############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r UMI4Cats -R && E:\biocbuild\bbs-3.21-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data UMI4Cats ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'UMI4Cats/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'UMI4Cats': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'UMI4Cats.Rmd' using rmarkdown UMI4Cats_data_reduced/ref_genome/ucsc.hg19.chr16.rev.1.bt2: truncated gzip input tar.exe: Error exit delayed from previous errors. Quitting from lines 187-206 [demultiplex] (UMI4Cats.Rmd) Error: processing vignette 'UMI4Cats.Rmd' failed with diagnostics: cannot open the connection --- failed re-building 'UMI4Cats.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'UMI4Cats.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted