############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data BatChef ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘BatChef/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘BatChef’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package (it is needed to build vignettes) * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘batch_correction.Rmd’ using rmarkdown Error: processing vignette 'batch_correction.Rmd' failed with diagnostics: subscript out of bounds --- failed re-building ‘batch_correction.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘batch_correction.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted