plus2barcodevecs (33)
hgu133plus2CellScore (45)
hgu133plus2frmavecs (4)
hgu2beta7 (36)
hgu95a.db (0)
hgu95av2.db (1)
HiBED (24)
HiCBricks (0)
HiCDataHumanIMR90 (61)
HiCDataLymphoblast (54)
HiClimR (0)
HiContactsData (104)
hierfstat (0)
highcharter (1)
highlight (0)
HighlyReplicatedRNASeq (28)
highr (151)
highs (1)
Hiiragi2013 (130)
HilbertCurve (1)
HilbertVis (1)
HiTC (1)
HiTME (1)
HIVcDNAvantWout03 (36)
HiveR (1)
Hmisc (46)
HMMcopy (1)
HMP16SData (47)
HMP2Data (51)
hms (73)
hmyriB36 (18)
hoardr (1)
Homo.sapiens (0)
homosapienDEE2CellScore (14)
Hoover (1)
hopach (0)
Hotgenes (1)
howmany (1)
HPC.R.Utilities (1)
hpgltools (1)
hrbrthemes (3)
HSAUR2 (0)
HSAUR3 (1)
hsm (0)
HSMMSinglece11 (0)
HSMMSinglecel1 (0)
HSMMSingleCell (2914)
htmlTable (42)
htmltools (398)
htmlwidgets (210)
HTqPCR (0)
HTSCluster (1)
httpcode (1)
httpgd (2)
httptest (4)
httptest2 (1)
httput (1)
httpuv (366)
httr (155)
httr2 (145)
huge (1)
hugene10sttranscriptcluster.db (1)
HumanAffyData (44)
HumanPrimaryCellAtlasData (1)
humanStemCell (166)
hunspell (19)
huxtable (3)
hwriter (4)
hydroPSO (1)
hypergate (1)
hypergeo (1)
hyperSpec (1)
hypred (1)

I

IAPWS95 (1)
iatlas.app (1)
iatlasGraphQLClient (1)
iBreakDown (1)
iC10 (1)
iC10TrainingData (1)
ica (4)
ICC (1)
icenReg (1)
Icens (1)
ichorCNA (1)
iCiteR (3)
ICS (1)
ICSNP (1)
ICSOutlier (1)
IDEAFilter (1)
idorsiaQC (1)
IDPmisc (5)
idr (0)
ids (1)
ifnb.SeuratData (0)
iGasso (0)
igraph (191)
igraphdata (1)
igvShiny (1)
iheatmapr (4)
IHW (1)
IHWpaper (46)
ijtiff (1)
Illumina450ProbeVariants.db (620)
IlluminaDataTestFiles (109)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (3)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (1)
illuminaio (1)
imager (2)
imbalance (1)
imcdatasets (78)
imcRtools (0)
iml (1)
immunarch (1)
impmap (1)
import (3)
ImpulseDE2 (0)
impute (1)
imputeLCMD (0)
imputeTS (1)
IncDTW (1)
incidence (3)
incidence2 (3)
IncidencePrevalence (1)
ind1KG (14)
iNEXT (1)
infer (16)
infercnv (1)
influenceR (2)
InformationValue (1)
infotheo (1)
ingredients (1)
ini (1)
InkblotAnalytics (8)
INLA (0)
inline (1)
inlinedocs (1)
InraeThemes (1)
insight (18)
installr (1)
intamap (1)
intansv (0)
interactions (0)
InteractionSet (1)
InteractiveComplexHeatmap (1)
interactiveDisplayBase (1)
interactomes (1)
intergraph (1)
interp (19)
interval (1)
intervals (6)
inum (3)
invgamma (0)
iontreeData (11)
iotools (1)
ipaddress (1)
IPCAPS (1)
ipcwswitch (0)
IPDfromKM (0)
ipred (31)
ips (2)
iptmnetr (1)
ipw (1)
iq (1)
IRanges (21)
IRdisplay (1)
IRkernel (1)
irlba (22)
irr (1)
iSEE (1)
ISLR (1)
Iso (0)
isoband (54)
ISOcodes (2)
IsoCorrectoR (1)
IsoCorrectoRGUI (1)
isva (6)
ISwR (1)
ITALICSData (71)
iterators (10)
itertools (1)
ITKR (1)
itsadug (1)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)
Iyer517 (41)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (4)
janitor (5)
JASPAR2014 (111)
JASPAR2016 (177)
JavaGD (0)
JBrowseR (1)
jcolors (1)
JctSeqData (8)
jctseqdata (0)
JGR (1)
JM (0)
JMbayes (1)
jnjtemplates (1)
job (2)
Johnson (1)
JohnsonKinaseData (16)
joineRML (1)
jomo (1)
jonasrscripts (1)
jose (2)
jpeg (18)
jqr (9)
jquerylib (2)
js (1)
jskm (1)
jsonify (1)
jsonlite (244)
jsonvalidate (1)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (0)
JuliaCall (0)

K

kableExtra (25)
kangar00 (1)
KaryoploteR (0)
karyoploteR (1)
katex (1)
KEGG.db (1)
KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO (107)
KEGGdzPathwaysGEO (379)
KEGGgraph (1)
keggorthology (0)
KEGGprofile (0)
KEGGREST (10)
keggsvg (1)
Kendall (1)
keras (9)
KernelKnn (1)
kernlab (27)
KernSmooth (88)
Kernsmooth (1)
keyring (6)
KFAS (1)
khroma (1)
kidpack (43)
kinship2 (2)
kit (0)
kknn (0)
klaR (4)
km.ci (2)
kmed (1)
kml (0)
kml3d (0)
kmlShape (1)
KMsurv (0)
knitr (344)
knitrdata (1)
knockoff (0)
KOdata (112)
kohonen (1)
kpmt (0)
kriging (1)
ks (9)
kSamples (2)
ktplots (0)
kutils (1)
kyotil (1)

L

L1pack (1)
l2p (1)
labdsv (0)
labeling (173)
labelled (15)
laeken (3)
Lahman (1)
lambda.r (2)
lambdr (1)
LambertW (3)
lamW (4)
landscapemetrics (1)
languageserver (2)
LaplacesDemon (1)
lares (1)
lars (1)
lasso2 (1)
lastdose (1)
latentnet (1)
later (187)
latex2exp (1)
lattice (222)
latticeExtra (13)
lava (60)
lavaan (22)
lavaanPlot (1)
lavaSearch2 (1)
lazy (1)
lazyeval (9)
lbaQcCheck (1)
LBE (1)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lcopula (1)
lda (1)
ldap (1)
LDheatmap (1)
LDlinkR (0)
LDplots (1)
LEA (0)
leafem (2)
leaflegend (3)
leaflet (10)
leaflet.extras (3)
leaflet.minicharts (0)
leaflet.providers (3)
leafpop (1)
leafsync (1)
leaps (8)
LearnBayes (1)
learnr (7)
leeBamViews (81)
leiden (30)
leidenAlg (1)
leidenbase (14)
lemon (2)
leukemiasEset (150)
leukemiaseset (1)
lfa (0)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (15)
liana (1)
libcoin (4)
libgeos (1)
LiblineaR (12)
libr (1)
LiebermanAidenHiC2009 (40)
lifecycle (229)
liftOver (1)
liger (2)
lightgbm (2)
lime (1)
limma (34)
limmaGUI (0)
limmia (1)
limSolve (1)
LinMod2 (1)
Linnorm (0)
linprog (1)
lintr (105)
lisrelToR (1)
listenv (66)
ListerEtAlBSseq (41)
listviewer (1)
littler (0)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lm.beta (1)
lme4 (150)
lmerTest (1)
LMI (1)
LMMsolver (1)
lmodel2 (0)
lmom (13)
lmomco (1)
Lmoments (1)
lmtest (6)
lobstr (3)
locfit (113)
loe (0)
log4r (5)
logcondens (1)
logger (15)
logging (1)
LogicReg (1)
logistf (13)
logitnorm (1)
logitr (1)
logr (1)
logrrr (1)
logrx (1)
logspline (1)
lokern (1)
LOLA (1)
longComplexHeatmap (1)
longitudinalData (0)
longmemo (0)
loo (17)
LoomExperiment (0)
lotri (1)
LowRankQP (1)
lpridge (1)
lpSolve (16)
lpSolveAPI (2)
lpsymphony (1)
lqmm (1)
LRcellTypeMarkers (44)
lsa (8)
lsei (1)
lsmeans (1)
lubridate (107)
lumi (1)
lumiBarnes (74)
Luminescence (1)
LungCancerACvsSCCGEO (80)
LungCancerLines (85)
lungExpression (81)
lvec (1)
lwgeom (4)
lydata (171)
lymphoma (1)

M

m03modeldevelopment (1)
M3DExampleData (152)
M3Drop (0)
Maaslin2 (0)
maboost (1)
macrophage (334)
MACSdata (47)
MACSr (1)
maditr (1)
madness (0)
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (3)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (2)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (0)
maftools (1)
magic (2)
magicaxis (1)
magick (22)
magrittr (23)
maic (0)
maicChecks (0)
mailR (0)
MAIT (0)
makecdfenv (0)
maketools (1)
MALDIquant (4)
mammaPrintData (47)
manipulate (1)
manipulateWidget (1)
maotai (0)
mapbayr (0)
mapboxapi (1)
mapdata (1)
mAPKLData (18)
mapplots (1)
mapproj (2)
maps (16)
maptools (23)
maptree (0)
mapview (2)
maqcExpression4plex (69)
MAQCsubset (61)
MAQCsubsetAFX (20)
MAQCsubsetILM (28)
marginaleffects (1)
margins (1)
marinerData (51)
markdown (116)
Markdown (0)
markovchain (1)
marqLevAlg (1)
marray (1)
maser (1)
maSigPro (0)
MASS (358)
MassSpecWavelet (1)
MAST (1)
Matching (3)
MatchIt (4)
MatchThem (1)
mathjaxr (2)
matlib (0)
Matri (1)
Matrix (446)
matrix (1)
Matrix.utils (1)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixExtra (2)
MatrixGenerics (3)
MatrixModels (108)
MAtrixModels (0)
matrixStats (242)
matrixTests (1)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (7)
mbend (1)
MBESS (1)
mboost (3)
mc2d (2)
MCAData (0)
mclogit (0)
mclust (23)
mclustcomp (0)
mcmc (2)
mcmcabn (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (3)
MCMCprecision (1)
mco (0)
MCPcounter (0)
mcr (8)
mCSEAdata (134)
mcsurvdata (32)
mctq (1)
mcv (1)
mda (1)
mdmb (1)
MEALData (4)
measurements (1)
measures (1)
mediation (1)
MEDIPSData (83)
MEEBOdata (58)
memisc (0)
memoise (15)
MEMSS (1)
memuse (1)
MendelianRandomization (3)
merDeriv (1)
MerfishData (52)
merge (1)
merTools (1)
MeSHDbi (1)
MESS (2)
meta (1)
Metab (0)
metabaser (1)
metaBLUE (1)
metaBMA (1)
MetaboAnalystR (1)
metabolomics (0)
MetaboReport (1)
metacore (0)
metadat (0)
metafor (7)
metagenomeSeq (1)
MetaGxBreast (41)
MetaGxOvarian (37)
MetaGxPancreas (34)
metaMA (8)
metaMS (0)
metaMSdata (150)
metan (1)
metap (12)
metaplot (1)
metaplus (1)
metapod (1)
MetaScope (30)
metatools (0)
MetaUtility (0)
methyAnalysis (0)
MethylAidData (73)
methylclock (1)
methylclockData (177)
methylKit (1)
MethylMix (0)
MethylSeqData (29)
methylumi (1)
methyvimData (6)
metR (1)
Metrics (1)
metricsgraphics (1)
metrumrg (1)
mets (1)
MetStaT (1)
mev (1)
mFilter (0)
Mfuzz (0)
mfx (1)
mgcv (269)
mgm (0)
mgvc (1)
mhsmm (1)
mhurdle (1)
mi (1)
mia (0)
miaViz (0)
mice (15)
miceadds (1)
MicrobaCommunityProfileReader (1)
microbenchmark (6)
microbiome (1)
MicrobiomeBenchmarkData (51)
microbiomeDataSets (184)
microeco (1)
micromap (0)
microRNAome (36)
microseq (1)
Microsoft365R (0)
MIGSAdata (11)
miloR (1)
mime (27)
mimosa (1)
minet (1)
minfi (1)
minfiData (505)
minfiDataEPIC (122)
miniCRAN (1)
minionSummaryData (63)
miniUI (1)
minpack.lm (5)
minqa (131)
mirai (3)
miRBaseVersions.db (1)
miRcompData (77)
miRNATarget (83)
mirt (8)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (2)
missMethyl (1)
missRanger (2)
misty (1)
mitml (1)
mitoODEdata (11)
mitools (1)
mix (1)
mixOmics (1)
mixsqp (22)
mixtools (2)
mixture (1)
MKmisc (1)
mlbench (13)
MLEcens (1)
mlegp (0)
mlfa (1)
mlflow (1)
MLmetrics (1)
mlmm (1)
mlmm.gwas (0)
mlmRev (1)
mlogit (0)
mlpack (1)
mlr (1)
mlr3 (3)
mlr3cluster (1)
mlr3data (1)
mlr3filters (1)
mlr3fselect (1)
mlr3hyperband (1)
mlr3learners (2)
mlr3measures (1)
mlr3misc (2)
mlr3pipelines (2)
mlr3proba (1)
mlr3spatiotempcv (1)
mlr3tuning (1)
mlr3tuningspaces (1)
mlr3verse (0)
mlr3viz (1)
mlt (1)
mlt.docreg (0)
mma (1)
MMAPPR2data (34)
MMDiffBamSubset (60)
mmpf (0)
mmrm (40)
mnormt (18)
MNP (0)
mockery (4)
mockr (1)
modeest (1)
modelbased (3)
modeldata (15)
modelenv (1)
ModelMetrics (2)
modelObj (1)
modelr (37)
ModelR (1)
modelsummary (1)
modeltests (1)
modeltime (1)
modeltime.ensemble (1)
modeltools (1)
modetest (1)
modEvA (1)
MODIStsp (2)
modules (2)
MOFA (1)
MOFA2 (1)
MOFAdata (183)
moleculaR (1)
moments (3)
Momocs (1)
monaLisa (1)
mondate (1)
mongolite (1)
monkey (1)
monocle (1)
monocle3 (1)
MonoPhy (2)
morpheus (1)
Morpho (0)
mosaic (1)
mosaicCore (31)
mosaicData (1)
mosaicsExample (98)
motifmatchr (2)
mouse4302barcodevecs (33)
mouse4302frmavecs (4)
MouseAgingData (16)
mousecortexref.SeuratData (1)
MouseGastrulationData (162)
MouseThymusAgeing (73)
MPA (0)
MplusAutomation (1)
mpm (1)
mpn.scorecard (1)
mppR (0)
MPV (1)
mratios (1)
mregions (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msa (0)
msatR (1)
MSBdata (6)
MsCoreUtils (1)
msd16s (57)
msdata (619)
MsFeatures (0)
msigdb (663)
msigdbr (6)
msiImporter (1)
msm (7)
MSMB (78)
MSnbase (1)
Msnbase (1)
msPurityData (60)
msqc1 (34)
MSstats (1)
MSstatsBioData (6)
MSstatsConvert (1)
MSstatsLiP (1)
MSstatsTMT (1)
MSstatsTMTs (0)
mstate (1)
MSwM (1)
mtbls2 (128)
MTseekerData (6)
mtvnorm (1)
MUGAExampleData (49)
muhaz (0)
Mulder2012 (16)
muleaData (15)
multcomp (109)
multcompView (19)
multgee (1)
MultiAssayExperiment (0)
multicool (9)
multicross (1)
MultiDataSet (1)
multidplyr (1)
multiGSEA (1)
multimode (1)
multinichenetr (0)
multinma (1)
multipanelfigure (2)
multiplex (1)
multiwayvcov (1)
multiWGCNAdata (27)
multtest (1)
MuMIn (2)
munsell (122)
muscat (1)
muscData (168)
muscle (0)
MutationalPatterns (0)
mutoss (9)
mvabund (1)
mvna (0)
mvnfast (0)
mvnormtest (1)
mvoutData (60)
mvPot (0)
mvtnorm (148)
mwcsr (1)
mycor (1)
mygene (0)
myphd (0)
myTAI (0)
mzID (0)
mzR (1)

N

n1qn1 (1)
N2R (1)
nabor (1)
NACHO (1)
NADA (6)
NADIA (1)
naivebayes (0)
name (1)
namer (1)
namespace (1)
naniar (4)
nanoarrow (1)
nanonext (3)
nanopipeline (1)
NanoporeRNASeq (59)
NanoPyx (1)
NanoStringDiff (1)
NanoStringNCTools (0)
NanoStringNorm (1)
NanoStringQCPro (1)
nanostringr (1)
nanotime (1)
nanotubes (39)
narray (0)
nasapower (1)
nat.util (0)
nat.utils (0)
natserv (1)
naturalsort (0)
NbClust (1)
nbpMatching (0)
NBPSeq (1)
ncappc (1)
ncar (1)
ncdf4 (13)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1)
NCIgraphData (41)
ncigraphdata (1)
ncmeta (3)
NCmisc (1)
ncvreg (1)
ndexr (0)
ndjson (0)
Nebulosa (1)
negligible (0)
neo2R (1)
NEONiso (0)
neonUtilities (1)
nephro (1)
nestcolor (1)
nestedcv (1)
nestedLogit (1)
nestedmodels (1)
NestLink (34)
NetActivityData (60)
NetBID2 (1)
netDx.examples (1)
netmeta (0)
NetPreProc (1)
netrankr (1)
NetRep (1)
NetSwan (1)
network (3)
networkD3 (1)
networkDynamic (1)
neuralnet (0)
NeuralNetTools (1)
Neve2006 (54)
nFactors (1)
NGCHM (1)
NGScopyData (63)
ngsReports (0)
NHANES (1)
nhanesA (0)
nichenetr (1)
nimble (1)
nipals (1)
NISTunits (1)
NlcOptim (1)
nleqslv (2)
nlme (251)
nlmeODE (1)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (0)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (0)
nloptr (52)
NLP (2)
nls2 (1)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (14)
NMproject (1)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (52)
NNgenesets (1)
NNLM (1)
nnls (5)
NNutils (1)
noctua (1)
NOISeq (1)
nominatimlite (1)
NonCompart (1)
nonmem2R (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (3)
norm (2)
NormalizerDE (0)
NormalyzerDE (1)
NORMT3 (1)
nortest (1)
notame (1)
Nozzle.R1 (0)
npde (1)
nphRCT (0)
npsurv (1)
nseval (1)
nullabor (0)
nullrangesData (230)
numbat (9)
numbers (1)
numDeriv (2)
NxtIRFdata (113)
nycflights13 (1)

O

oaqc (1)
ObMiTi (27)
oce (1)
oct4 (47)
octad.db (66)
od (1)
odbc (27)
odyproteomicsValidator (0)
officedown (2)
officer (31)
oligo (1)
oligoClasses (1)
OlinkAnalyze (1)
olsrr (1)
OmicCircos (0)
omicsbase (0)
OMICsPCAdata (92)
omnibus (1)
OmnipathR (1)
omopgenerics (1)
ompr (1)
ompr.roi (1)
OnassisJavaLibs (47)
onbrand (0)
OncoBayes2 (0)
oncomarkerbase (1)
oneChannelGUI (0)
ontologyIndex (21)
ontologyPlot (1)
ontoProc (0)
oompaBase (5)
oompaData (5)
opdisDownsampling (1)
openCyto (1)
openeo (1)
OpenMx (1)
openssl (455)
openxlsx (62)
openxlsx2 (1)
operator.tools (1)
optextras (1)
optimalFlowData (79)
optimParallel (1)
optimr (1)
optimx (8)
optmatch (3)
optparse (49)
optpart (1)
optweight (1)
orca (1)
OrderedList (1)
ordinal (5)
ore (1)
org.Ag.eg.db (0)
org.At.tair.db (1)
org.Dm.eg.db (0)
org.Dr.eg.db (0)
org.Hs.eg.db (4)
org.Hs.eg.dB (1)
org.Mm.eg.db (2)
org.Pf.plasmo.db (0)
org.Psativumv2.eg.db (1)
org.Rn.eg.db (1)
org.Sc.sgd.db (1)
org.Ss.eg.db (0)
OrganismDbi (1)
oricvis (1)
orientlib (1)
origami (1)
orthogene (0)
orthopolynom (1)
orthosData (79)
oskeyring (1)
osmdata (7)
osprey (1)
osqo (1)
osqp (3)
otargen (1)
outliers (1)
OUTRIDER (1)
overlapping (0)

P

PAA (0)
packcircles (1)
packer (1)
packrat (35)
pacman (0)
padr (1)
pagedown (2)
pagoda2 (0)
PAIRADISE (1)
PairedData (1)
pak (4)
paletteer (10)
palmerpenguins (1)
palr (1)
pals (4)
pammtools (1)
pamr (1)
pan (1)
pander (4)
pandoc (1)
panelr (1)
paquet (1)
paradox (1)
parallelDist (1)
parallelly (193)
parallelMap (1)
parallely (1)
param6 (1)
parameters (12)
ParamHelpers (1)
parathyroid (8)
parathyroidSE (377)
parathyroidse (1)
parcats (1)
PARdesign (1)
parrallely (1)
parsedate (4)
parsnip (18)
partitions (1)
party (62)
partykit (4)
pasilla (1018)
pasillaBamSubset (341)
PasillaTranscriptExpr (64)
pastecs (1)
PASWR (1)
patch (1)
patchwork (86)
pathfindR (1)
pathfindR.data (1)
pathifier (0)
PathNetData (51)
pathprintGEOData (6)
pathview (1)
pathways (1)
PatientProfiles (1)
patientProfilesVis (1)
patrick (1)
paws (16)
paws.analytics (16)
paws.application.integration (16)
paws.common (115)
paws.compute (71)
paws.cost.management (16)
paws.customer.engagement (16)
paws.database (16)
paws.developer.tools (16)
paws.end.user.computing (16)
paws.machine.learning (16)
paws.management (16)
paws.networking (16)
paws.security.identity (16)
paws.storage (112)
pbapply (37)
pbdZMQ (2)
PBIR (0)
pbivnorm (0)
pbkrest (0)
pbkrtest (57)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (1)
PBSddesolve (1)
PBSmapping (1)
pbv (1)
pcaExplorer (0)
pcaGoPromoter.Hs.hg19 (16)
pcaGoPromoter.Mm.mm9 (16)
pcaGoPromoter.Rn.rn4 (16)
pcalg (1)
pcaMethods (1)
PCAmixdata (1)
pcaPP (22)
PCAtools (1)
PCDimension (1)
pch (0)
PCHiCdata (69)
PCICt (1)
pcse (1)
pcxnData (62)
pd.atdschip.tiling (48)
pdfCluster (1)
pdftools (9)
pdInfoBuilder (1)
pdist (1)
pdp (1)
PeacoQC (1)
PeakcoQC (1)
PearsonDS (0)
pec (1)
pedigree (0)
pedigreemm (1)
pedtools (1)
pegas (2)
pegboard (0)
PEIP (1)
PEMM (1)
penalized (1)
pepDat (54)
PepsNMRData (55)
Peptides (1)
performance (12)
PerformanceAnalytics (1)
periscope (1)
perm (8)
permimp (0)
permute (4)
PFAM.db (1)
PFIM (1)
pgirmess (1)
PGPC (6)
PGSEA (0)
phangorn (3)
pharmaRTF (0)
pharmaversesdtm (0)
phastCons100way.UCSC.hg19 (2)
pheatmap (1)
phenoTest (1)
philentropy (3)
phonTools (1)
phosphoricons (6)
PhosR (0)
phyclust (1)
phylobase (1)
phylocanvas (0)
phylogram (0)
phylolm (1)
PhyloProfileData (28)
phyloseq (1)
phylosignal (1)
phylotools (0)
phyr (1)
phytools (7)
picante (1)
piecewiseSEM (0)
piggyback (1)
pillar (72)
pimeta (1)
pinfsc50 (1)
pingr (13)
pins (19)
pipebind (1)
pipeR (0)
piton (1)
pivotalPilars (1)
pivotalPillars (1)
pivotalReporters (1)
pixmap (13)
PK (1)
pkbrtest (1)
pkgbuild (153)
pkgcache (10)
pkgconfig (3)
pkgdepends (11)
pkgdown (118)
pkgKitten (1)
pkglite (1)
pkgload (336)
pkgmaker (3)
pkgpub (1)
pkgsearch (1)
PKI (7)
PKNCA (0)
PKPDdatasets (1)
PKPDmodels (1)
PKreport (1)
planet (1)
plantecophys (1)
plasFIA (10)
plier (0)
plm (1)
PLNmodels (1)
plogr (2)
plot3D (5)
plot3Drgl (1)
plotfunctions (1)
plotgardener (0)
plotgardenerData (92)
plotly (154)
plotlyGeoAssets (1)
plotmm (0)
plotmo (2)
plotrix (16)
plotROC (2)
pls (4)
plumber (20)
plyr (171)
plyranges (1)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (3)
pmforest (1)
pmml (1)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (0)
png (53)
poeticST (1)
poibin (1)
poilog (1)
pointblank (1)
PoissonBinomial (0)
polars (1)
poLCA (1)
polspline (4)
Polychrome (0)
polyclip (111)
polycor (0)
polyCub (3)
polyester (0)
polynom (4)
PolynomF (1)
polysat (0)
pool (11)
poolfstat (1)
poorman (2)
PopED (0)
popEpi (0)
poppr (1)
PossibilityCurves (2)
posterior (14)
PowerExplorer (1)
poweRlaw (10)
powerTCR (1)
PowerTOST (1)
powsimR (1)
ppcor (1)
ppiData (24)
prabclus (3)
pracma (33)
prada (1)
praise (1)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
prebsdata (72)
PreciseSums (1)
preciseTADhub (26)
precommit (1)
precrec (1)
PREDAsampledata (73)
prediction (1)
predictmeans (0)
predint (0)
PReMiuM (0)
preproc.iquizoo (1)
preprocessCore (1)
preprocessorCore (1)
preseqR (1)
presser (1)
presto (1)
prettycode (1)
prettydoc (1)
prettymapr (1)
prettyunits (193)
priceR (2)
primeviewcdf (1)
primeviewprobe (1)
princurve (1)
printr (1)
prioritylasso (1)
prismatic (7)
PRISMselector (1)
probably (1)
pROC (48)
processCore (0)
processx (312)
procs (1)
ProData (47)
prodlim (45)
productplots (0)
proffer (1)
profile (0)
profileModel (1)
profmem (1)
profvis (30)
progeny (1)
ProgMan (1)
progress (128)
progressr (46)
proj (0)
PROJ (5)
proj4 (16)
ProjecTILs (1)
projpred (1)
pRolocdata (248)
promise (1)
promises (268)
prompt (1)
prompter (2)
PropCIs (1)
properties (1)
propr (1)
PROreg (1)
PROscorer (1)
PROscorerTools (1)
ProSpect (1)
prostateCancerCamcap (37)
prostateCancerGrasso (44)
prostateCancerStockholm (30)
prostateCancerTaylor (34)
prostateCancerVarambally (32)
proteomixr (1)
ProtGenerics (1)
proto (1)
protoarrayr (1)
protolite (1)
protr (12)
protti (1)
protViz (1)
proxy (3)
proxyC (3)
PRROC (6)
pryr (13)
ps (339)
PSCBS (7)
pscl (3)
PsNR (0)
pspearman (1)
pspline (2)
psych (122)
psychometric (6)
psychonetrics (0)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
ptairData (64)
PtH2O2lipids (94)
ptw (1)
PubChemR (1)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (1)
pulsar (1)
pumadata (72)
PupillometryR (1)
PureCN (0)
purrr (138)
purrrlyr (1)
purrrr (1)
pvca (0)
pvclust (1)
PWMEnrich.Dmelanogaster.background (58)
PWMEnrich.Hsapiens.background (58)
PWMEnrich.Mmusculus.background (52)
pwr (0)
pwrEWAS.data (19)
PwrGSD (1)
pyinit (1)
pzfx (1)

Q

qap (14)
qbaDatabase (1)
qcc (1)
qclMatrix (1)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq (1)
QDNAseq.hg19 (154)
QDNAseq.mm10 (83)
qgam (1)
QGEDP (1)
QGIOP (1)
QGMI (1)
QGplots (1)
QGqtl (1)
qgraph (2)
QGTAP (1)
QGtemplates (1)
qicharts (1)
qiimer (1)
qlcMatrix (19)
qpcR (0)
qpdf (3)
qPLEXdata (53)
qqconf (10)
qqman (3)
qqplotr (1)
qrcode (1)
qreport (1)
qrng (1)
qrnn (1)
qs (13)
QSARdata (1)
qtl (2)
qtl2 (2)
quadprog (2)
qualityTools (1)
qualpalr (1)
qualtRics (1)
qualV (1)
quantable (1)
quanteda (2)
quantmod (12)
QuantPsyc (1)
quantreg (88)
quantsmooth (1)
quarto (9)
QUBICdata (49)
qubiGenestack (1)
questionr (2)
QuickJSR (6)
quickmatch (0)
qvalue (1)
qvcalc (1)
qwraps2 (1)

R

r (1)
r-library-rags-stash (1)
R.cache (2)
R.devices (8)
R.filesets (8)
R.huge (7)
R.matlab (1)
R.methodsS3 (10)
R.oo (67)
R.rsp (1)
R.utils (119)
R2admb (1)
r2d2 (1)
r2d3 (2)
R2GUESS (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (0)
r2rtf (1)
R2wd (1)
R2WinBUGS (1)
R6 (28)
rAccess (1)
radarchart (0)
radiant (1)
radiant.data (1)
radiant.model (1)
radiator (0)
raerdata (46)
ragg (251)
rainbow (10)
rAmCharts (2)
RamiGO (0)
randomcoloR (6)
RandomFields (1)
RandomFieldsUtils (1)
randomForest (6)
randomForestSRC (2)
randomizr (1)
randomNames (1)
randtests (1)
randtoolbox (1)
rangeModelMetadata (1)
ranger (17)
RankAggreg (1)
RankProd (0)
RANN (8)
rapiclient (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (1)
RApiSerialize (9)
rappdirs (6)
rapportools (2)
rARPACK (6)
raster (20)
rasterVis (1)
ratelimitr (1)
RAthena (12)
rayimage (1)
rayrender (1)
rayvertex (1)
rbenchmark (1)
RBesT (1)
RBGL (1)
rbibutils (49)
rbioapi (4)
RBioFormats (1)
rBLAST (1)
rbmi (0)
rbokeh (1)
Rcapture (1)
rcartocolor (1)
RccpTOML (1)
rcdk (12)
rcdklibs (12)
rcellminerData (89)
Rcgmin (1)
rCharts (1)
Rchoice (1)
RCircos (0)
RcisTarget (1)
RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp (145)
RClickhouse (0)
rclipboard (8)
rcmdcheck (14)
Rcmdr (1)
RcmdrMisc (2)
RColorBrewer (21)
rcompanion (1)
rcorpora (1)
Rcpp (363)
rcpp (1)
RcppAlgos (1)
RcppAnnoy (47)
RcppArmadillo (270)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (1)
RcppDate (1)
RcppDE (0)
RcppDist (0)
RcppEigen (204)
RcppEnsmallen (1)
RcppGSL (4)
RcppHNSW (33)
RcppInt64 (1)
RcppML (7)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (26)
RcppProgress (1)
RcppRoll (6)
RcppSimdJson (34)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (3)
RcppTOML (20)
RcppZiggurat (6)
Rcsdp (0)
RCurl (226)
RCy3 (1)
Rd2roxygen (0)
RDAVIDWebService (0)
RDCOMClient (1)
rdd (1)
rdflib (1)
Rdimtools (0)
rdocx (1)
Rdpack (53)
rdrop2 (1)
Rdsdp (0)
reactable (3)
reactlog (1)
reactome.db (2)
ReactomeGSA (0)
ReactomeGSA.data (83)
ReactomePA (1)
reactR (41)
readbitmap (0)
reader (1)
readJDX (1)
readODS (2)
readr (133)
readstata13 (1)
readxl (76)
rearrr (1)
REBayes (0)
recipes (62)
reclin (1)
recommenderlab (2)
recosystem (2)
reda (0)
REddyProc (1)
RedeR (1)
redison (1)
redland (1)
redoc (1)
redux (1)
refinr (1)
RefManageR (1)
refund (1)
reghelper (1)
registry (2)
RegParallel (85)
regress (1)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (9)
relimp (1)
relsurv (1)
remaCor (7)
rematch (98)
rematch2 (2)
remotes (157)
rempsyc (0)
renderthis (1)
rentrez (1)
renv (153)
Repitools (1)
report (2)
reporter (1)
ReporteRs (1)
ReporteRsjars (1)
reporting (1)
ReportingTools (1)
repr (7)
reprex (80)
repurrrsive (1)
reReg (0)
reshape (5)
reshape2 (7)
ResidualMatrix (1)
ResourceSelection (1)
restfulr (12)
restfulSEData (119)
RestRserve (1)
reticulate (92)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (13)
Rfast (17)
Rfast2 (2)
rfcdmin (7)
rfishbase (1)
Rfit (1)
RFOC (8)
RforProteomics (145)
rgbif (1)
RGCCA (0)
rgdal (22)
rgenoud (1)
rgeos (19)
rgexf (1)
rgl (4)
Rglpk (1)
rglwidget (1)
RGMQLlib (63)
rgnparser (1)
RgoogleMaps (7)
rgr (1)
Rgraphviz (1)
rGREAT (1)
rhandsontable (3)
rhdf5 (3)
rhdf5filters (2)
Rhdf5lib (3)
rheumaticConditionWOLLBOLD (44)
rhino (14)
RhpcBLASctl (2)
Rhtslib (2)
rhub (4)
rice (1)
RICGA.clinical (1)
RIdeogram (0)
ridigbio (2)
riem (1)
Ringo (1)
rintrojs (7)
rio (18)
RIPSeeker (1)
RIPSeekerData (18)
RISCA (1)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
RITANdata (75)
ritis (1)
RItools (2)
riverplot (1)
rj (1)
rj.gd (1)
rjags (2)
rJava (112)
RJDBC (1)
rjson (37)
rjsoncons (1)
RJSONIO (19)
Rlab (0)
Rlabkey (1)
rlang (493)
rlaR (1)
rlecuyer (1)
rlemon (0)
RLHub (23)
rliger (1)
rlist (1)
rlistings (2)
RLRsim (1)
rly (0)
Rmagic (1)
rmapshaper (1)
RMariaDB (21)
rmarkdown (394)
RMassBankData (68)
rmatio (1)
rmcfs (1)
rmcorr (1)
rmdformats (1)
rmeta (1)
rminer (0)
rmint.sdtm (1)
rmio (1)
rMisbeta (1)
Rmisc (1)
Rmixmod (1)
Rmpfr (16)
Rmpi (1)
rms (4)
rmsb (1)
rmspc (1)
RMTstat (1)
rmutil (1)
rMVP (1)
RMySQL (5)
RNAi (1)
RNAinteractMAPK (44)
RNAmodR.Data (79)
RNAseqData.HeLa.bam.chr14 (4)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 (342)
RNASeqDataSubset (3)
rnaseqGene (1)
RNASeqPower (0)
RNAseqQC (1)
RNASeqRData (8)
RnaSeqSampleSizeData (116)
RnaSeqTutorial (15)
rnaturalearth (2)
rnaturalearthdata (1)
RnBeads (0)
RnBeads.hg19 (199)
RnBeads.hg38 (129)
RnBeads.mm10 (84)
rnbeads.mm10 (0)
RnBeads.mm9 (96)
RnBeads.rn5 (42)
rncl (1)
RNetCDF (3)
RNeXML (1)
rngtools (3)
rngWELL (1)
RNifti (1)
rnoaa (1)
RNOmni (1)
roak (1)
robfilter (2)
RobinCar (1)
RobStatTM (1)
robumeta (1)
robust (18)
robustbase (39)
robustlmm (1)
RobustRankAggreg (0)
ROC (1)
ROCit (1)
ROCR (2)
RODBC (3)
ROI (1)
ROI.plugin.glpk (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
roll (2)
rols (0)
Rook (1)
rootSolve (14)
ropls (1)
roptim (1)
ROracle (1)
ROSE (1)
rosettR (0)
rosm (1)
rotl (2)
round (1)
roxygen (1)
roxygen2 (174)
rpact (1)
rpart (71)
rpart.plot (1)
RPEGLMEN (1)
RPEIF (1)
RPESE (1)
rpf (1)
RPMG (8)
Rpoppler (0)
RPostgres (84)
RPostgreSQL (4)
RPresto (1)
rprintf (1)
rprojroot (174)
rpromis (1)
RProtoBuf (1)
RProtoBufLib (1)
rpsftm (1)
RPtests (1)
RPushbullet (0)
Rqc (0)
rr2 (1)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
RRBSdata (47)
rrcov (23)
rrcovNA (1)
rRDPData (55)
rredlist (1)
RRPP (1)
rrsq (1)
rsample (24)
Rsamtools (4)
rsatscan (1)
rsbml (0)
RSclient (1)
rsconnect (47)
RSEIS (8)
RSelenium (2)
Rserve (1)
RSiena (1)
RSKC (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
rsnps (0)
Rsolnp (1)
rsparkling (1)
rsparse (1)
RSpectra (47)
Rspectra (1)
rspm (1)
RSQLite (220)
RsSimulx (0)
RsSimulx.1 (0)
rstan (17)
rstanarm (1)
rstanemax (1)
rstantools (14)
rstatix (25)
rstpm2 (1)
rstudioapi (168)
Rsubread (1)
rsvd (10)
rsvg (4)
RSVSim (1)
Rsymphony (1)
rtables (5)
RTCGA.clinical (289)
RTCGA.CNV (70)
RTCGA.methylation (68)
RTCGA.miRNASeq (122)
RTCGA.mRNA (194)
RTCGA.mutations (96)
RTCGA.PANCAN12 (154)
RTCGA.rnaseq (144)
RTCGA.RPPA (65)
RTCGAToolbox (0)
rtdists (1)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
RTN (1)
rtracklayer (3)
Rtsne (38)
Rttf2pt1 (2)
rtweet (7)
Ruchardet (0)
rugarch (3)
RUnit (12)
runjags (1)
runner (3)
runonce (0)
Runuran (1)
ruODK (1)
ruv (1)
RUVnormalizeData (80)
RUVseq (0)
RVAideMemoire (1)
Rvcg (0)
rvcheck (4)
RVenn (0)
RVerbalExpressions (1)
rversions (33)
rvertnet (1)
rvest (165)
rvg (2)
Rvmmin (1)
RVtests (0)
Rwave (7)
rwdisplay (0)
RWiener (1)
rworldmap (1)
RxODE (0)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)

S

s2 (48)
s3fs (0)
S4Arrays (2)
S4Vectors (11)
S4vectors (1)
saemix (0)
safeBinaryRegression (1)
safetyCharts (0)
safetyData (0)
safetyexploreR (0)
SAGx (1)
SAIGEgds (0)
sampleClassifierData (52)
sampleSelection (1)
sampling (1)
samr (6)
sandwich (16)
santoku (1)
sas7bdat (1)
sasLM (1)
SASmixed (1)
sass (329)
sassy (1)
SASxport (1)
satchel (1)
satellite (3)
satuRn (1)
SBGNview.data (226)
sbw (0)
SC3 (1)
scaeData (18)
scagnostics (1)
ScaledMatrix (2)
scales (149)
scalreg (1)
scam (0)
scanMiR (1)
scanMiRData (65)
scATAC.Explorer (29)
SCATE (0)
SCATEData (66)
scater (1)
scatterD3 (2)
scattermore (18)
scatterpie (42)
scatterplot3d (15)
scClassify (0)
scclusteval (0)
sccore (1)
sccs (0)
scCustomize (2)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
ScDblFinder (1)
scDblFinder (2)
scDC (0)
sceptre (1)
scGate (1)
schoolmath (1)
scHOT (0)
scico (1)
scidb (1)
Scillus (0)
scistreer (9)
scITD (1)
scJonas (1)
SCLCBam (47)
scLinear (0)
scMerge (0)
scMultiome (74)
scooter (1)
scoringRules (1)
SCP (1)
scpdata (71)
scPipe (0)
scran (2)
scRepertoire (1)
screpertoire (1)
scrime (6)
scRNAseq (1762)
scRNASeq.spatial (0)
scry (1)
scrypt (5)
scs (1)
scTHI.data (47)
SCtools (1)
sctransform (21)
sctrnasform (1)
scuttle (12)
scviewer (0)
sda (1)
sdmpredictors (1)
SDMTools (1)
sdpR (1)
sdtmchecks (1)
secretbase (5)
secrets (1)
see (3)
segmented (32)
selectr (1)
sem (1)
semEff (1)
semTools (1)
sen2r (0)
sendmailR (2)
sensemakr (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
seq2pathway (0)
seq2pathway.data (191)
SeqArray (0)
seqArray (1)
seqc (43)
seqCNA.annot (46)
seqinr (16)
seqLogo (1)
seqmagick (3)
seqminer (14)
sequenza (1)
SeqVarTools (0)
seriation (37)
SeruatObject (1)
serumStimulation (37)
servr (7)
sesame (1)
sesameData (1001)
sessioninfo (14)
set (1)
set6 (1)
setRNG (1)
sets (1)
settings (1)
Seurat (63)
seurat (1)
SeuratData (1)
SeuratDisk (1)
SeuratObject (49)
SeuratWrapper (1)
SeuratWrappers (1)
seventyGeneData (60)
sf (45)
SFEData (111)
sfheaders (22)
sfsmisc (4)
sftime (1)
sgeostat (1)
SGP (1)
SGPdata (0)
shadowtext (41)
shape (68)
shapefiles (1)
shapes (0)
shapr (0)
shapviz (0)
SHELF (0)
shinipsum (1)
shiny (337)
shiny.blueprint (2)
shiny.fluent (2)
shiny.react (5)
shiny.router (1)
shiny.semantic (1)
shinyAce (2)
shinyalert (16)
shinyauth (1)
shinyauthr (1)
shinyBS (10)
shinybusy (20)
shinycssloaders (10)
shinydashboard (4)
shinydashboardPlus (17)
shinydisconnect (3)
shinyEffects (1)
shinyEventLogger (1)
shinyFeedback (0)
shinyfeedback (0)
shinyFiles (14)
shinyglide (0)
shinyhelper (6)
ShinyItemAnalysis (7)
shinyjqui (1)
shinyjs (7)
shinyloadtest (1)
shinyLP (2)
shinymanager (4)
shinyMatrix (0)
shinyMethyl (0)
shinyMethylData (71)
shinyMobile (1)
shinypanel (7)
shinyscreenshot (4)
shinySelect (0)
shinystan (1)
shinytest (2)
shinytest2 (21)
shinythemes (2)
shinytoastr (1)
shinyTree (3)
Shinyusagelogr (1)
shinyvalidate (56)
shinyWidgets (124)
ShortRead (1)
showimage (0)
showtext (2)
showtextdb (0)
SIAMCAT (1)
SID (1)
sigaR (0)
sigclust (1)
Sigfried (1)
siggenes (1)
Signac (15)
signac (1)
signal (1)
signatureSearchData (213)
sigPathway (0)
silver3 (1)
SimBenchData (32)
SimComp (1)
SimDesign (2)
simex (0)
SimInf (1)
simmer (1)
SimMultiCorrData (1)
simpar (1)
simpIntLists (102)
simpleaffy (0)
simplermarkdown (1)
simplifyEnrichment (0)
simputation (1)
simr (1)
simresults (1)
simsurv (0)
simul (1)
Single.mTEC.Transcriptomes (36)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellExperiment (13)
SingleCellMultiModal (96)
singleCellTK (0)
SingleMoleculeFootprintingData (50)
SingleR (1)
singscore (0)
sirnakit (1)
SIS (1)
siscreener (1)
sitmo (9)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (12)
skellam (0)
SkewHyperbolic (2)
skewt (1)
skimr (1)
skmeans (1)
skpr (0)
slackr (1)
slam (9)
slickR (0)
slider (19)
slingshot (1)
sloop (0)
slopeR (1)
sm (1)
smacof (1)
SmartEDA (1)
smcfcs (1)
smd (0)
sme (1)
smfishHmrf (1)
smldesign (1)
smokingMouse (43)
smooth (1)
smoother (1)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (8)
sn (14)
sna (3)
SNAData (44)
SNAGEEdata (76)
snakecase (24)
SnapATAC (0)
snapcount (1)
snow (16)
SnowballC (5)
snowfall (2)
snpar (1)
SNPhoodData (51)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (0)
SNPRelate (1)
snpStats (1)
sodium (12)
softImpute (1)
soilDB (1)
soiltexture (1)
solrium (1)
solvebio (1)
som (1)
SomaDataIO (2)
SomatiCAData (37)
SomaticCancerAlterations (92)
SomaticSignatures (1)
SomaVarDB (0)
SOMbrero (1)
sommer (1)
sortable (7)
sos (1)
SoupX (1)
sourcetools (47)
sp (109)
spacefillr (1)
spacetime (3)
spacexr (1)
spacrt (1)
spade (0)
spam (6)
spam64 (1)
spaMM (1)
sparkline (1)
sparklyr (13)
SPARQL (1)
sparr (1)
SparseArray (1)
sparsebn (1)
sparsebnUtils (1)
SparseGrid (1)
SparseM (57)
sparseMatrixStats (2)
sparsepca (1)
sparsesvd (20)
spatial (43)
SpatialCPie (0)
SpatialDatasets (29)
SpatialDecon (1)
spatialDmelxsim (25)
SpatialEpi (1)
SpatialExperiment (1)
spatialLIBD (290)
spatialreg (1)
SpATS (1)
spatstat (5)
spatstat.core (15)
spatstat.data (37)
spatstat.explore (43)
spatstat.geom (49)
spatstat.linnet (5)
spatstat.model (5)
spatstat.random (47)
spatstat.sparse (31)
spatstat.univar (2)
spatstat.utils (37)
spatsurv (1)
spd (1)
spData (15)
spdata (1)
spdep (9)
spec (1)
spectacles (0)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (4)
spgs (1)
SPIA (0)
SpidermiR (0)
SpikeIn (83)
SpikeInSubset (129)
splancs (10)
splatter (0)
spliceR (0)
SplicingVizUtils (1)
splines2 (0)
splitstackshape (1)
splitTools (1)
spls (1)
splus2R (4)
spocc (1)
SPOTlight (1)
spqnData (43)
spsComps (0)
sqldf (1)
SqlRender (1)
SQUAREM (2)
ssanv (1)
SSDM (1)
ssh (2)
SSPA (0)
stable (1)
stabledist (1)
stabs (0)
StanHeaders (20)
stargazer (1)
stars (10)
starter (1)
startup (5)
startupmsg (1)
StatCharrms (1)
statgenGWAS (1)
statgenGxE (1)
statgenHTP (1)
statgenIBD (1)
statgenMPP (1)
statgenSTA (1)
statip (1)
statmod (6)
statnet (0)
statnet.common (2)
statsExpressions (2)
statTarget (0)
STdeconvolve (0)
stdmchecks (1)
stdReg (0)
stemHypoxia (85)
stevedore (1)
STexampleData (292)
sticky (0)
stinepack (4)
stjudem (42)
stopwords (1)
storr (1)
strandannotate (1)
strawr (1)
strex (2)
string (1)
stringdist (23)
stringfish (11)
stringi (402)
stringr (226)
striprtf (0)
strucchange (1)
structToolbox (1)
stxBrain.SeuratData (1)
styler (71)
SubcellularSpatialData (25)
subplex (1)
subselect (1)
SummarizedExperiment (3)
summarytools (1)
sunburstR (0)
superheat (0)
SuperLearner (1)
superpc (1)
SuppDists (2)
supraHex (0)
survAUC (0)
survcomp (1)
surveillance (3)
survex (1)
survey (5)
survival (235)
survivalROC (1)
survminer (3)
survMisc (2)
survMS (1)
survPen (1)
survPresmooth (1)
survtmle (1)
susieR (20)
sva (1)
svd (2)
svDialogs (1)
svglite (37)
svGUI (1)
SVM2CRMdata (37)
svMisc (1)
svUnit (1)
swagger (1)
swamp (1)
swfscMisc (1)
Swiffer (1)
swirl (0)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
sylly (1)
sylly.en (1)
symengine (1)
symphony (1)
synapser (1)
synapterdata (108)
synbreed (1)
syntenet (0)
Synth (1)
sys (113)
sysfonts (2)
systemfit (1)
systemfonts (323)
systemPipeRdata (224)
syuzhet (0)

T

table1 (3)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
TabulaMurisData (67)
TabulaMurisSenisData (80)
tabulapdf (1)
tabulizer (1)
tabulizerjars (1)
TailRank (5)
tanggle (0)
tarchetypes (9)
targets (11)
TargetScoreData (58)
TargetSearchData (68)
tartare (82)
taskscheduleR (1)
TauStar (1)
taxize (1)
taxonomizr (1)
TBX20BamSubset (99)
TCC (3)
TCGAbiolinks (0)
TCGAbiolinksGUI.data (3737)
TCGAbiolinksGul.data (1)
TCGAcrcmiRNA (31)
TCGAcrcmRNA (39)
TCGAMethylation450k (78)
tcgaWGBSData.hg19 (6)
TCGAWorkflowData (111)
tcltk (1)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TeachingDemos (2)
teal (1)
teal.builder.modules (1)
teal.code (2)
teal.data (3)
teal.goshawk (1)
teal.logger (1)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.modules.sanofi (1)
teal.osprey (1)
teal.reporter (1)
teal.slice (2)
teal.transform (1)
teal.widgets (1)
templater (1)
tensor (1)
tensorA (13)
tensorflow (21)
TENxBrainData (115)
TENxBUSData (54)
TENxPBMCData (740)
TENxVisiumData (88)
TENxXeniumData (17)
tergm (0)
tern (3)
tern.gee (3)
tern.mmrm (1)
tern.rbmi (1)
terra (42)
tesseract (1)
tester (1)
testit (1)
testthat (326)
texreg (2)
text2vec (1)
textfeatures (1)
textrecipes (1)
textshape (1)
textshaping (197)
tfautograph (1)
TFBSTools (1)
tfdatasets (1)
TFisher (1)
TFMPvalue (9)
tfrmt (1)
tfruns (16)
tfse (1)
tgp (1)
TH.data (106)
thematic (7)
themeSanofi (1)
themis (0)
this.path (1)
threejs (1)
ThresholdROC (1)
tibbke (1)
tibble (72)
tictoc (11)
tidybayes (1)
tidycensus (17)
tidyclust (1)
tidycmprsk (1)
tidydr (1)
tidyfst (1)
tidygraph (45)
tidyHeatmap (1)
tidylog (1)
tidymodels (17)
tidyposterior (1)
tidypredict (2)
tidyproject (1)
tidyproteomics (1)
tidyquant (1)
tidyr (254)
tidyrules (1)
tidyselect (236)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySummarizedExperiment (0)
tidytable (1)
tidyterra (2)
tidytext (5)
tidytlg (0)
tidytree (56)
tidyTree (0)
tidyverse (23)
tidyvpc (1)
tidyxl (2)
tiff (4)
tigris (19)
tikzDevice (1)
tiledb (1)
tiledbsoma (1)
timechange (178)
timecoursedata (220)
timeDate (44)
TimeProjection (1)
timereg (1)
TimerQuant (30)
timeSeries (10)
timetk (3)
timevis (1)
tinesath1cdf (44)
tinesath1probe (41)
tinkr (0)
tinysnapshot (1)
tinytable (1)
tinytest (1)
tinytex (416)
tippy (1)
tis (1)
tissueTreg (59)
TitanCNA (0)
titanic (1)
tkrplot (1)
tkWidgets (1)
tldrm (1)
TLMoments (1)
tm (5)
tmap (1)
tmaptools (1)
TMB (40)
tmcn (1)
TMExplorer (39)
tmle (2)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (2)
TNO (1)
TNRS (1)
TOAST (1)
toastui (3)
tofsimsData (30)
tokenizers (4)
tokupika (1)
tolerance (0)
toOrdinal (1)
topdownrdata (56)
topGO (1)
topicmodels (1)
topr (4)
torch (1)
tornado (1)
tourr (1)
Tplyr (2)
tracee (1)
trackViewer (1)
tradeSeq (1)
traits (1)
TrajectoryUtils (1)
tram (1)
transformGamPoi (1)
transformr (1)
TransOmicsData (14)
transport (1)
tree (0)
treeio (11)
treemap (2)
treemapify (1)
treesitter.r (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (0)
trendeval (1)
triangle (1)
triebeard (5)
trimcluster (0)
tripack (1)
trtf (1)
truncdist (0)
truncnorm (5)
truncreg (1)
tryCatchLog (1)
TSCAN (0)
tseries (10)
tsfeatures (3)
tsibble (1)
tsibbledata (1)
tsModel (1)
tsne (2)
tsoutliers (1)
TSP (22)
TSSi (0)
tsvio (1)
ttdo (0)
TTR (7)
ttservice (1)
tuberculosis (27)
tufte (1)
TumourMethData (36)
tune (16)
tuneRanger (1)
Turnover.cells.pSILAC.TMT (1)
twang (2)
twangContinuous (1)
tweeDEseqCountData (205)
tweedie (1)
tweenr (42)
twilight (1)
twosamples (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
txdbmaker (1)
tximeta (1)
tximport (1)
tximportDat (0)
tximportData (822)
txtq (1)
tzdb (63)

U

uatools (0)
UCell (1)
uchardet (1)
ucminf (6)
UCSC.utils (1)
udunits2 (1)
ufs (1)
umap (15)
Unicode (1)
unigd (1)
unikn (0)
UniprotR (1)
unitizer (1)
units (49)
unix (1)
unmarked (1)
unrtf (1)
UpSetR (0)
urca (7)
urlchecker (1)
urltools (1)
usdm (1)
usebox (0)
useful (1)
usethis (169)
usmap (1)
usmapdata (1)
utf8 (244)
utilsRmd (1)
utilsStuff (1)
uuid (246)
uwot (111)

V

V8 (54)
validate (1)
valr (1)
VAM (1)
vaplot (0)
variables (1)
variancePartition (1)
VariantAnnotation (1)
VariantToolsData (37)
VariantWarehouseBMS (1)
varImp (1)
vars (1)
vaultr (1)
VBsparsePCA (1)
vcd (4)
vcdExtra (1)
vcfR (2)
vcr (1)
vctrs (280)
vdbR (0)
vdiffr (2)
VectraPolarisData (33)
vegan (26)
vegawidget (1)
vembedr (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (9)
VennDiagram (2)
venneuler (1)
VGAM (19)
VGAMextra (1)
vhydeg (0)
VIM (1)
vimp (1)
VineCopula (1)
vioplot (1)
vip (1)
viper (1)
vipor (21)
viridis (219)
viridislite (0)
viridisLite (93)
visdat (1)
visNetwork (5)
visOmopResults (1)
visR (1)
vistime (31)
vitae (1)
vpc (0)
vroom (165)
vscDebugger (1)
vsn (1)
vulcandata (72)

W

WA43966.shareR.3043877 (1)
waffle (1)
waiter (12)
wakefield (1)
waldo (191)
wallace (1)
warp (18)
wateRmelon (1)
waveslim (1)
waveTilingData (19)
wdm (1)
wdman (2)
weaver (0)
webchem (1)
webdriver (0)
WeberDivechaLCdata (53)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (35)
webshot2 (3)
websocket (11)
webutils (2)
WeightIt (2)
weights (4)
WES.1KG.WUGSC (61)
wesanderson (1)
WGCNA (14)
WGScan (0)
WGSmapp (60)
wheatmap (1)
whereami (0)
whisker (45)
whitening (1)
whoami (1)
WibiR (1)
widgetframe (1)
widgetTools (1)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (4)
wikitaxa (1)
wildmeta (1)
winboxr (1)
withr (350)
wk (52)
wkb (1)
worcs (1)
wordcloud (1)
wordcloud2 (1)
workflowr (1)
workflows (15)
workflowsets (15)
WorldFlora (1)
worrms (2)
wrapr (1)
Wrench (0)
writexl (25)
WriteXLS (5)
wrMisc (1)
WRS2 (2)

X

xairadiffex (1)
xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (0)
xbioc (0)
xcms (1)
xcoredata (43)
xfun (467)
xgboost (115)
xgxr (0)
XhybCasneuf (42)
XIFF (1)
XLConnect (1)
XLConnectJars (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
XML (168)
xml2 (182)
xmlparsedata (1)
xopen (31)
xportr (1)
xpose (0)
xpose.nlmixr2 (0)
xpose4 (0)
xrf (1)
xslt (3)
xtable (4)
xts (33)
XVector (2)

Y

yaImpute (2)
yaml (279)
YAPSA (1)
yardstick (24)
yeastCC (115)
yeastExpData (212)
yeastGSData (36)
yeastNagalakshmi (94)
yeastRNASeq (98)
ymlthis (0)
yri1kgv (18)
yriMulti (8)
yspec (1)
yulab.utils (75)

Z

zCompositions (10)
zeallot (0)
zebrafishRNASeq (221)
zellkonverter (1)
zelusutils (1)
zen4R (1)
zenith (1)
zinbwave (1)
zip (199)
Ziploc (1)
zlibbioc (4)
zoo (37)

Stats generated by https://github.com/Bioconductor/download_stats/