############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data fastreeR ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘fastreeR/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘fastreeR’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘fastreeR_vignette.Rmd’ using rmarkdown Quitting from fastreeR_vignette.Rmd:88-112 [unnamed-chunk-4] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `if (file.size(tempVcf) == 0L) ...`: ! missing value where TRUE/FALSE needed ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'fastreeR_vignette.Rmd' failed with diagnostics: missing value where TRUE/FALSE needed --- failed re-building ‘fastreeR_vignette.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘fastreeR_vignette.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted