############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r puma -R && F:\biocbuild\bbs-3.20-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data puma ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'puma/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'puma': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... OK Warning: 'inst/doc' files 'puma.Rnw', 'puma.pdf' ignored as vignettes have been rebuilt. Run R CMD build with --no-build-vignettes to prevent rebuilding. * cleaning src * checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts * checking for empty or unneeded directories * looking to see if a 'data/datalist' file should be added * building 'puma_3.48.0.tar.gz'