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### Running command:
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###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data muscle
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* checking for file ‘muscle/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘muscle’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* cleaning src
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... OK
* cleaning src
* checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts
* checking for empty or unneeded directories
* building ‘muscle_3.48.0.tar.gz’