### R code from vignette source 'vignettes/ReactomePA/inst/doc/ReactomePA.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: options ################################################### options(width=60) require(ReactomePA) ################################################### ### code chunk number 2: load sample data ################################################### require(ReactomePA) data(sample) sample x <- enrichPathway(gene=sample,pvalueCutoff=0.05, qvalueCutoff=0.05, readable=T) head(summary(x)) ################################################### ### code chunk number 3: