############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r Pirat -R && E:\biocbuild\bbs-3.21-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data Pirat ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'Pirat/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'Pirat': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... OK * excluding invalid files Subdirectory 'R' contains invalid file names: 'install.R.old' * checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts * checking for empty or unneeded directories * looking to see if a 'data/datalist' file should be added * building 'Pirat_1.1.0.tar.gz' Warning: file 'Pirat/configure' did not have execute permissions: corrected