See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor experiment packages

This page was generated on 2025-01-09 08:02:54 -0500 (Thu, 09 Jan 2025).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 15

1TCGAbiolinksGUI.data (4003)
2celldex (3723)
3ALL (3400)
4HSMMSingleCell (2972)
5geneLenDataBase (1934)
6airway (1861)
7scRNAseq (1720)
8pasilla (1004)
9sesameData (976)
10tximportData (801)
11GSVAdata (784)
12ChAMPdata (747)
13TENxPBMCData (694)
14msigdb (669)
15depmap (651)

All experiment packages

All experiment package stats in one file: experiment_pkg_stats.tab

All experiment package download scores in one file: experiment_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor experiment repository (all packages combined)

4

4.10.1 (1)

A

a4Core (0)
a4Reporting (0)
aads.rnai (1)
ABAData (22)
abc (0)
abc.data (1)
ABHgenotypeR (1)
abind (45)
ace.fma (1)
acepack (2)
ACTIONet (1)
ActivePathways (1)
actuar (1)
ada (1)
adabag (0)
AdaptGauss (1)
adbcdrivermanager (1)
addinslist (1)
adductData (65)
ade4 (4)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adehabitat (1)
adehabitatLT (1)
adephylo (1)
ADGofTest (0)
aditools (1)
adjustedCurves (1)
admiral (2)
admiral.test (0)
admiraldev (2)
admiralonco (1)
admiralophtha (1)
admiralroche (1)
admisc (11)
ADMM (0)
adSplit (1)
AER (1)
afex (2)
affxparser (1)
affy (1)
affycompData (88)
affycoretools (1)
affydata (425)
Affyhgu133A2Expr (70)
Affyhgu133aExpr (105)
Affyhgu133Plus2Expr (107)
affyio (1)
AffymetrixDataTestFiles (123)
Affymoe4302Expr (71)
Affymoe430Expr (1)
affyPLM (0)
AGHmatrix (0)
AgiMicroRna (0)
agricolae (10)
agridat (1)
agrmt (1)
AICcmodavg (1)
aigoraFitMini (1)
AIMS (1)
AIPW (0)
airr (1)
airway (1861)
akima (1)
alabama (0)
alakazam (1)
ald (0)
ALDEx2 (1)
aldvmm (1)
alembic (0)
AlgDesign (3)
alkahest.generic (0)
ALL (3400)
all (1)
allenpvc (3)
ALLMLL (188)
alluvial (0)
almanac (0)
alphahull (0)
alphashape3d (0)
alphavantager (1)
alpineData (11)
alr3 (1)
alr4 (0)
alsace (1)
altair (1)
altdoc (1)
amap (1)
AMARETTO (0)
ambient (0)
Amelia (3)
AmesHousing (0)
amgen.okta.client (1)
amgsafetyvis (0)
amlogger (0)
AmpAffyExample (82)
ANCOMBC (1)
ANCOMBCs (1)
AneuFinderData (98)
angrycell (1)
animation (1)
annaffy (1)
anndata (1)
AnnoProbe (1)
annotate (2)
AnnotationDbi (20)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (3)
AnnotationHubData (1)
annotatr (0)
anRichment (0)
antaresProcessing (1)
anticlust (1)
antiProfilesData (90)
AnVIL (0)
anytime (9)
aod (2)
apcluster (1)
APCtools (1)
ape (60)
apeglm (1)
apex (1)
apexcharter (0)
APL (1)
apLCMS (1)
aplot (54)
appgen (1)
aqp (1)
aracne.networks (72)
archive (2)
ArchR (0)
argparse (14)
argparser (1)
argus.DS.Credentials (3)
argusDS.apc.utils (3)
argusDS.backtesting.engine (2)
argusDS.data (3)
argusDS.data.engineering (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (4)
argusDS.data.visualisation (1)
argusDS.database (2)
argusDS.DataValidation (1)
argusDS.DB.manager.utilities (1)
argusDS.distributions (1)
argusDS.driver.importance (2)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.FZ.utils (1)
argusDS.gamboostLSS (1)
argusDS.gamlss.distributions (1)
argusDS.gamlss.forecast (3)
argusDS.gamlss.modelling (3)
argusDS.gamlss.smoothers (1)
argusDS.gamlss.testing (3)
argusDS.gamlss.utils (2)
argusDS.GlobalSettings (1)
argusDS.model.testing (1)
argusDS.model.tools (3)
argusDS.model.validation (1)
argusDS.modeldb (1)
argusDS.possibility.curves.daily (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (3)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.S3 (2)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.signal.backtesting (1)
argusDS.signal.dataprep (2)
argusDS.signal.generation (1)
argusDS.smoothers (1)
argusDS.spread.trading.utils (2)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.studio.ml (1)
argusDS.studio.model.utils (1)
argusDS.Studio.MyStudio (2)
argusDS.Studio.permissions (3)
argusDS.Studio.utils (3)
argusDS.tabulator (3)
argusDS.trading.optimization (1)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.UI (2)
argusDS.utilities (1)
aricode (1)
arm (5)
aroma.affymetrix (8)
aroma.apd (9)
aroma.core (8)
aroma.light (1)
ArrayExpress (1)
arrayhelpers (0)
arrayop (1)
arrayQualityMetrics (0)
ARRmData (83)
arrow (23)
arsenal (1)
arules (3)
arulesViz (1)
ArvadosR (1)
arvupload (1)
ascii (1)
asciicast (1)
ASExtras4 (0)
AsgntDAMacro (1)
ash (5)
AshkenazimSonChr21 (47)
ashr (2)
asht (0)
ASICSdata (64)
AsioHeaders (5)
askpass (174)
ASMap (1)
asremlPlus (1)
assert (0)
assertive (1)
assertive.base (2)
assertive.code (1)
assertive.data (1)
assertive.data.uk (1)
assertive.data.us (1)
assertive.datetimes (1)
assertive.files (1)
assertive.matrices (1)
assertive.models (1)
assertive.numbers (1)
assertive.properties (6)
assertive.reflection (1)
assertive.sets (1)
assertive.strings (1)
assertive.types (6)
assertr (3)
assertthat (2)
AssessORFData (125)
ASSET (0)
AssotesteR (0)
astsa (1)
async (1)
ATACseqQC (1)
ATE (1)
ATR (0)
attachment (3)
attempt (0)
AUC (1)
AUCell (1)
audio (2)
audited (1)
auth0 (1)
automap (3)
autometric (1)
av (1)
ava2 (2)
aws (2)
aws.ec2metadata (0)
aws.s3 (6)
aws.signature (6)
awsMethods (1)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (2)
AzureGraph (5)
AzureRMR (5)
AzureStor (1)

B

b64 (1)
babelgene (6)
babelmixr2 (1)
babelwhale (0)
babynames (0)
backbone (0)
backports (136)
BADER (0)
badger (1)
badminton (1)
baguette (0)
bain (1)
BalancedSampling (0)
ballgown (0)
bambu (0)
BART (0)
bartMachine (0)
bartMachineJARs (0)
base2grob (1)
base64 (4)
base64enc (1)
base64url (1)
basefun (0)
basemaps (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
basilisk.utils (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
battenberg (1)
BayesFactor (2)
BayesFM (1)
bayesm (5)
bayesmeta (0)
bayesplot (12)
BayesPostEst (1)
bayesQR (0)
bayestestR (12)
BayesX (0)
baySeq (2)
BB (1)
BBmisc (1)
bbmle (15)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bccaEndometrial (1)
bcellViper (618)
bcp (1)
BDAtemplates (1)
bdsmatrix (16)
BE (1)
beachmat (2)
beadarray (0)
beadarrayExampleData (249)
BeadArrayUseCases (72)
BeadDataPackR (0)
BeadSorted.Saliva.EPIC (106)
beanplot (1)
beaver (1)
beepr (2)
beeswarm (1)
bench (0)
benchmarkfdrData2019 (37)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (0)
benchr (0)
BentoBoxData (0)
berryFunctions (1)
Bessel (1)
bestglm (1)
bestNormalize (2)
beta7 (66)
betareg (1)
bettermc (1)
bezier (0)
BFpack (1)
BgeeDB (0)
BGLR (1)
bgs.ggtheme (1)
bgs.hephaistos (1)
bgs.hermes (1)
BH (248)
BIApylon (1)
BiasedUrn (12)
BIAutils (1)
bib2df (1)
bibtex (2)
biclust (0)
BIEN (1)
bife (0)
biganalytics (0)
bigassertr (1)
bigD (11)
bigdist (0)
BIGL (0)
biglasso (0)
biglm (4)
biglmm (1)
bigmemory (3)
bigmemory.sri (3)
bigparallelr (0)
bigreadr (1)
bigrquery (14)
bigsnpr (0)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutils (0)
bigutilsr (0)
billboarder (9)
binb (1)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (0)
binman (2)
binom (0)
binr (0)
bio3d (4)
biobank (1)
Biobase (9)
BioBase (1)
bioc::GenomeInfoDbData (0)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (5)
BiocFileCaches (1)
BiocGenerics (15)
BiocInstaller (1)
BiocIO (2)
BiocManager (337)
BiocNeighbors (3)
Bioconductor (1)
BiocParallel (16)
BiocSingular (2)
BiocStyle (1)
BiocVersion (17)
biocViews (1)
BiodiversityR (1)
BioEnricher (1)
Biogenerics (1)
BioGenerics (0)
BioImageDbs (41)
BioInstaller (1)
BioManager (1)
biomaRt (2)
biomartr (1)
biomformat (1)
biomod2 (1)
BioNet (1)
BioPlex (40)
biostat3 (1)
biostatR (0)
biostatUtil (0)
Biostring (1)
Biostrings (16)
biotmleData (67)
biotools (1)
BioVersion (1)
biovizBase (1)
BiplotML (1)
BiRewire (0)
birta (0)
biscuiteerData (73)
bit (109)
bit64 (73)
bitops (112)
bizdays (2)
bkbutils (1)
bladderbatch (494)
BlakerCI (0)
blastula (1)
blavaan (1)
blimaTestingData (71)
blme (7)
blob (56)
blockcluster (1)
blockCV (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (0)
BloodCancerMultiOmics2017 (84)
bluster (1)
BlythStillCasellaCI (1)
BMA (1)
BMisc (0)
bmp (0)
bmspal (1)
bnlearn (2)
bodymapRat (139)
BOIN (0)
bold (1)
bookdown (39)
Boom (1)
boomer (1)
BoomSpikeSlab (1)
boot (91)
bootstrap (0)
botor (0)
box (10)
box.linters (1)
BPCells (1)
bpcp (0)
bRacatus (1)
BradleyTerry2 (0)
brainImageRdata (5)
brave (0)
breakpointRdata (100)
breastCancerMAINZ (128)
breastCancerMKI (0)
breastCancerNKI (125)
breastCancerTRANSBIG (123)
breastCancerUNT (106)
breastCancerUPP (142)
breastCancerVDX (181)
brew (51)
brgedata (106)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (0)
brickster (0)
BridgeDbR (1)
bridgesampling (0)
brio (190)
brms (1)
brmsmargins (0)
Brobdingnag (1)
broman (1)
bronchialIL13 (67)
broom (133)
broom.helpers (18)
broom.mixed (2)
broomExtra (1)
BrowserViz (0)
bs4Dash (10)
BSgenome (3)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (0)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (0)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (0)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (0)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (3)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.major (1)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (0)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (0)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (0)
BSgenome.Oaries.ENSEMBL.RambV2 (1)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (0)
BSgenomes (0)
bshazard (1)
bsicons (3)
bslib (387)
bsplus (1)
bsseq (1)
bsseqData (128)
bsts (1)
btergm (0)
bugphyzz (7)
bumphunter (1)
bupaR (1)
butcher (3)
bvls (0)
BWStest (2)

C

C50 (1)
ca (6)
CAbiNet (1)
cache (0)
cachem (324)
cAIC4 (0)
Cairo (19)
calibrate (1)
callr (279)
callthat (0)
CAM (1)
CAMERA (0)
campsis (0)
campsismod (0)
cancerdata (133)
candisc (1)
canvasXpress (0)
caper (0)
capsidr (1)
captioner (1)
capushe (1)
car (37)
carData (3)
Cardinal (1)
CardinalWorkflows (95)
cards (2)
cardx (1)
caret (24)
caretEnsemble (31)
carrier (0)
CARTools (1)
casebase (1)
castor (2)
castoRedc (1)
CATALYST (1)
catboost (0)
catdata (1)
Category (1)
caTools (26)
CATT (0)
causaldata (0)
CausalGPS (1)
cba (1)
CBDD (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (103)
ccdrAlgorithm (1)
ccDSM (1)
CCl4 (106)
ccTutorial (50)
cdcfluview (1)
cdip.datastore (1)
CDMConnector (1)
celarefData (38)
celda (1)
celldex (3723)
CellMapperData (54)
cellpypes (1)
cellranger (1)
cellxgene.census (1)
cem (0)
censored (1)
censReg (1)
CeTF (0)
ceu1kg (33)
ceu1kgv (24)
ceuhm3 (32)
cffr (1)
cfToolsData (53)
cgam (0)
cgdsr (0)
cgdv17 (31)
CGHbase (1)
CGHcall (1)
cghMCR (0)
ChAMP (0)
ChAMPdata (747)
champdata (0)
chAMPdata (1)
changepoint (11)
chanmetab (1)
charmData (28)
checkmate (259)
checkr (0)
ChemmineOB (0)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
cheung2010 (30)
chevron (1)
ChIC.data (15)
chimera (0)
chimeraviz (0)
ChimpHumanBrainData (62)
ChIPComp (0)
chipenrich (0)
chipenrich.data (147)
ChIPexoQualExample (67)
ChIPpeakAnno (1)
ChIPQC (1)
ChIPseeker (0)
chipseq (0)
chipseqDBData (53)
ChIPseqR (0)
ChIPsim (0)
ChIPXpressData (99)
chk (5)
CHNOSZ (1)
chopsticks (0)
choroplethr (1)
chroGPS (0)
chromDraw (0)
ChromHeatMap (0)
chromote (23)
chromstaRData (97)
chromVAR (2)
chron (4)
cicero (1)
circlesize (0)
circlize (57)
circular (1)
cisPath (0)
CiteFuse (0)
citril (1)
Ckmeans.1d.dp (0)
clarabel (1)
class (38)
ClassDiscovery (0)
classInt (26)
cleanrmd (0)
cleanUpdTSeq (0)
cleaver (0)
cli (392)
cliapp (1)
CLIFF (0)
clinfun (1)
ClinicalQc (0)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clippda (0)
clipper (0)
clipr (10)
cliqueMS (1)
clisymbols (0)
CLL (243)
CLLmethylation (39)
clock (21)
Clomial (0)
Clonality (0)
clonotypeR (0)
clst (0)
clstutils (0)
clubSandwich (1)
clue (57)
CluMSIDdata (63)
cluster (93)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (2)
clustermq (3)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (3)
ClusterProfiler (1)
clusterpval (1)
ClusterR (1)
clusterSim (1)
clusterStab (0)
ClusterTools (1)
clusthaplo (0)
clustifyrdatahub (47)
clustMixType (1)
ClustOfVar (1)
clustree (2)
clv (1)
clValid (1)
CMA (0)
cMap2data (172)
cmapR (1)
CMAverse (1)
cmdstanr (1)
cmocean (1)
CMplot (0)
cmprsk (4)
CmsAnalytics (1)
cn.farms (0)
cn.mops (1)
CNAnorm (0)
CNEr (1)
CNORdt (0)
CNORfeeder (0)
CNORfuzzy (0)
CNORode (0)
CNPBayes (0)
CNTools (0)
cnvGSA (0)
cnvGSAdata (69)
cnvgsadata (0)
CNVPanelizer (0)
CNVrd2 (0)
CNVtools (0)
coastr (1)
cobalt (1)
cobasmsInstrumentCheck (1)
cobasmsInstrumentCheckSSW (1)
cobasmsThemes (1)
cobindR (0)
cobs (1)
CoCiteStats (0)
coda (26)
coda.base (0)
codelink (0)
CodelistGenerator (1)
codetools (97)
CODEX (0)
CoGAPS (0)
cogena (0)
cogeqc (1)
coGPS (0)
COHCAP (0)
COHCAPanno (66)
CohortCharacteristics (1)
CohortDiagnostics (1)
coin (2)
collapse (1)
collections (0)
coloc (18)
colonCA (84)
colorfulVennPlot (0)
colorRamps (11)
colorspace (154)
colortools (0)
coloRz (1)
colourpicker (8)
colourvalues (1)
cols4all (1)
ComBatFamQC (1)
combinat (1)
coMET (0)
commentr (0)
common (1)
CommonJavaJars (0)
commonmark (270)
compareDF (1)
compareGroups (1)
COMPASS (0)
compcodeR (0)
CompGO (0)
ComplexHeatmap (13)
complexheatmap (0)
ComplexUpset (1)
compositions (3)
CompQuadForm (0)
CompToxTools (1)
compute.es (0)
concaveman (0)
concordancer (1)
concrete (1)
condiments (1)
conditionz (0)
condMVNorm (0)
coneproj (1)
conf.design (0)
CONFESSdata (58)
config (23)
configr (1)
confintr (1)
conflicted (12)
confoundr (1)
connectapi (2)
ConnectivityMap (80)
connectwidgets (0)
conos (1)
conquer (2)
ConsensusClusterPlus (0)
consensusClustR (1)
consort (1)
ConsRank (0)
constructive (1)
contentid (2)
contfrac (1)
contingencytables (1)
conumee (1)
convert (0)
coop (0)
CoordinateCleaner (1)
copa (0)
COPDSexualDimorphism.data (72)
copula (3)
CopyhelpeR (82)
CopyNeutralIMA (42)
copynumber (1)
CopyNumber450k (0)
CopyNumber450kData (19)
CopywriteR (0)
coRanking (1)
CoRegNet (1)
Cormotif (0)
CorMut (0)
coRNAi (0)
corncob (1)
coro (1)
corpcor (3)
corpora (0)
correlation (5)
CORREP (0)
corrplot (38)
corrr (0)
COSG (0)
CoSIAdata (22)
COSMIC.67 (106)
cosmiq (0)
cosmosR (0)
COSNet (0)
countrycode (7)
coveffectsplot (0)
covr (10)
covRNA (0)
cowplot (116)
coxme (1)
coxphf (1)
CoxPhLb (1)
coxphw (1)
cplm (1)
cpm (0)
cpp11 (268)
cpvSNP (0)
cqn (1)
cranlogs (0)
crayon (199)
crch (1)
CRCL18 (47)
creatr (0)
credentials (64)
crew (4)
crew.cluster (1)
CRImage (0)
CRISPR.shinyapp (0)
crisprScoreData (161)
crlmm (0)
crmPack (1)
cronR (1)
crop (0)
crossdes (1)
crossmatch (1)
crosstable (1)
crosstalk (118)
crrri (0)
crrry (0)
crs (1)
crul (107)
csaw (0)
CSSP (0)
csv (0)
ctc (0)
ctsem (1)
cubature (2)
cubelyr (0)
Cubist (1)
cummeRbund (0)
curatedAdipoArray (34)
curatedAdipoChIP (37)
curatedAdipoRNA (37)
curatedBladderData (105)
curatedBreastData (127)
curatedCRCData (44)
curatedMetagenomicData (308)
curatedOvarianData (286)
curatedPCaData (28)
curatedTBData (38)
curatedTCGAData (478)
curl (458)
customProDB (0)
cutoff (1)
cvar (0)
cvAUC (1)
cvms (1)
CVST (1)
cvTools (1)
CVXR (3)
cxAnalysis (0)
cycle (0)
cyclocomp (18)
cydar (1)
cyphr (1)
cytofkit (1)
cytolib (1)
CytoMethIC (30)
CytoML (1)
CytoTRACE (1)
Cytotree (1)
CytoTree (1)

D

D2C (1)
d3heatmap (1)
d3r (1)
d3treeR (1)
DAAG (1)
daapr (1)
dada2 (0)
dae (1)
daff (1)
dagitty (1)
dagLogo (0)
DAISIE (0)
DALEX (1)
DALEX2 (1)
daMA (0)
DAMEfinder (1)
DAPAR (0)
DAPARdata (135)
dapr (1)
DARAtools (1)
DART (0)
DASiR (0)
dasnormalize.iomel (0)
dastools (0)
data.table (415)
data.tree (10)
DatabaseConnector (1)
dataCompareR (1)
datacutr (1)
DataEditR (1)
DataExplorer (1)
DataFerry (1)
dataframes2xls (1)
dataMaid (1)
datamods (17)
DataOmnio (0)
datapasta (1)
datapipeline (0)
dataRetrieval (1)
datasauRus (1)
DataVisualizations (1)
datawizard (16)
date (1)
DAVIDQuery (0)
davidTiling (66)
dbaccess (1)
dbarts (3)
DBChIP (0)
DBI (387)
DBItest (1)
dblplyr (1)
dblypr (1)
dbplyr (233)
dbscan (7)
dbx (5)
dcat (1)
DCchoice (0)
dcdatr (0)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
ddCt (0)
ddgraph (0)
ddpcr (1)
DDRTree (1)
debugme (3)
DECIPHER (1)
deconfectHelpers (1)
DeconRNASeq (0)
deconstructSigs (1)
decontam (0)
decontX (1)
decor (0)
decoupleR (1)
decoupler (1)
DEDS (0)
Deducer (0)
deEndometrial (1)
deepregression (0)
deepSNV (0)
deeptime (1)
DEGraph (0)
degreenet (1)
DEGseq (1)
Delaporte (1)
DelayedArray (6)
DelayedMatrixStats (13)
deldir (55)
demuxmix (1)
dendextend (41)
dendroextras (1)
DendSer (0)
dendsort (0)
densEstBayes (8)
densityClust (1)
densvis (1)
DEoptim (0)
DEoptimR (26)
DEP (1)
depmap (651)
derfinder (0)
derfinderData (113)
derfinderHelper (0)
Deriv (9)
desc (112)
descr (1)
descsuppR (0)
DescTools (16)
DESeq (0)
DESeq2 (6)
designmatch (1)
DEsingle (1)
deSolve (9)
DeSousa2013 (65)
destiny (1)
devEMF (1)
devtools (20)
devutils (1)
DExMAdata (62)
DEXSeq (0)
dexus (0)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DFP (0)
DHARMa (0)
diagram (1)
DiagrammeR (4)
DiagrammeRsvg (0)
dials (18)
DiceDesign (15)
DiceKriging (0)
diceR (1)
dichromat (5)
did (0)
DiffBind (1)
diffdf (1)
diffGeneAnalysis (0)
diffHic (0)
DiffLogo (0)
diffloop (0)
diffloopdata (45)
diffobj (3)
diffviewer (1)
digest (476)
diggit (0)
diggitdata (66)
digitalDLSorteR (1)
dimRed (1)
Dino (1)
diptest (4)
dir.expiry (1)
directlabels (4)
DirichletMultinomial (1)
discretecdAlgorithm (1)
DiscriMiner (1)
disk.frame (0)
dismo (1)
distances (1)
distill (1)
distory (1)
distr (1)
distr6 (1)
distributional (17)
distributions3 (1)
DistributionUtils (2)
distro (0)
dittodb (0)
dittoSeq (1)
DiurnalMRI (1)
dixon (1)
dks (0)
DLBCL (136)
dlm (1)
dlookr (1)
dlstats (0)
dm (1)
DmelSGI (67)
DMRcaller (0)
DMRcate (1)
DMRcatedata (301)
DMRforPairs (0)
DMwR (1)
DNABarcodes (1)
DNAcopy (1)
DNAZooData (50)
dnet (1)
do (1)
DO.db (1)
doBy (9)
dockerfiler (1)
docopt (6)
DoE.base (0)
DoEstRare (0)
doFuture (1)
domainsignatures (0)
doMC (2)
domir (1)
doMPI (1)
DonaPLLP2013 (59)
donapllp2013 (0)
doParallel (5)
DOQTL (0)
doRedis (0)
doRNG (5)
dorothea (610)
DOSE (2)
Dose (0)
DoseFinding (1)
doseR (1)
doSNOW (1)
dotCall64 (15)
dotwhisker (1)
DoubleML (1)
DoubletFinder (1)
downlit (115)
downloader (1)
downloadthis (1)
dowser (1)
dparser (0)
dpbuild (1)
dpdeploy (1)
dpi (1)
dplyr (175)
dplyr1 (1)
dplyr12 (1)
dplyrb (0)
dpplyr (1)
dqrng (66)
drake (5)
drat (1)
drc (1)
drda (1)
DRDID (0)
dream (0)
DREAM4 (27)
dreamerr (0)
dressCheck (77)
drgee (0)
DriverNet (0)
DropletTestFiles (167)
DropletUtils (2)
DRR (1)
drugfindR (1)
DrugVsDisease (0)
DrugVsDiseasedata (147)
ds4psy (1)
dsb (1)
dslabs (1)
dspNgs (0)
dsQTL (29)
dsr (3)
DSS (0)
DT (174)
DTA (0)
dtplyr (26)
dttr2 (0)
dtw (1)
dtwclust (2)
dualKS (0)
duckdb (8)
duct.tape (1)
dunlin (1)
dunn.test (1)
DuoClustering2018 (98)
DupChecker (0)
dupRadar (0)
dv.teal (1)
DvDdata (67)
dwrPlus (1)
dyebias (0)
dyebiasexamples (82)
dygraphs (0)
dynamicTreeCut (1)
dynamite (1)
DynDoc (0)
dynfeature (0)
dynlm (0)
dynplot (0)
dynpred (0)
dynsbm (1)
DynTxRegime (1)
dynwrap (0)

E

e1071 (102)
eaf (1)
earth (3)
easierData (128)
easy.utils (1)
easyalluvial (1)
easyENTIM (1)
easypackages (1)
EasyqpcR (0)
easystats (3)
eatGADS (2)
EatonEtAlChIPseq (69)
eatTools (2)
ebal (0)
EBarrays (0)
EBcoexpress (0)
EBImage (1)
EBSeq (0)
EBSeqHMM (0)
Ecdat (0)
ecfc (1)
Ecfun (0)
echarts4r (5)
ecodist (1)
ecoliLeucine (82)
ecolitk (0)
ECOSolveR (1)
ecospat (1)
Ecume (1)
EDDA (0)
edge (0)
edgeR (11)
EffectLiteR (2)
effects (0)
effectsize (9)
egg (6)
egor (1)
EGSEAdata (231)
eha (1)
eisa (0)
elasticsearchr (1)
ELBOW (0)
elevatr (2)
ellipse (17)
ellipsis (10)
elliptic (1)
ELMER (1)
ELMER.data (209)
EMAtools (1)
emayili (2)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (11)
emdist (0)
EMDomics (0)
emmeans (66)
EMMREML (1)
emoa (1)
emstreeR (1)
emtdata (40)
emulator (0)
enc (0)
encode (0)
ENCODEFig4Band4D (2)
encoDnaseI (27)
encryptr (0)
energy (2)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (0)
english (0)
enhancedvolcano (0)
EnhancedVolcano (1)
enmSdmX (1)
ENMTools (1)
EnrichedHeatmap (1)
enrichplot (2)
enrichPlot (1)
enrichR (2)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (0)
EnsDb.Hsapiens.v86 (1)
ensembldb (4)
ensemblVEP (0)
ensurer (1)
entropy (1)
envalysis (1)
ENVISIONQuery (0)
EnvStats (3)
eoPredData (6)
Epi (3)
EpiDISH (1)
epigenomix (0)
EpiMix.data (60)
epimutacionsData (71)
EpiNow2 (3)
EpipwR.data (8)
epiR (3)
EpiStats (0)
epitools (0)
epuRate (1)
eq5d (1)
equatags (1)
equate (0)
equivalence (0)
erccdashboard (0)
ergm (1)
ergm.multi (1)
erify (0)
erma (0)
errorlocate (1)
escape (1)
eset (1)
ESNSTCC (0)
esquisse (16)
estimability (34)
estimate (1)
estimatr (1)
estmeansd (0)
estrogen (124)
etec16s (38)
etm (1)
eudysbiome (0)
eulerr (2)
EuPathDB (1)
europepmc (1)
evaluate (433)
EValue (3)
evd (4)
eventdataR (1)
eventPrediction (1)
eventTrack (0)
ewceData (240)
ewfutils (0)
Exact (4)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactextractr (0)
exactRankTests (1)
exams (1)
excelR (1)
ExiMiR (0)
exomeCopy (0)
ExomeDepth (0)
ExperimentHub (1)
ExperimentHubData (1)
expint (0)
explorase (0)
explore (1)
ExploreModelMatrix (0)
ExplorOMICS (1)
expm (19)
ExpressionView (0)
expss (2)
extraChIPs (0)
extraDistr (8)
extrafont (2)
extrafontdb (1)
extraInserts (0)
extraoperators (1)
extraTrees (0)
extRemes (1)

F

faahKO (315)
fabia (0)
fabiaData (59)
fable (1)
fabletools (4)
facopy.annot (16)
facsDorit (32)
factDesign (0)
factoextra (6)
FactoInvestigate (0)
FactoMineR (18)
Factoshiny (0)
fairhub.metadata (1)
fairhub.r.client (1)
fakepackage (0)
fame (1)
fANCOVA (4)
fansi (199)
FANTOM3and4CAGE (75)
faraway (0)
farms (0)
farver (184)
fastcluster (8)
fastDummies (18)
fasterize (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (44)
fastmap (227)
fastmatch (22)
fastmatrix (1)
fastqcr (1)
fastreeR (0)
fastseg (1)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (1)
faux (1)
fauxpas (0)
fBasics (5)
FCBF (1)
fCI (0)
FD (0)
fda (12)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (0)
fdrame (0)
fdrtool (8)
fds (5)
feasts (4)
feather (1)
feature (6)
FedData (0)
feisr (0)
FEM (0)
fenr (0)
fExtremes (10)
ff (5)
FField (1)
ffpe (0)
ffpeExampleData (77)
fftw (2)
fftwtools (1)
fGarch (9)
FGNet (0)
fgsea (1)
fhcmacro (1)
fibroEset (120)
fido (1)
FieldEffectCrc (35)
fields (9)
filehash (1)
filelock (86)
filesstrings (1)
finalfit (1)
FindMyFriends (0)
findpython (13)
fineimp (1)
FineR (1)
finetune (1)
fingerprint (0)
FIs (72)
FISHalyseR (0)
fission (226)
fit.models (1)
fitdistrplus (30)
fixest (1)
flagme (0)
flair (0)
flare (1)
flashClust (1)
Fletcher2013a (109)
Fletcher2013b (98)
flexclust (3)
flexdashboard (2)
flexmix (2)
flexsurv (1)
flexsurvcure (0)
flextable (26)
flipflop (0)
float (2)
flock (0)
flowAI (0)
flowBeads (0)
flowBin (0)
flowcatchR (0)
flowchart (1)
flowCHIC (0)
flowCL (0)
flowClean (0)
flowClust (1)
flowCore (1)
FlowCore (0)
flowCyBar (0)
flowDensity (0)
flower (1)
flowFit (0)
flowFitExampleData (23)
flowFP (0)
flowMap (0)
flowMatch (0)
flowMeans (0)
flowMerge (0)
flowPeaks (0)
flowPloidyData (64)
flowPlots (0)
flowQB (0)
flowQBData (5)
FlowRepositoryR (0)
FlowSOM (0)
FlowSorted.Blood.450k (316)
FlowSorted.Blood.EPIC (215)
FlowSorted.CordBlood.450k (62)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (65)
FlowSorted.CordBloodNorway.450k (47)
FlowSorted.DLPFC.450k (98)
flowStats (0)
flowTrans (0)
flowType (0)
flowUtils (0)
flowViz (0)
flowVS (0)
flowWorkspace (0)
flowWorkspaceData (191)
flux (1)
fma (1)
fmcsR (0)
FME (0)
fmeffects (1)
fmsb (1)
FMStable (0)
fmtr (1)
FNN (179)
focalCall (0)
foghorn (1)
fontawesome (114)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (0)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (22)
foreach (8)
forecast (9)
foreign (62)
forestmodel (1)
forestplot (1)
forestploter (1)
forge (1)
fork (1)
formatR (39)
formattable (1)
formatters (7)
Formula (15)
formula.tools (1)
forrester.metadata (0)
fortunes (0)
FourCSeq (0)
fourDNData (50)
fpc (81)
fpp2 (1)
fpp3 (1)
fracdiff (5)
FragPipeAnalystR (0)
frailtypack (3)
FRASER (1)
freetypeharfbuzz (1)
fresh (15)
FrF2 (0)
FRGEpistasis (0)
frictionless (1)
frma (0)
frmaExampleData (88)
frmaTools (0)
fs (252)
FSA (1)
FSelectorRcpp (1)
fst (1)
fstcore (1)
ftExtra (1)
fTrading (0)
fucci (0)
FunciSNP (0)
FunciSNP.data (30)
fungible (1)
fUnitRoots (2)
funkyheatmap (1)
funModeling (1)
furniture (1)
furrowSeg (47)
furrr (13)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (229)
future.apply (206)
future.batchtools (1)
future.callr (3)
fuzzyjoin (0)
fuzzySim (1)
fwb (0)

G

g3viz (1)
GA (114)
gaga (0)
gage (0)
gageData (298)
gaggle (0)
gaia (0)
gam (13)
GAMBLR.results (1)
GAMBoost (1)
gamboostLSS (2)
gameofthrones (1)
gamlss (4)
gamlss.add (2)
gamlss.data (3)
gamlss.dist (4)
gamm4 (0)
gap (1)
gap.datasets (0)
gapminder (0)
gargle (42)
gaschYHS (60)
gaston (1)
GastrographPackage (1)
gatingMLData (33)
gaucho (0)
gausscov (1)
gbm (116)
gbRd (1)
gbutils (0)
gcatest (0)
gclus (1)
gCMAP (0)
gCMAPWeb (0)
gcrma (1)
gcspikelite (107)
gdata (32)
gdm (3)
gDNAinRNAseqData (67)
gDRtestData (80)
gdsfmt (1)
gdsx (1)
gdtools (124)
gee (2)
geeasy (3)
geecc (0)
geepack (12)
geigen (0)
gemini (1)
gemma.R (0)
gemtc (0)
GenABEL (1)
GenABEL.data (1)
genArise (0)
GENE.E (0)
GeneAnswers (0)
GeneBreak (0)
GeneExpressionSignature (0)
genefilter (2)
genefu (0)
genekitr (1)
geneLenDataBase (1934)
genelendatabase (1)
GeneMeta (0)
GeneNetworkBuilder (0)
GeneNMF (1)
GeneOverlap (1)
geneplotter (1)
GeneralizedHyperbolic (2)
geneRecommender (0)
GeneRegionScan (0)
generics (22)
geneRxCluster (0)
GeneSelectMMD (0)
GeneSelector (0)
GENESIS (0)
geNetClassifier (0)
genetics (1)
GeneticsDesign (0)
GeneticsPed (0)
GENIE3 (0)
genoCN (0)
genomationData (115)
GenomeGraphs (0)
GenomeInfoDb (19)
GenomeInfoDbData (5)
genomeinfodbdata (1)
genomeIntervals (0)
GenomicAlignments (4)
GenomicDistributionsData (82)
GenomicFeatures (14)
GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18 (4)
GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9 (4)
GenomicFiles (0)
GenomicRanges (5)
GenomicTools (0)
GenomicTuples (0)
Genominator (0)
GenOrd (1)
genoset (1)
genotypeeval (0)
GenoView (0)
GenSA (3)
geobr (1)
geodata (4)
geodiv (1)
geohashTools (0)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonlint (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (8)
GEOmetadb (0)
geometries (23)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (0)
GEOquery (1)
geoR (0)
geos (0)
geosphere (11)
GEOsubmission (0)
GeoTcgaData (1)
gert (122)
gespeR (0)
gestalt (4)
gestate (0)
getip (2)
getopt (14)
GetoptLong (4)
getPass (4)
gettz (0)
GeuvadisTranscriptExpr (67)
geuvPack (17)
geuvStore (11)
geuvStore2 (9)
GEWIST (0)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (26)
ggalt (1)
gganimate (1)
GGBase (0)
ggbeeswarm (5)
ggbio (1)
ggbiploti (1)
ggbreak (0)
ggchicklet (1)
ggcorrplot (2)
ggdag (1)
GGdata (35)
ggdendro (18)
ggdensity (1)
ggdist (7)
gge (1)
ggeasy (1)
ggedit (1)
ggeffects (3)
ggExtra (6)
ggfittext (2)
ggforce (47)
ggformula (20)
ggfortify (3)
ggfun (81)
gggenes (1)
ggh4x (5)
gghalves (0)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (11)
ggiraphExtra (1)
gglm (1)
ggm (1)
ggmap (5)
ggmosaic (1)
ggmsa (1)
ggnetwork (2)
ggnewscale (69)
ggnewscales (0)
gGnome (1)
ggokabeito (0)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot.multistats (1)
ggplot2 (375)
ggplot2movies (0)
ggplotify (24)
ggpmisc (5)
ggPMX (1)
ggpointdensity (6)
ggpp (6)
ggprism (3)
ggpubr (23)
ggRandomForests (0)
ggrap2 (1)
ggraph (36)
ggrastr (9)
ggrepel (291)
ggridges (47)
ggsci (69)
ggseqlogo (17)
ggside (6)
ggsignif (10)
ggspatial (1)
ggstance (3)
ggstats (13)
ggstatsplot (3)
ggsurvfir (0)
ggsurvfit (3)
ggtern (84)
ggtext (4)
ggthemes (16)
ggtree (13)
ggtreeDendro (0)
ggtreeExtra (1)
ggtut (29)
ggupset (2)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (3)
ggvis (1)
ggwordcloud (1)
gh (140)
ghpm (1)
ghql (0)
gifski (0)
GIGSEAdata (35)
gimme (1)
Giotto (0)
git2r (23)
gitcreds (19)
gitlabr (1)
gittargets (1)
GLAD (0)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
Glimma (1)
glmGamPoi (2)
glmGamPoiR (1)
GLMMadaptive (0)
glmmADMB (0)
glmmML (1)
glmmTMB (4)
glmnet (22)
glmnetUtils (10)
glmperm (1)
glmx (1)
GlobalAncova (0)
GlobalOptions (2)
globals (74)
globals, (0)
globaltest (0)
glpkAPI (0)
glue (237)
gmailr (2)
gMCP (0)
GMD (0)
Gmisc (1)
gmm (2)
gmnl (0)
gmodels (1)
gmp (19)
gmthemes (1)
gnm (1)
GO.db (3)
godm (1)
godmode (1)
goftest (2)
GOFunction (0)
golem (11)
golubEsets (268)
golubesets (0)
gongs (1)
goodpractice (1)
googleAuthR (3)
googleCloudStorageR (0)
googledrive (31)
googlesheets (1)
googlesheets4 (35)
googleVis (1)
GOSemSim (2)
GoSemSim (1)
goseq (0)
goshawk (1)
GOstats (1)
gotop (1)
gower (17)
gp.version (1)
gpaExample (48)
GPArotation (6)
GPfit (1)
gplots (164)
gprofiler2 (3)
grafify (2)
gRain (1)
gralarkivar (1)
granny (1)
graper (1)
graph (1)
GraphGallery (1)
graphiQs (1)
graphite (1)
graphlayouts (65)
graphql (1)
graphsim (1)
grateful (2)
grates (3)
gratia (1)
gRbase (1)
greekLetters (1)
Greg (0)
greybox (0)
grf (0)
grid (1)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridpattern (2)
gridSVG (1)
gridtext (3)
grImport (1)
grImport2 (1)
grndata (69)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
GSA (1)
gsbDesign (0)
GSBenchMark (98)
gscounts (0)
gscreend (1)
gsDesign (1)
GSE103322 (44)
GSE13015 (41)
GSE159526 (34)
GSE62944 (80)
GSEABase (1)
GSEAbase (1)
gsignal (1)
gskb (16)
gsl (3)
gsmoothr (5)
gson (6)
gsrc (0)
gss (6)
gstat (2)
gsubfn (1)
GSVA (1)
GSVAdata (784)
gt (44)
gtable (245)
GTAVTools (1)
gtExtras (1)
gto (0)
gtools (50)
gtreg (1)
gtrellis (1)
gtsummary (4)
gtx (0)
gubraqsar (0)
GUniFrac (1)
gupio (1)
Gviz (2)
gwascat (1)
GWASdata (112)
GWASExactHW (6)
gwasrapidd (1)
GWASTools (0)
gwasvcf (1)
GWENA (0)
gWidgets (0)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (0)

H

h2o (4)
h5vcData (143)
HAC (0)
hahmmr (1)
hal9001 (0)
HandTill2001 (1)
haplo.stats (1)
HaploSim (0)
haplotrackR (1)
hapmap100khind (63)
hapmap100kxba (93)
hapmap500knsp (71)
hapmap500ksty (76)
hapmapsnp5 (205)
hapmapsnp6 (230)
harbChIP (69)
hardhat (57)
HardyWeinberg (0)
HarmanData (57)
HarmonizedTCGAData (41)
harmony (9)
hash (1)
haven (83)
HCAData (90)
HCATonsilData (56)
HD2013SGI (86)
HDCytoData (271)
HDF5 (1)
hdf5 (1)
HDF5Array (11)
hdf5r (16)
hdf5r.Extra (1)
hdi (0)
HDInterval (11)
HDLSSkST (1)
HDmap (1)
hdnom (1)
HDO.db (1)
hdrcde (5)
healthyControlsPresenceChecker (31)
healthyFlowData (75)
heatmap.plus (1)
heatmaply (18)
HEEBOdata (73)
heemod (0)
HelloRangesData (95)
heplots (1)
here (2)
heritability (1)
Herper (0)
hetGP (1)
hexbin (25)
hexSticker (0)
hexView (0)
HGNChelper (3)
hgu133a.db (1)
hgu133abarcodevecs (51)
hgu133afrmavecs (8)
hgu133plus2.db (1)
hgu133plus2barcodevecs (49)
hgu133plus2CellScore (54)
hgu133plus2frmavecs (4)
hgu2beta7 (52)
hgu95a.db (0)
hgu95av2.db (1)
HiBED (30)
HiCBricks (0)
HiCDataHumanIMR90 (78)
HiCDataLymphoblast (70)
HiClimR (0)
HiContactsData (103)
hierfstat (0)
highcharter (1)
highlight (0)
HighlyReplicatedRNASeq (34)
highr (171)
highs (0)
Hiiragi2013 (137)
HilbertCurve (1)
HilbertVis (1)
HiTC (1)
HiTME (1)
HIVcDNAvantWout03 (53)
HiveR (1)
Hmisc (47)
HMMcopy (1)
HMP16SData (56)
HMP2Data (54)
hms (49)
hmyriB36 (32)
hoardr (2)
Homo.sapiens (0)
homosapienDEE2CellScore (23)
Hoover (1)
hopach (0)
Hotgenes (1)
howmany (1)
HPC.R.Utilities (1)
hpgltools (1)
hrbrthemes (3)
HSAUR2 (0)
HSAUR3 (1)
hsm (0)
HSMMSinglece11 (0)
HSMMSinglecel1 (0)
HSMMSingleCell (2972)
htmlTable (40)
htmltools (357)
htmlwidgets (157)
HTqPCR (0)
HTSCluster (1)
httpcode (1)
httpgd (2)
httptest (4)
httptest2 (1)
httput (0)
httpuv (347)
httr (109)
httr2 (163)
huge (0)
hugene10sttranscriptcluster.db (1)
HumanAffyData (51)
humanHippocampus2024 (1)
HumanPrimaryCellAtlasData (1)
humanStemCell (181)
hunspell (37)
huxtable (4)
hwriter (3)
hydroPSO (1)
hypergate (1)
hypergeo (1)
hyperSpec (1)
hypred (1)

I

IAPWS95 (0)
iatlas.app (0)
iatlasGraphQLClient (1)
iBreakDown (1)
iC10 (1)
iC10data (1)
iC10TrainingData (1)
ica (4)
ICC (1)
icenReg (0)
Icens (0)
ichorCNA (1)
iCiteR (3)
ICS (0)
ICSNP (0)
ICSOutlier (0)
IDEAFilter (1)
idorsiaQC (1)
IDPmisc (5)
idr (0)
ids (1)
ifnb.SeuratData (0)
iGasso (0)
igraph (212)
igraphdata (0)
igvShiny (1)
iheatmapr (3)
IHW (1)
IHWpaper (59)
ijtiff (1)
Illumina450ProbeVariants.db (625)
IlluminaDataTestFiles (119)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (4)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (1)
illuminaio (1)
imager (1)
imbalance (0)
imcdatasets (86)
imcRtools (0)
iml (1)
immunarch (1)
implyr (1)
impmap (1)
import (3)
ImpulseDE2 (0)
impute (1)
imputeLCMD (0)
imputeTS (0)
IncDTW (0)
incidence (3)
incidence2 (3)
IncidencePrevalence (1)
ind1KG (28)
iNEXT (1)
infer (15)
infercnv (1)
inferCNV (1)
influenceR (1)
InformationValue (1)
infotheo (1)
ingredients (1)
ini (1)
initiate.archr (1)
InkblotAnalytics (4)
INLA (0)
inline (2)
inlinedocs (0)
InraeThemes (1)
insight (20)
installr (1)
intamap (1)
intansv (0)
interactions (1)
InteractionSet (1)
InteractiveComplexHeatmap (1)
interactiveDisplayBase (1)
interactomes (1)
intergraph (1)
interp (17)
interval (0)
intervals (7)
inum (3)
invgamma (0)
iontreeData (20)
iotools (1)
ipaddress (0)
IPCAPS (1)
ipcwswitch (0)
IPDfromKM (0)
ipred (33)
ips (3)
iptmnetr (1)
ipw (1)
iq (0)
IRanges (18)
IRdisplay (1)
IRkernel (1)
irlba (19)
irr (1)
iSEE (1)
ISLR (1)
Iso (0)
isoband (43)
ISOcodes (2)
IsoCorrectoR (1)
IsoCorrectoRGUI (1)
isva (5)
ISwR (0)
ITALICSData (85)
iterators (8)
itertools (1)
ITKR (1)
itsadug (0)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)
Iyer517 (59)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (4)
janitor (4)
JASPAR2014 (130)
JASPAR2016 (151)
JavaGD (0)
JazzAIR (1)
JBrowseR (1)
jcolors (1)
JctSeqData (9)
jctseqdata (0)
JGR (0)
jJava (1)
JM (0)
JMbayes (1)
jnjtemplates (1)
job (2)
Johnson (1)
JohnsonKinaseData (25)
joineRML (0)
jomo (1)
jonasrscripts (1)
jose (2)
jpeg (15)
jqr (5)
jquerylib (2)
js (0)
jskm (1)
jsonify (1)
jsonlite (257)
jsonvalidate (1)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (0)
JuliaCall (0)

K

kableExtra (27)
kangar00 (0)
KaryoploteR (0)
karyoploteR (1)
katex (1)
KEGG.db (1)
KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO (102)
KEGGdzPathwaysGEO (377)
KEGGgraph (1)
keggorthology (0)
KEGGprofile (0)
KEGGREST (8)
keggsvg (0)
Kendall (1)
keras (5)
KernelKnn (0)
kernlab (47)
KernSmooth (82)
Kernsmooth (1)
keyring (5)
KFAS (0)
khroma (1)
kidpack (61)
kinship2 (3)
kit (1)
kknn (0)
klaR (4)
km.ci (1)
kmed (0)
kml (0)
kml3d (0)
kmlShape (1)
KMsurv (0)
knitr (314)
knitrdata (0)
knockoff (0)
KOdata (84)
kohonen (1)
kpmt (0)
kriging (0)
KRSA (1)
ks (9)
kSamples (2)
ktplots (0)
kutils (1)
kyotil (1)

L

L1pack (1)
l2p (1)
labdsv (0)
labeling (125)
labelled (19)
laeken (3)
Lahman (1)
lambda.r (2)
lambdr (0)
LambertW (3)
lamW (3)
landscapemetrics (1)
languageserver (1)
LaplacesDemon (1)
lares (1)
lars (0)
lasso2 (1)
lastdose (1)
latentnet (1)
later (176)
latex2exp (1)
lattice (192)
latticeExtra (9)
lava (54)
lavaan (18)
lavaanPlot (1)
lavaSearch2 (0)
lazy (1)
lazyeval (2)
lbaQcCheck (1)
LBE (1)
lbfgs (0)
lbfgsb3c (1)
lcopula (0)
lda (1)
ldap (0)
LDheatmap (1)
LDlinkR (0)
LDplots (0)
LEA (0)
leadfindingreport (1)
leafem (1)
leaflegend (3)
leaflet (9)
leaflet.extras (3)
leaflet.minicharts (0)
leaflet.providers (2)
leafpop (1)
leafsync (1)
leaps (10)
LearnBayes (0)
learnr (6)
leeBamViews (103)
LegATo (6)
leiden (26)
leidenAlg (1)
leidenbase (14)
lemon (2)
leukemiasEset (164)
leukemiaseset (1)
lfa (0)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (16)
liana (1)
libcoin (4)
libgeos (0)
LiblineaR (11)
libr (1)
LiebermanAidenHiC2009 (57)
lifecycle (185)
liftOver (1)
liger (2)
lightgbm (2)
lime (1)
limma (26)
limmaGUI (0)
limmia (0)
limSolve (1)
LinMod2 (1)
Linnorm (0)
linprog (1)
lintr (113)
lisrelToR (1)
listenv (72)
ListerEtAlBSseq (57)
listviewer (1)
littler (1)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lm.beta (1)
lme4 (130)
lmerTest (2)
LMI (1)
LMMsolver (1)
lmodel2 (0)
lmom (10)
lmomco (1)
Lmoments (1)
lmtest (5)
lobstr (3)
locfit (110)
lockfit (1)
loe (1)
log4r (6)
logcondens (0)
logger (25)
logging (1)
LogicReg (1)
logistf (11)
logitnorm (1)
logitr (1)
logr (1)
logrrr (1)
logrx (1)
logspline (1)
lokern (1)
LOLA (1)
lomb (1)
longComplexHeatmap (1)
longitudinalData (0)
longmemo (1)
loo (17)
LoomExperiment (0)
lotri (0)
LowRankQP (1)
lpridge (1)
lpSolve (13)
lpSolveAPI (2)
lpsymphony (1)
lqmm (0)
LRcellTypeMarkers (47)
lsa (7)
lsei (1)
lsmeans (0)
lubridate (87)
lumi (1)
lumiBarnes (89)
Luminescence (1)
LungCancerACvsSCCGEO (78)
LungCancerLines (97)
lungExpression (96)
lvec (0)
lwgeom (5)
lydata (160)
lymphoma (2)

M

m03modeldevelopment (0)
M3DExampleData (164)
M3Drop (0)
Maaslin2 (0)
maboost (1)
macrophage (335)
MACSdata (52)
MACSr (1)
maditr (1)
madness (0)
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (3)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (3)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (0)
maftools (1)
magic (1)
magicaxis (1)
magick (27)
magrittr (15)
maic (0)
maicChecks (0)
mailR (0)
MAIT (0)
makecdfenv (0)
maketools (3)
MALDIquant (6)
mammaPrintData (63)
manipulate (0)
manipulateWidget (1)
maotai (0)
mapbayr (0)
mapboxapi (1)
mapdata (1)
mapDataAccess (1)
mAPKLData (25)
mapplots (0)
mapproj (3)
maps (13)
maptools (19)
maptree (0)
mapview (1)
maqcExpression4plex (89)
MAQCsubset (84)
MAQCsubsetAFX (33)
MAQCsubsetILM (39)
marginaleffects (1)
margins (1)
marinerData (57)
Markdown (0)
markdown (107)
markovchain (1)
marqLevAlg (0)
marray (1)
maser (1)
maSigPro (0)
MASS (390)
massHelper (1)
MassSpecWavelet (1)
massTRACE2Tools (1)
MAST (1)
Matching (3)
MatchIt (3)
MatchThem (1)
mathjaxr (2)
matlib (0)
Matri (1)
Matrix (445)
matrix (1)
Matrix.utils (1)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixExtra (2)
MatrixGenerics (3)
MatrixModels (78)
MAtrixModels (1)
matrixStats (229)
matrixStatst (1)
matrixTests (1)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (6)
mbend (0)
MBESS (1)
mboost (3)
mc2d (2)
MCAData (0)
mclogit (0)
mclust (19)
mclustcomp (0)
mcmc (2)
mcmcabn (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (4)
MCMCprecision (1)
mco (1)
MCPcounter (0)
mcr (6)
mCSEAdata (114)
mcsurvdata (38)
mctq (1)
mcv (1)
mda (1)
mdmb (1)
MEALData (13)
measurements (0)
measures (0)
mediation (0)
MEDIPSData (93)
MEEBOdata (76)
memisc (1)
memoise (11)
MEMSS (0)
memuse (1)
MendelianRandomization (3)
merDeriv (0)
MerfishData (63)
merge (1)
merTools (0)
MeSHDbi (1)
MESS (2)
meta (0)
Metab (0)
metabaser (1)
metaBLUE (0)
metaBMA (0)
MetaboAnalystR (0)
metabolomics (0)
MetaboReport (0)
metacore (1)
metadat (0)
metafor (7)
metagenomeSeq (1)
MetaGxBreast (47)
MetaGxOvarian (44)
MetaGxPancreas (42)
metaMA (7)
metaMS (0)
metaMSdata (175)
metan (1)
metap (11)
metaplot (0)
metaplus (0)
metapod (1)
MetaScope (36)
metatools (1)
MetaUtility (0)
methyAnalysis (0)
MethylAidData (87)
methylclock (1)
methylclockData (163)
methylKit (1)
MethylMix (0)
MethylSeqData (36)
methylumi (1)
methyvimData (7)
metR (2)
Metrics (1)
metricsgraphics (1)
metrumrg (1)
mets (1)
MetStaT (1)
mev (0)
mFilter (0)
Mfuzz (0)
mfx (0)
mgcv (250)
mgm (0)
mgvc (1)
mhsmm (1)
mhurdle (1)
mi (1)
mia (1)
miaViz (0)
mice (14)
miceadds (1)
MicrobaCommunityProfileReader (1)
microbenchmark (11)
microbiome (1)
MicrobiomeBenchmarkData (61)
microbiomeDataSets (179)
microeco (1)
micromap (0)
microRNAome (41)
microseq (0)
Microsoft365R (0)
MIGSAdata (11)
miloR (1)
mime (15)
mimosa (0)
minet (1)
minfi (1)
minfiData (522)
minfiDataEPIC (132)
minga (1)
miniCRAN (1)
minionSummaryData (81)
miniUI (1)
minpack.lm (4)
minqa (115)
mirai (4)
miRBaseVersions.db (1)
miRcompData (68)
miRNATarget (95)
mirt (4)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (2)
missMethyl (1)
missRanger (2)
misty (1)
mitml (1)
mitoODEdata (20)
mitools (1)
mix (1)
mixOmics (1)
mixsqp (20)
mixtools (1)
mixture (1)
MKmisc (1)
mlbench (12)
MLEcens (0)
mlegp (0)
mlfa (0)
mlflow (1)
MLmetrics (1)
mlmm (1)
mlmm.gwas (0)
mlmRev (0)
mlogit (0)
mlpack (1)
mlr (1)
mlr3 (3)
mlr3cluster (1)
mlr3data (0)
mlr3filters (1)
mlr3fselect (1)
mlr3hyperband (0)
mlr3learners (2)
mlr3mbo (1)
mlr3measures (2)
mlr3misc (2)
mlr3pipelines (2)
mlr3proba (1)
mlr3spatiotempcv (1)
mlr3tuning (1)
mlr3tuningspaces (1)
mlr3verse (1)
mlr3viz (1)
mlt (0)
mlt.docreg (1)
mma (1)
MMAPPR2data (25)
MMDiffBamSubset (69)
mmpf (1)
mmrm (26)
mnormt (15)
MNP (1)
mockery (3)
mockr (1)
modeest (1)
modelbased (4)
modeldata (14)
modelenv (3)
ModelMetrics (2)
modelObj (1)
modelr (29)
ModelR (1)
modelsummary (1)
modeltests (0)
modeltime (1)
modeltime.ensemble (2)
modeltools (1)
modetest (1)
modEvA (1)
MODIStsp (2)
modules (1)
MOFA (1)
MOFA2 (1)
MOFAdata (173)
moleculaR (0)
moments (3)
Momocs (1)
monaLisa (1)
mondate (1)
mongolite (1)
monkey (1)
monocle (1)
monocle3 (1)
monolix2rx (1)
MonoPhy (2)
morpheus (1)
Morpho (0)
mosaic (1)
mosaicCore (20)
mosaicData (1)
mosaicsExample (121)
motifmatchr (2)
mouse4302barcodevecs (49)
mouse4302frmavecs (4)
MouseAgingData (25)
mousecortexref.SeuratData (1)
MouseGastrulationData (159)
MouseThymusAgeing (72)
MPA (0)
MplusAutomation (1)
mpm (1)
mpn.scorecard (1)
mppR (0)
MPV (1)
mratios (0)
mregions (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msa (0)
msatR (1)
MSBdata (15)
MsCoreUtils (1)
msd16s (71)
msdata (616)
MsFeatures (0)
msigdb (669)
msigdbr (6)
msiImporter (1)
msm (7)
MSMB (80)
MSnbase (1)
Msnbase (1)
msPurityData (70)
msqc1 (39)
MSstats (1)
MSstatsBioData (7)
MSstatsConvert (1)
MSstatsLiP (0)
MSstatsPTM (1)
MSstatsTMT (0)
MSstatsTMTs (0)
mstate (1)
MSwM (0)
mtbls2 (160)
MTseekerData (6)
mtvnorm (1)
MUGAExampleData (53)
muhaz (0)
Mulder2012 (28)
muleaData (26)
multcomp (128)
multcompView (16)
multgee (0)
MultiAssayExperiment (0)
multicool (7)
multicross (1)
MultiDataSet (1)
multidplyr (1)
multiGSEA (1)
multimode (0)
multinichenetr (0)
multinma (1)
multipanelfigure (2)
multiplex (1)
multiwayvcov (0)
multiWGCNAdata (37)
multtest (1)
MuMIn (2)
munsell (151)
muscat (1)
muscData (164)
muscle (0)
MutationalPatterns (0)
mutoss (9)
mvabund (0)
mvna (0)
mvnfast (0)
mvnormtest (1)
mvoutData (77)
mvPot (1)
mvtnorm (124)
mwcsr (1)
mycor (1)
mygene (0)
myphd (0)
myTAI (1)
mzID (0)
mzR (1)

N

n1qn1 (0)
N2R (1)
nabor (1)
NACHO (1)
NADA (5)
NADIA (1)
naivebayes (1)
name (1)
namer (1)
namespace (1)
naniar (4)
nanoarrow (1)
nanonext (3)
nanopipeline (1)
NanoporeRNASeq (70)
NanoPyx (0)
NanoStringDiff (1)
NanoStringNCTools (0)
NanoStringNorm (1)
NanoStringQCPro (1)
nanostringr (1)
nanotime (2)
nanotubes (47)
narray (0)
nasapower (1)
nat.util (0)
nat.utils (0)
natserv (1)
naturalsort (0)
NbClust (1)
nbpMatching (0)
NBPSeq (1)
ncappc (1)
ncar (1)
ncdf4 (12)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1)
NCIgraphData (57)
ncigraphdata (1)
ncmeta (3)
NCmisc (2)
ncvreg (1)
ndexr (0)
ndjson (0)
Nebulosa (1)
negligible (1)
neo2R (1)
NEONiso (0)
neonUtilities (1)
nephro (0)
nestcolor (1)
nestedcv (1)
nestedLogit (0)
nestedmodels (0)
NestLink (40)
NetActivityData (51)
NetBID2 (1)
netDx.examples (1)
netmeta (0)
NetPreProc (1)
netrankr (0)
NetRep (1)
NetSwan (0)
network (3)
networkD3 (1)
networkDynamic (1)
neuralnet (0)
NeuralNetTools (0)
Neve2006 (72)
nFactors (0)
NGCHM (1)
NGLVieweR (1)
NGScopyData (67)
ngsReports (0)
NHANES (0)
nhanesA (0)
nichenetr (1)
nimble (1)
nipals (1)
NISTunits (0)
NlcOptim (0)
nleqslv (2)
nlme (241)
nlmeODE (1)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (0)
nloptr (58)
NLP (2)
nls2 (1)
NMcalc (0)
NMdata (1)
NMF (15)
NMproject (1)
nmrec (1)
NMsim (0)
nnet (41)
NNgenesets (1)
NNLM (0)
nnls (13)
NNutils (1)
noctua (1)
NOISeq (1)
nominatimlite (1)
NonCompart (1)
nonmem2R (0)
nonmem2rx (1)
nonmemica (0)
nonnest2 (1)
nor1mix (2)
norm (2)
NormalizerDE (0)
NormalyzerDE (1)
NORMT3 (1)
nortest (1)
notame (1)
Nozzle.R1 (0)
npde (1)
nphRCT (0)
npsurv (1)
nseval (1)
nullabor (1)
nullrangesData (204)
numbat (9)
numbers (1)
numDeriv (2)
NxtIRFdata (109)
nycflights13 (0)

O

oaqc (0)
ObMiTi (33)
oce (1)
oceanflow (1)
oct4 (51)
octad.db (62)
od (1)
odbc (26)
odyproteomicsValidator (0)
officedown (2)
officer (28)
OhdsiShinyModules (1)
oligo (1)
oligoClasses (1)
OlinkAnalyze (1)
olsrr (1)
OmicCircos (0)
omicsbase (0)
OMICsPCAdata (70)
omnibus (1)
OmnipathR (1)
omopgenerics (1)
ompr (1)
ompr.roi (1)
OnassisJavaLibs (49)
onbrand (0)
OncoBayes2 (0)
oncomarkerbase (1)
oneChannelGUI (0)
ontologyIndex (20)
ontologyPlot (1)
ontoProc (0)
oompaBase (6)
oompaData (6)
opdisDownsampling (1)
openCyto (1)
openeo (1)
OpenMx (1)
openssl (467)
openSTARS (1)
openxlsx (88)
openxlsx2 (1)
operator.tools (1)
optextras (0)
optimalFlowData (78)
optimParallel (0)
optimr (1)
optimx (5)
optmatch (3)
optparse (48)
optpart (0)
optweight (1)
orca (1)
OrderedList (1)
ordinal (8)
ore (1)
org.Ag.eg.db (0)
org.At.tair.db (1)
org.Dm.eg.db (0)
org.Dr.eg.db (1)
org.Hs.eg.db (3)
org.Hs.eg.dB (1)
org.Mm.eg.db (2)
org.Pf.plasmo.db (0)
org.Psativumv2.eg.db (1)
org.Rn.eg.db (1)
org.Sc.sgd.db (0)
org.Ss.eg.db (0)
OrganismDbi (1)
oricvis (1)
orientlib (0)
origami (0)
orthogene (0)
orthopolynom (0)
orthosData (64)
oskeyring (0)
osmdata (4)
osprey (1)
osqo (1)
osqp (4)
otargen (1)
outliers (1)
OUTRIDER (1)
overlapping (0)

P

PAA (0)
packcircles (1)
packer (0)
packrat (22)
pacman (0)
padr (1)
pagedown (2)
pagoda2 (0)
PAIRADISE (1)
PairedData (0)
pak (4)
paletteer (14)
palmerpenguins (1)
palr (1)
pals (5)
pammtools (1)
pamr (1)
pan (1)
pander (4)
pandoc (0)
panelr (1)
paquet (1)
paradox (2)
parallelDist (1)
parallelly (223)
parallelMap (0)
parallely (1)
param6 (1)
parameters (14)
ParamHelpers (1)
parathyroid (9)
parathyroidSE (344)
parathyroidse (1)
parcats (1)
PARdesign (1)
parrallely (1)
parsedate (4)
parsnip (17)
partitions (0)
party (79)
partykit (4)
pasilla (1004)
pasillaBamSubset (366)
PasillaTranscriptExpr (73)
pastecs (1)
PASWR (0)
patch (1)
patchwork (102)
pathfindR (1)
pathfindR.data (1)
pathifier (0)
PathNetData (65)
pathprintGEOData (7)
pathview (1)
pathways (1)
PatientProfiles (1)
patientProfilesVis (1)
patrick (0)
paws (16)
paws.analytics (16)
paws.application.integration (16)
paws.common (133)
paws.compute (88)
paws.cost.management (16)
paws.customer.engagement (16)
paws.database (16)
paws.developer.tools (16)
paws.end.user.computing (16)
paws.machine.learning (16)
paws.management (16)
paws.networking (16)
paws.security.identity (16)
paws.storage (130)
pbapply (29)
pbdZMQ (2)
PBIR (0)
pbivnorm (0)
pbkrest (0)
pbkrtest (58)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (1)
PBSddesolve (1)
PBSmapping (1)
pbv (1)
pcaExplorer (0)
pcaGoPromoter.Hs.hg19 (27)
pcaGoPromoter.Mm.mm9 (27)
pcaGoPromoter.Rn.rn4 (27)
pcalg (1)
pcaMethods (1)
PCAmixdata (1)
pcaPP (24)
PCAtools (1)
PCDimension (0)
pch (0)
PCHiCdata (80)
PCICt (0)
pcse (0)
pcxnData (39)
pd.atdschip.tiling (65)
pdfCluster (1)
pdftools (5)
pdInfoBuilder (1)
pdist (1)
pdp (1)
PeacoQC (1)
PeakcoQC (1)
PearsonDS (1)
pec (1)
pedigree (0)
pedigreemm (1)
pedtools (1)
pegas (2)
pegboard (0)
PEIP (1)
PEMM (1)
penalized (1)
pepDat (68)
PepsNMRData (58)
Peptides (1)
performance (13)
PerformanceAnalytics (1)
periscope (0)
perm (8)
permimp (0)
permute (2)
PFAM.db (1)
PFIM (0)
pgirmess (0)
PGPC (6)
PGSEA (0)
phangorn (3)
pharmaRTF (0)
pharmaversesdtm (0)
phastCons100way.UCSC.hg19 (3)
pheatmap (1)
phenoTest (1)
philentropy (2)
phonTools (1)
phosphoricons (4)
PhosR (0)
phyclust (1)
phylobase (1)
phylocanvas (0)
phylogram (0)
phylolm (1)
PhyloProfileData (34)
phyloseq (1)
phylosignal (0)
phylotools (0)
phyr (0)
phytools (5)
picante (0)
piecewiseSEM (1)
piggyback (1)
pillar (49)
pimeta (0)
pinfsc50 (1)
pingr (19)
pins (13)
pipebind (1)
pipeR (0)
piton (1)
pivotalAbundances (1)
pivotalPilars (1)
pivotalPillars (1)
pivotalReporters (1)
pixmap (17)
PK (0)
pkbrtest (1)
pkgbuild (165)
pkgcache (12)
pkgconfig (3)
pkgdepends (12)
pkgdown (147)
pkgKitten (1)
pkglite (1)
pkgload (337)
pkgmaker (3)
pkgpub (1)
pkgsearch (1)
PKI (8)
PKNCA (0)
PKPDdatasets (1)
PKPDmodels (1)
PKreport (1)
planet (1)
plantecophys (0)
plasFIA (11)
plier (0)
plm (1)
PLNmodels (1)
plogr (2)
plot3D (5)
plot3Drgl (1)
plotfunctions (1)
plotgardener (0)
plotgardenerData (88)
plotly (123)
plotlyGeoAssets (0)
plotmm (0)
plotmo (2)
plotrix (12)
plotROC (1)
pls (4)
plsmod (1)
plumber (20)
plyr (113)
plyranges (1)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (4)
pmforest (1)
pmml (0)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (0)
png (44)
poeticST (1)
poibin (1)
poilog (1)
pointblank (1)
PoissonBinomial (0)
polars (1)
poLCA (1)
polspline (4)
Polychrome (0)
polyclip (104)
polycor (0)
polyCub (3)
polyester (0)
polylabelr (1)
polynom (3)
PolynomF (1)
polysat (0)
pool (12)
poolfstat (1)
poorman (2)
PopED (0)
popEpi (1)
poppr (1)
PossibilityCurves (1)
posterior (13)
PowerExplorer (1)
poweRlaw (11)
powerTCR (1)
PowerTOST (1)
powsimR (1)
ppcor (1)
ppiData (38)
prabclus (2)
pracma (26)
prada (1)
praise (1)
praznik (1)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
prebsdata (89)
PreciseSums (0)
preciseTADhub (32)
preColours (1)
precommit (1)
precrec (1)
PREDAsampledata (82)
prediction (2)
predictmeans (1)
predint (0)
preGgplot2 (1)
PReMiuM (0)
preproc.iquizoo (1)
preprocessCore (1)
preprocessorCore (1)
preseqR (1)
presser (1)
presto (1)
prettycode (0)
prettydoc (1)
prettymapr (1)
prettyunits (133)
priceR (2)
primeviewcdf (1)
primeviewprobe (1)
princurve (1)
printr (0)
prioritylasso (1)
prismatic (12)
PRISMselector (1)
probably (1)
pROC (36)
processCore (0)
processx (304)
procs (1)
ProData (66)
prodlim (44)
productplots (0)
proffer (1)
profile (0)
profileModel (1)
profmem (0)
profvis (45)
progeny (1)
ProgMan (1)
progress (131)
progressr (49)
proj (0)
PROJ (4)
proj4 (10)
ProjecTILs (1)
projpred (1)
pRolocdata (228)
promise (0)
promises (281)
prompt (1)
prompter (3)
PropCIs (1)
properties (1)
propr (1)
PROreg (1)
PROscorer (1)
PROscorerTools (1)
ProSpect (1)
prostateCancerCamcap (49)
prostateCancerGrasso (52)
prostateCancerStockholm (38)
prostateCancerTaylor (43)
prostateCancerVarambally (38)
ProteinGymR (6)
proteomixr (1)
ProtGenerics (1)
proto (1)
protoarrayr (1)
protolite (1)
protr (11)
protti (1)
protViz (1)
proxy (3)
proxyC (3)
PRROC (5)
pryr (11)
ps (372)
PSCBS (6)
pscl (3)
PsNR (0)
pspearman (1)
pspline (2)
psych (134)
psychometric (4)
psychonetrics (1)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
ptairData (66)
PtH2O2lipids (100)
ptm.stoichiometry (1)
ptw (1)
PubChemR (1)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (0)
pulsar (1)
pumadata (89)
PupillometryR (1)
PureCN (0)
purrr (96)
purrrlyr (0)
purrrr (1)
pvca (0)
pvclust (0)
PWMEnrich.Dmelanogaster.background (77)
PWMEnrich.Hsapiens.background (76)
PWMEnrich.Mmusculus.background (69)
pwr (0)
pwrEWAS.data (16)
PwrGSD (1)
pyinit (0)
pzfx (0)

Q

qap (12)
qbaDatabase (1)
qcc (0)
qclMatrix (1)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq (1)
QDNAseq.hg19 (164)
QDNAseq.mm10 (92)
qgam (0)
QGEDP (1)
QGIOP (1)
QGMI (1)
QGplots (1)
QGqtl (1)
qgraph (1)
QGTAP (1)
QGtemplates (1)
qicharts (1)
qiimer (1)
qlcMatrix (18)
qpcR (0)
qpdf (4)
qPLEXdata (57)
qqconf (10)
qqman (3)
qqplotr (1)
qrcode (1)
qreport (1)
qrng (0)
qrnn (1)
qs (14)
QSARdata (0)
qtl (2)
qtl2 (2)
quadprog (1)
qualityTools (1)
qualpalr (0)
qualtRics (1)
qualV (1)
quantable (1)
quanteda (2)
quantmod (11)
QuantPsyc (1)
quantreg (86)
quantsmooth (0)
quarto (8)
QUBICdata (55)
qubiGenestack (1)
questionr (1)
QuickJSR (6)
quickmatch (1)
qvalue (1)
qvcalc (1)
qwraps2 (1)

R

r (0)
r-library-rags-stash (1)
R.cache (2)
R.devices (8)
R.filesets (8)
R.huge (7)
R.matlab (1)
R.methodsS3 (9)
R.oo (84)
R.rsp (1)
R.utils (90)
R2admb (1)
r2d2 (0)
r2d3 (2)
R2GUESS (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (0)
r2r (1)
r2rtf (0)
R2wd (0)
R2WinBUGS (1)
R6 (12)
rAccess (1)
radarchart (0)
radiant (1)
radiant.data (1)
radiant.model (1)
radiator (0)
raerdata (49)
ragg (258)
rainbow (10)
rAmCharts (1)
RamiGO (0)
randomcoloR (6)
RandomFields (1)
RandomFieldsUtils (1)
randomForest (26)
randomForestSRC (3)
randomizr (0)
randomNames (0)
randtests (1)
randtoolbox (1)
rangeModelMetadata (1)
ranger (20)
RankAggreg (1)
RankProd (0)
RANN (15)
rapiclient (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (0)
RApiSerialize (10)
rappdirs (5)
rapportools (1)
rARPACK (5)
raster (16)
rasterVis (1)
ratelimitr (0)
RAthena (11)
rayimage (1)
rayrender (1)
rayvertex (1)
rbacon (1)
rbenchmark (0)
RBesT (1)
RBGL (1)
rbibutils (35)
rbioapi (2)
RBioFormats (1)
rBLAST (1)
rbmi (0)
rbokeh (1)
Rcapture (1)
rcartocolor (0)
RccpTOML (1)
rcdk (10)
rcdklibs (11)
rcellminerData (92)
Rcgmin (1)
rCharts (1)
Rchoice (0)
RCircos (0)
RcisTarget (1)
RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp (168)
RClickhouse (0)
rclipboard (7)
rcmdcheck (3)
Rcmdr (1)
RcmdrMisc (1)
RColorBrewer (16)
rcompanion (1)
rcorpora (1)
Rcpp (399)
rcpp (1)
RcppAlgos (1)
RcppAnnoy (47)
RcppArmadillo (262)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (1)
RcppDate (1)
RcppDE (0)
RcppDist (0)
RcppEigen (196)
RcppEnsmallen (1)
RcppGSL (4)
RcppHNSW (31)
RcppInt64 (1)
RcppML (6)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (29)
RcppProgress (1)
RcppRoll (7)
RcppSimdJson (33)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (3)
RcppTOML (18)
RcppZiggurat (6)
Rcsdp (0)
RCurl (220)
RCy3 (0)
Rd2roxygen (0)
RDAVIDWebService (0)
RDBS.plot (1)
RDCOMClient (1)
rdd (0)
rdflib (1)
Rdimtools (0)
rdocx (0)
Rdpack (39)
rdrop2 (1)
Rdsdp (0)
reactable (2)
reactable.extras (1)
reactlog (1)
reactome.db (2)
ReactomeGSA (0)
ReactomeGSA.data (92)
ReactomePA (1)
reactR (59)
readbitmap (0)
readBrukerFlexData (1)
reader (1)
readJDX (1)
readODS (2)
readr (133)
readstata13 (1)
readxl (55)
rearrr (1)
REBayes (0)
recipes (60)
reclin (0)
recommenderlab (0)
recosystem (0)
reda (0)
REddyProc (0)
RedeR (1)
redison (1)
redland (1)
rEDM (1)
redoc (1)
redux (1)
refinr (1)
RefManageR (1)
refund (1)
reghelper (1)
registry (2)
RegParallel (88)
regress (1)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (8)
relimp (0)
relsurv (1)
remaCor (8)
rematch (71)
rematch2 (1)
remotes (160)
rempsyc (1)
renderthis (1)
rentrez (1)
renv (140)
Repitools (1)
report (4)
reporter (1)
ReporteRs (1)
ReporteRsjars (1)
reporting (1)
ReportingTools (1)
repr (7)
reprex (90)
repurrrsive (1)
reReg (0)
reshape (5)
reshape2 (4)
ResidualMatrix (1)
ResourceSelection (1)
restfulr (10)
restfulSEData (123)
RestRserve (1)
reticulate (93)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (3)
Rfast (15)
Rfast2 (2)
rfcdmin (9)
rfishbase (1)
Rfit (1)
RFOC (8)
RforProteomics (155)
rgbif (1)
RGCCA (0)
rgdal (19)
rgenoud (1)
rgeoda (1)
rgeos (17)
rgexf (1)
rgl (5)
Rglpk (1)
rglwidget (1)
RGMQLlib (61)
rgnparser (1)
RgoogleMaps (5)
rgr (1)
Rgraphviz (1)
rGREAT (1)
rhandsontable (3)
rhdf5 (2)
rhdf5filters (1)
Rhdf5lib (3)
rheumaticConditionWOLLBOLD (63)
rhino (20)
RhpcBLASctl (2)
Rhtslib (2)
rhub (3)
rice (1)
RICGA.clinical (0)
RIdeogram (0)
ridigbio (2)
riem (1)
Ringo (1)
rintcal (1)
rintrojs (6)
rio (22)
RIPSeeker (0)
RIPSeekerData (28)
RISCA (1)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
RITANdata (70)
ritis (0)
RItools (2)
riverplot (1)
rj (1)
rj.gd (1)
rjags (2)
rJava (129)
RJDBC (1)
rjson (52)
rjsoncons (1)
RJSONIO (17)
Rlab (0)
Rlabkey (1)
rlang (489)
rlaR (1)
rlecuyer (0)
rlemon (0)
RLHub (21)
rliger (1)
rlist (1)
rlistings (2)
RLRsim (0)
rly (0)
Rmagic (1)
rmapshaper (1)
RMariaDB (21)
rmarkdown (404)
RMassBankData (86)
rmatio (1)
rmcfs (1)
rmcorr (1)
rmdfiltr (1)
rmdformats (1)
rmeta (1)
rminer (0)
rmint.sdtm (1)
rmio (1)
rMisbeta (2)
Rmisc (1)
Rmixmod (1)
Rmpfr (16)
Rmpi (1)
rms (4)
rmsb (0)
rmspc (1)
RMTstat (1)
rmutil (1)
rMVP (2)
RMySQL (5)
RNAi (1)
RNAinteractMAPK (61)
RNAmodR.Data (79)
RNAseqData.HeLa.bam.chr14 (5)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 (370)
RNASeqDataSubset (3)
rnaseqGene (1)
RNASeqPower (0)
RNAseqQC (1)
RNASeqRData (8)
RnaSeqSampleSizeData (116)
RnaSeqTutorial (28)
rnaturalearth (2)
rnaturalearthdata (1)
RnBeads (0)
RnBeads.hg19 (183)
RnBeads.hg38 (171)
RnBeads.mm10 (102)
rnbeads.mm10 (0)
RnBeads.mm9 (114)
RnBeads.rn5 (59)
rncl (1)
RNetCDF (3)
RNeXML (0)
rngtools (2)
rngWELL (1)
RNifti (1)
rnoaa (1)
RNOmni (0)
roak (1)
robfilter (2)
RobinCar (1)
RobStatTM (0)
robumeta (0)
robust (20)
robustbase (41)
robustlmm (1)
RobustRankAggreg (0)
ROC (1)
ROCit (1)
ROCR (2)
RODBC (3)
ROI (1)
ROI.plugin.glpk (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
roll (2)
rols (0)
Rook (1)
rootSolve (7)
ropls (0)
roptim (1)
ROracle (1)
ROSE (1)
rosettR (0)
rosm (1)
rotl (2)
round (0)
roxygen (1)
roxygen2 (187)
rpact (1)
rpart (62)
rpart.plot (1)
RPEGLMEN (0)
RPEIF (0)
RPESE (0)
rpf (1)
RPMG (8)
Rpoppler (1)
RPostgres (96)
RPostgreSQL (5)
RpostgreSQL (1)
RPresto (1)
rprintf (0)
rprojroot (125)
rpromis (1)
RProtoBuf (1)
RProtoBufLib (1)
rpsftm (1)
RPtests (1)
RPushbullet (0)
Rqc (0)
rqdatatable (1)
rr2 (0)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
RRBSdata (61)
rrcov (25)
rrcovNA (1)
rRDPData (71)
rredlist (0)
RRPP (1)
rrsq (1)
rsample (23)
Rsamtools (3)
rsatscan (1)
rsbml (0)
RSclient (1)
rsconnect (37)
RSEIS (8)
RSelenium (2)
Rserve (1)
RSiena (0)
RSKC (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (0)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
rsnps (0)
Rsolnp (1)
rsparkling (1)
rsparse (1)
RSpectra (75)
Rspectra (1)
rspm (1)
RSQLite (206)
RsSimulx (0)
RsSimulx.1 (0)
rstan (15)
rstanarm (1)
rstanemax (1)
rstantools (13)
rstatix (21)
rstpm2 (1)
rstudioapi (164)
Rsubread (1)
rsvd (8)
rsvg (3)
RSVSim (1)
Rsymphony (0)
rtables (6)
RTCGA.clinical (284)
RTCGA.CNV (75)
RTCGA.methylation (71)
RTCGA.miRNASeq (123)
RTCGA.mRNA (185)
RTCGA.mutations (112)
RTCGA.PANCAN12 (132)
RTCGA.rnaseq (159)
RTCGA.RPPA (69)
RTCGAToolbox (0)
rtdists (0)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
RTN (1)
rtracklayer (3)
RTriangle (1)
Rtsne (38)
Rttf2pt1 (2)
rtweet (4)
Ruchardet (0)
rugarch (3)
RUnit (13)
runjags (1)
runner (3)
runonce (0)
Runuran (1)
ruODK (1)
ruv (1)
RUVnormalizeData (83)
RUVseq (0)
RVAideMemoire (0)
Rvcg (0)
rvcheck (4)
RVenn (0)
RVerbalExpressions (1)
rversions (20)
rvertnet (1)
rvest (186)
rvg (2)
Rvmmin (2)
RVtests (0)
Rwave (6)
rwdisplay (1)
RWiener (0)
rworldmap (1)
RxODE (0)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (1)

S

s2 (44)
s3fs (1)
S4Arrays (3)
S4Vectors (9)
S4vectors (1)
saemix (0)
saeRobust (1)
safeBinaryRegression (1)
safetyCharts (1)
safetyData (0)
safetyexploreR (0)
SAGx (1)
SAIGEgds (0)
sampleClassifierData (59)
sampleSelection (0)
sampling (1)
samr (5)
sandwich (19)
santoku (1)
sas7bdat (1)
sasLM (2)
SASmixed (0)
sass (333)
sassy (1)
SASxport (1)
satchel (1)
satellite (3)
satuRn (1)
SBGNview.data (191)
sbw (1)
SC3 (1)
scaeData (32)
scagnostics (0)
ScaledMatrix (2)
scales (135)
scalreg (0)
scam (1)
scanMiR (1)
scanMiRData (57)
scATAC.Explorer (35)
SCATE (0)
SCATEData (37)
scater (2)
scatterD3 (1)
scattermore (15)
scatterpie (50)
scatterplot3d (8)
scClassify (0)
scclusteval (0)
sccore (1)
sccs (0)
scCustomize (2)
scda (1)
scda.2021 (0)
scda.2022 (0)
ScDblFinder (0)
scDblFinder (2)
scDC (0)
sceptre (1)
scGate (1)
schex (1)
schoolmath (1)
scHOT (0)
scico (1)
scidb (0)
Scillus (0)
scistreer (9)
scITD (1)
scJonas (1)
SCLCBam (60)
scLinear (0)
scMerge (0)
scMultiome (86)
scooter (1)
scoringRules (1)
SCP (1)
scpdata (75)
scPipe (0)
scran (2)
scRepertoire (1)
screpertoire (1)
scrime (5)
scRNAseq (1720)
scRNASeq.spatial (0)
scry (1)
scrypt (4)
scs (1)
scTHI.data (53)
SCtools (1)
sctransform (16)
sctrnasform (1)
scuttle (11)
scviewer (0)
sda (1)
sdmpredictors (1)
SDMTools (1)
sdpR (1)
sdtmchecks (1)
secretbase (5)
secrets (1)
see (4)
segmented (35)
selectr (1)
sem (1)
semEff (0)
semTools (1)
sen2r (0)
sendmailR (1)
sensemakr (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
seq2pathway (0)
seq2pathway.data (187)
SeqArray (0)
seqArray (1)
seqc (62)
seqCNA.annot (37)
seqinr (16)
seqLogo (1)
seqmagick (2)
seqminer (12)
sequenza (0)
SeqVarTools (0)
seriation (45)
SeruatObject (1)
serumStimulation (54)
servr (7)
sesame (1)
sesameData (976)
sessioninfo (4)
set (1)
set6 (1)
setRNG (2)
sets (1)
settings (0)
Seurat (59)
seurat (1)
SeuratData (1)
SeuratDisk (1)
SeuratObject (45)
SeuratWrapper (1)
SeuratWrappers (1)
seventyGeneData (85)
sf (46)
SFEData (126)
sfheaders (23)
sfsmisc (4)
sftime (1)
sgeostat (0)
SGP (0)
SGPdata (1)
shadowtext (52)
shape (78)
shapefiles (0)
shapes (0)
shapr (0)
shapviz (1)
SHELF (0)
shinipsum (1)
shiny (330)
shiny.blueprint (2)
shiny.fluent (2)
shiny.react (5)
shiny.router (1)
shiny.semantic (1)
shiny.telemetry (1)
shinyAce (2)
shinyalert (17)
shinyauth (0)
shinyauthr (1)
shinyBS (8)
shinybusy (20)
shinycssloaders (16)
shinydashboard (4)
shinydashboardPlus (18)
shinydisconnect (3)
shinyEffects (0)
shinyEventLogger (1)
shinyFeedback (0)
shinyfeedback (0)
shinyFiles (11)
shinyglide (0)
shinyhelper (5)
ShinyItemAnalysis (4)
shinyjqui (1)
shinyjs (6)
shinylive (1)
shinyloadtest (1)
shinyLP (1)
shinymanager (3)
shinyMatrix (0)
shinyMethyl (0)
shinyMethylData (91)
shinyMobile (1)
shinypanel (6)
shinyscreenshot (2)
shinySelect (0)
shinystan (1)
shinytest (3)
shinytest2 (29)
shinythemes (2)
shinytoastr (1)
shinyTree (2)
Shinyusagelogr (1)
shinyvalidate (30)
shinyWidgets (115)
ShortRead (1)
showimage (0)
showtext (3)
showtextdb (0)
SIAMCAT (0)
SID (1)
sigaR (0)
sigclust (1)
Sigfried (1)
siggenes (1)
Signac (16)
signac (1)
signal (1)
signatureSearchData (162)
sigPathway (0)
silver3 (1)
SimBenchData (38)
SimBU (1)
SimBu (1)
SimComp (0)
SimDesign (2)
simex (0)
SimInf (1)
simmer (1)
SimMultiCorrData (1)
simpar (1)
simpIntLists (89)
simpleaffy (0)
simplermarkdown (0)
simplifyEnrichment (0)
simputation (0)
simr (1)
simresults (1)
simsurv (0)
simul (1)
Single.mTEC.Transcriptomes (45)
SingleCellExperiment (11)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellMultiModal (97)
singleCellTK (0)
SingleMoleculeFootprintingData (55)
SingleR (1)
singleR (1)
singscore (0)
sirnakit (1)
SIS (0)
siscreener (0)
sitmo (7)
sjlabelled (1)
sjmisc (2)
sjPlot (2)
sjstats (2)
SKAT (11)
skellam (1)
SkewHyperbolic (2)
skewt (0)
skimr (2)
skmeans (1)
skpr (1)
slackr (1)
slam (11)
slickR (0)
slider (19)
slingshot (1)
sloop (0)
slopeR (1)
sm (1)
smacof (1)
SmartEDA (1)
smcfcs (1)
smd (1)
sme (0)
smfishHmrf (0)
smldesign (1)
smokingMouse (49)
smooth (0)
smoother (1)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (7)
sn (13)
sna (3)
SNAData (62)
SNAGEEdata (83)
snakecase (15)
SnapATAC (0)
snapcount (1)
snow (12)
SnowballC (5)
snowfall (1)
snpar (1)
SNPhoodData (67)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (0)
SNPRelate (1)
snpStats (1)
sodium (7)
softImpute (1)
soilDB (1)
soiltexture (1)
solrium (0)
solvebio (1)
som (1)
SomaDataIO (3)
SomatiCAData (64)
SomaticCancerAlterations (105)
SomaticSignatures (1)
SomaVarDB (0)
SOMbrero (1)
sommer (1)
sortable (6)
sos (1)
sosta (1)
SoupX (1)
sourcetools (37)
sp (94)
spacefillr (1)
spacetime (3)
spacexr (1)
spacrt (1)
spade (0)
spam (13)
spam64 (0)
spaMM (1)
sparkline (0)
sparklyr (12)
SPARQL (1)
sparr (1)
SparseArray (1)
sparsebn (1)
sparsebnUtils (1)
SparseGrid (0)
SparseM (69)
sparseMatrixStats (2)
sparsepca (0)
sparsesvd (18)
spatial (34)
SpatialCPie (0)
SpatialDatasets (48)
SpatialDecon (1)
spatialDmelxsim (31)
SpatialEpi (1)
SpatialExperiment (1)
spatialFDA (1)
spatialLIBD (269)
spatialreg (0)
SpATS (1)
spatstat (6)
spatstat.core (13)
spatstat.data (40)
spatstat.explore (46)
spatstat.geom (52)
spatstat.linnet (5)
spatstat.model (5)
spatstat.random (47)
spatstat.sparse (31)
spatstat.univar (3)
spatstat.utils (40)
spatsurv (1)
spd (0)
spData (14)
spdata (1)
spdep (10)
spec (0)
spectacles (0)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (6)
spgs (0)
SPIA (0)
SpidermiR (0)
SpikeIn (104)
SpikeInSubset (139)
splancs (11)
splatter (0)
splice2neo (1)
spliceR (0)
SplicingVizUtils (1)
splines2 (1)
splitstackshape (1)
splitTools (1)
spls (0)
splus2R (4)
spocc (1)
SPOTlight (1)
spqnData (48)
spsComps (0)
sqldf (1)
SqlRender (2)
SQUAREM (2)
ssanv (0)
SSDM (1)
ssh (3)
SSPA (1)
stable (1)
stabledist (5)
stabs (0)
stacks (1)
StanHeaders (19)
stargazer (0)
stars (12)
starter (1)
startup (4)
startupmsg (1)
StatCharrms (1)
statgenGWAS (1)
statgenGxE (1)
statgenHTP (1)
statgenIBD (1)
statgenMPP (1)
statgenSTA (1)
statip (1)
statmod (5)
statnet (0)
statnet.common (2)
statsExpressions (3)
statTarget (0)
STdeconvolve (0)
stdmchecks (1)
stdReg (0)
stemHypoxia (79)
StepReg (1)
stevedore (1)
STexampleData (296)
sticky (0)
stinepack (4)
stjudem (46)
stopwords (1)
storr (0)
strandannotate (1)
strawr (1)
strex (2)
string (0)
stringdist (19)
stringfish (11)
stringi (394)
stringr (175)
striprtf (0)
strucchange (1)
structToolbox (0)
stxBrain.SeuratData (1)
styler (51)
SubcellularSpatialData (38)
subplex (1)
subselect (1)
SummarizedExperiment (4)
summarytools (1)
sunburstR (0)
superheat (0)
SuperLearner (1)
superpc (0)
SuppDists (4)
supraHex (0)
survAUC (1)
survcomp (0)
surveillance (3)
survex (1)
survey (5)
survival (250)
survivalROC (1)
survminer (5)
survMisc (1)
survMS (1)
survPen (0)
survPresmooth (0)
survtmle (1)
susieR (18)
sva (1)
svd (1)
svDialogs (1)
svglite (31)
svGUI (0)
SVM2CRMdata (46)
svMisc (1)
svUnit (0)
swagger (1)
swamp (1)
swfscMisc (1)
Swiffer (1)
swirl (0)
sybil (0)
sybilGUROBI (0)
sybilSBML (0)
sylly (0)
sylly.en (0)
symengine (1)
symphony (1)
synapser (1)
synapterdata (127)
synbreed (1)
syntenet (0)
Synth (1)
sys (126)
sysfonts (3)
systemfit (0)
systemfonts (303)
systemPipeRdata (242)
syuzhet (0)

T

table1 (3)
tableHTML (1)
tableone (0)
tables (2)
TabulaMurisData (73)
TabulaMurisSenisData (82)
tabulapdf (1)
tabulizer (1)
tabulizerjars (1)
TailRank (5)
tanggle (0)
tarchetypes (8)
targets (12)
TargetScoreData (71)
TargetSearchData (84)
tartare (88)
taskscheduleR (1)
TauStar (1)
taxadb (1)
taxize (2)
taxonomizr (1)
taylor (1)
TBX20BamSubset (99)
TCC (2)
TCGAbiolinks (0)
TCGAbiolinksGUI.data (4003)
TCGAbiolinksGul.data (1)
TCGAcrcmiRNA (46)
TCGAcrcmRNA (52)
TCGAMethylation450k (93)
tcgaWGBSData.hg19 (6)
TCGAWorkflowData (116)
tcltk (1)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TeachingDemos (2)
teal (2)
teal.builder (1)
teal.builder.modules (1)
teal.code (2)
teal.data (3)
teal.goshawk (1)
teal.logger (2)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.modules.sanofi (1)
teal.osprey (1)
teal.reporter (1)
teal.slice (3)
teal.transform (1)
teal.widgets (1)
templater (1)
tensor (1)
tensorA (13)
tensorflow (15)
TENxBrainData (120)
TENxBUSData (58)
TENxPBMCData (694)
TENxVisiumData (88)
TENxXeniumData (28)
tergm (0)
tern (4)
tern.gee (4)
tern.mmrm (2)
tern.rbmi (1)
terra (38)
tesseract (0)
tester (1)
TestGenerator (1)
testit (1)
testthat (305)
texreg (2)
text2vec (1)
textfeatures (1)
textrecipes (1)
textshape (1)
textshaping (196)
tfautograph (1)
TFBSTools (2)
tfdatasets (0)
TFisher (1)
TFMPvalue (8)
tfrmt (1)
tfruns (15)
tfse (1)
tgp (1)
TH.data (123)
thematic (6)
themeSanofi (1)
themis (0)
this.path (1)
threejs (1)
ThresholdROC (0)
tibbke (1)
tibble (41)
tictoc (12)
tidybayes (1)
tidycensus (9)
tidyclust (2)
tidycmprsk (1)
tidydr (1)
tidyfst (1)
tidygraph (44)
tidyHeatmap (1)
tidylog (1)
tidymodels (15)
tidyposterior (1)
tidypredict (2)
tidyproject (1)
tidyproteomics (1)
tidyquant (1)
tidyr (282)
tidyrules (0)
tidyselect (275)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySummarizedExperiment (0)
tidytable (1)
tidyterra (1)
tidytext (5)
tidytlg (1)
tidytransit (1)
tidytree (47)
tidyTree (0)
tidyverse (21)
tidyvpc (0)
tidyxl (2)
tiff (4)
tigris (19)
tikzDevice (1)
tiledb (1)
tiledbsoma (1)
timechange (206)
timecoursedata (211)
timeDate (50)
TimeProjection (2)
timereg (1)
TimerQuant (45)
timeSeries (14)
timetk (2)
timevis (1)
tinesath1cdf (56)
tinesath1probe (60)
tinkr (0)
tinylabels (1)
tinysnapshot (0)
tinytable (1)
tinytest (0)
tinytex (415)
tippy (1)
TiPS (1)
tis (0)
tissueTreg (67)
TitanCNA (0)
titanic (0)
tkrplot (0)
tkWidgets (0)
tldrm (1)
TLMoments (1)
tm (6)
tmap (1)
tmaptools (1)
TMB (30)
tmcn (1)
TMExplorer (42)
tmle (2)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (2)
TNO (0)
TNRS (1)
TOAST (1)
toastui (10)
tofsimsData (38)
tokenizers (4)
tokupika (0)
tolerance (0)
toOrdinal (1)
topdownrdata (60)
topGO (1)
topicmodels (1)
topr (6)
torch (1)
tornado (1)
tourr (1)
Tplyr (2)
tracee (1)
trackViewer (1)
tradeSeq (1)
traits (1)
TrajectoryUtils (1)
tram (0)
transformGamPoi (1)
transformr (0)
TransOmicsData (24)
transport (1)
tree (0)
treeio (10)
treemap (1)
treemapify (1)
treesitter.r (1)
treespace (0)
TreeSummarizedExperiment (0)
trendeval (1)
triangle (1)
triebeard (4)
trimcluster (0)
tripack (0)
trtf (0)
truncdist (0)
truncnorm (4)
truncreg (0)
tryCatchLog (1)
tsbox (1)
TSCAN (0)
tseries (10)
tsfeatures (2)
tsibble (2)
tsibbledata (1)
tsModel (0)
tsne (1)
tsoutliers (2)
TSP (19)
TSSi (0)
tsvio (1)
ttdo (0)
TTR (7)
ttservice (1)
tuberculosis (33)
tufte (0)
TumourMethData (44)
tune (15)
tuneRanger (1)
Turnover.cells.pSILAC.TMT (1)
twang (2)
twangContinuous (0)
tweeDEseqCountData (212)
tweedie (0)
tweenr (44)
twilight (1)
twosamples (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
txdbmaker (1)
tximeta (1)
tximport (1)
tximportDat (0)
tximportData (801)
txtq (0)
tzdb (47)

U

uatools (0)
UCell (1)
uchardet (1)
ucminf (7)
UCSC.utils (1)
udunits2 (1)
ufs (1)
umap (14)
Unicode (1)
unigd (1)
unikn (1)
UniprotR (1)
unitizer (0)
units (35)
unix (1)
unmarked (1)
unrtf (1)
UpSetR (0)
urca (8)
urlchecker (1)
urltools (1)
usdm (1)
usebox (1)
useful (1)
usefun (1)
usethis (178)
usmap (0)
usmapdata (0)
utf8 (177)
utilsRmd (1)
utilsStuff (1)
uuid (263)
uwot (130)

V

V8 (85)
validate (1)
valr (1)
VAM (1)
vaplot (0)
variables (0)
variancePartition (1)
VariantAnnotation (1)
VariantToolsData (47)
VariantWarehouseBMS (1)
varImp (0)
vars (1)
vaultr (1)
VBsparsePCA (0)
vcd (5)
vcdExtra (1)
vcfR (1)
vcr (0)
vctrs (208)
vdbR (0)
vdiffr (2)
VectraPolarisData (41)
vegan (40)
vegawidget (1)
vembedr (0)
vendormetadatahelpers (0)
venn (9)
VennDiagram (2)
venneuler (1)
vetiver (1)
VGAM (17)
VGAMextra (0)
vhydeg (0)
VIM (1)
vimp (1)
VineCopula (0)
vioplot (1)
vip (1)
viper (1)
vipor (23)
viridis (227)
viridislite (0)
viridisLite (67)
visdat (1)
visNetwork (4)
visOmopResults (1)
visR (1)
vistime (18)
vitae (1)
vpc (0)
vroom (129)
vscDebugger (1)
vsn (1)
vulcandata (79)

W

WA43966.shareR.3043877 (1)
waffle (1)
waiter (10)
wakefield (0)
waldo (197)
wallace (1)
warp (17)
wateRmelon (1)
waved (1)
waveslim (1)
waveTilingData (28)
wdm (0)
wdman (2)
weaver (0)
webchem (1)
webdriver (0)
WeberDivechaLCdata (57)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (0)
webp (1)
webshot (28)
webshot2 (3)
websocket (20)
webutils (2)
WeightIt (3)
weights (3)
WES.1KG.WUGSC (75)
wesanderson (1)
WGCNA (14)
WGScan (0)
WGSmapp (68)
wheatmap (1)
whereami (0)
whisker (26)
whitening (0)
whoami (1)
WibiR (1)
widgetframe (1)
widgetTools (1)
WikidataQueryServiceR (0)
WikidataR (0)
WikipediR (5)
wikitaxa (0)
wildmeta (0)
winboxr (1)
withr (325)
wk (44)
wkb (1)
worcs (1)
wordcloud (0)
wordcloud2 (0)
workflowr (1)
workflows (14)
workflowsets (14)
WorldFlora (1)
worrms (2)
wrapr (1)
Wrench (0)
writexl (36)
WriteXLS (6)
wrMisc (1)
WRS2 (2)

X

xairadiffex (1)
xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (0)
xbioc (0)
xcms (1)
xcoredata (48)
xfun (466)
xgboost (132)
xgxr (0)
XhybCasneuf (60)
XIFF (1)
XLConnect (1)
XLConnectJars (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
XML (152)
xml2 (147)
xmlparsedata (1)
xopen (36)
xportr (1)
xpose (0)
xpose.nlmixr2 (0)
xpose4 (0)
xrf (0)
xslt (3)
xtable (4)
xts (39)
XVector (3)

Y

yaImpute (2)
yaml (311)
YAPSA (1)
yardstick (23)
yeastCC (109)
yeastExpData (223)
yeastGSData (53)
yeastNagalakshmi (109)
yeastRNASeq (122)
ymlthis (0)
yri1kgv (29)
yriMulti (8)
yspec (1)
yulab.utils (79)

Z

zCompositions (11)
zeallot (0)
zebrafishRNASeq (230)
zellkonverter (1)
zelusutils (1)
zen4R (0)
zenith (1)
zinbwave (1)
zip (204)
Ziploc (1)
zlibbioc (5)
zoo (30)

Stats generated by https://github.com/Bioconductor/download_stats/