############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data SparseArray ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘SparseArray/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘SparseArray’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘SparseArray_objects.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 451-456 [unnamed-chunk-30] (SparseArray_objects.Rmd) Error: processing vignette 'SparseArray_objects.Rmd' failed with diagnostics: HDF5. File accessibility. Unable to open file. --- failed re-building ‘SparseArray_objects.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘SparseArray_objects.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted