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### Running command:
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###   /home/hpages/bbs-3.18-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data nem
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* checking for file ‘nem/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘nem’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* cleaning src
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building ‘nem.Rnw’ using Sweave
Warning: Package 'nem' is deprecated and will be removed from Bioconductor
  version 3.12

Error: processing vignette 'nem.Rnw' failed with diagnostics:
 chunk 8 
Error in if (!(class(g) %in% c("graphNEL", "matrix"))) stop("Input must be either graphNEL object or adjacency matrix") : 
  the condition has length > 1

--- failed re-building ‘nem.Rnw’

SUMMARY: processing the following file failed:
  ‘nem.Rnw’

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted