############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data spicyWorkflow ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘spicyWorkflow/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘spicyWorkflow’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘spicyWorkflow.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 583-593 [unnamed-chunk-27] (spicyWorkflow.Rmd) Error: processing vignette 'spicyWorkflow.Rmd' failed with diagnostics: object 'Rs' not found --- failed re-building ‘spicyWorkflow.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘spicyWorkflow.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted