############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data pairkat ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘pairkat/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘pairkat’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘using-pairkat.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 232-233 [unnamed-chunk-7] (using-pairkat.Rmd) Error: processing vignette 'using-pairkat.Rmd' failed with diagnostics: cannot open the connection to 'https://rest.kegg.jp/list/organism' --- failed re-building ‘using-pairkat.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘using-pairkat.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted