############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data lemur ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘lemur/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘lemur’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘Introduction.Rmd’ using rmarkdown 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Quitting from lines 106-113 [raw_umap] (Introduction.Rmd) Error: processing vignette 'Introduction.Rmd' failed with diagnostics: function 'as_cholmod_sparse' not provided by package 'Matrix' --- failed re-building ‘Introduction.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘Introduction.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted