############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data chipenrich.data ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘chipenrich.data/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘chipenrich.data’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... OK Warning: ‘inst/doc’ files ‘chipenrich.data-vignette.Rmd’, ‘chipenrich.data-vignette.html’, ‘chipenrich.data-vignette.R’ ignored as vignettes have been rebuilt. Run R CMD build with --no-build-vignettes to prevent rebuilding. * checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts * checking for empty or unneeded directories NB: this package now depends on R (>= 3.5.0) WARNING: Added dependency on R >= 3.5.0 because serialized objects in serialize/load version 3 cannot be read in older versions of R. File(s) containing such objects: ‘chipenrich.data/data/enhancer.dnase_thurman.0.RData’ ‘chipenrich.data/data/enhancer.hg19.RData’ ‘chipenrich.data/data/enhancer.hg38.RData’ ‘chipenrich.data/data/enhancer.mm10.RData’ ‘chipenrich.data/data/enhancer.mm9.RData’ ‘chipenrich.data/data/gene.enh.desc.hg19.RData’ ‘chipenrich.data/data/gene.enh.desc.mm10.RData’ ‘chipenrich.data/data/gene.enh.desc.mm9.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOBP.dme.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOBP.dre.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOBP.hsa.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOBP.mmu.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOBP.rno.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOCC.dme.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOCC.dre.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOCC.hsa.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOCC.mmu.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOCC.rno.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOMF.dme.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOMF.dre.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOMF.hsa.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOMF.mmu.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.GOMF.rno.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.cellType.hsa.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.hallmark.hsa.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.immunologic.hsa.RData’ ‘chipenrich.data/data/geneset.oncogenic.hsa.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.danRer10.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm3.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.dm6.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.enhancer.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.enhancer_plus5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg19.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.enhancer.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.enhancer_plus5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.hg38.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm10.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.mm9.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn4.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn5.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.10kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.10kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.10kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.1kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.1kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.1kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.5kb.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.5kb_outside.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.5kb_outside_upstream.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.exon.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.intron.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.nearest_gene.RData’ ‘chipenrich.data/data/locusdef.rn6.nearest_tss.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.danRer10.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.dm3.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.dm6.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.hg19.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.hg38.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.mm10.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.mm9.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.rn4.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.rn5.RData’ ‘chipenrich.data/data/tss.rn6.RData’ * building ‘chipenrich.data_2.31.0.tar.gz’