##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data apeglm
###
##############################################################################
##############################################################################


* checking for file ‘apeglm/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘apeglm’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* cleaning src
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building ‘apeglm.Rmd’ using rmarkdown

Quitting from lines 85-90 [unnamed-chunk-4] (apeglm.Rmd)
Error: processing vignette 'apeglm.Rmd' failed with diagnostics:
there is no package called 'DESeq2'
--- failed re-building ‘apeglm.Rmd’

SUMMARY: processing the following file failed:
  ‘apeglm.Rmd’

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted