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### Running command:
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###   chmod a+r branchpointer -R && E:\biocbuild\bbs-3.21-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data branchpointer
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* checking for file 'branchpointer/DESCRIPTION' ... OK
* preparing 'branchpointer':
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building 'branchpointer.Rnw' using knitr
pdftex: major issue: User/administrator updates are out-of-sync.
pdfcrop: major issue: User/administrator updates are out-of-sync.

Quitting from lines 220-227 [read_snp_mart] (branchpointer.Rnw)
Error: processing vignette 'branchpointer.Rnw' failed with diagnostics:
Failed to parse URL: Bad scheme
--- failed re-building 'branchpointer.Rnw'

SUMMARY: processing the following file failed:
  'branchpointer.Rnw'

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted