############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.17-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data spatialDE ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘spatialDE/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘spatialDE’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘spatialDE.Rmd’ using rmarkdown WARNING: ignoring environment value of R_HOME WARNING: ignoring environment value of R_HOME Warning in for (v in val) { : closing unused connection 5 (<-localhost:11134) WARNING: ignoring environment value of R_HOME Quitting from lines 142-147 (spatialDE.Rmd) Error: processing vignette 'spatialDE.Rmd' failed with diagnostics: one node produced an error: object '.set_fake_tqdm' not found --- failed re-building ‘spatialDE.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘spatialDE.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted