### R code from vignette source 'GEOsearch.Rnw' ### Encoding: UTF-8 ################################################### ### code chunk number 1: GEOsearch.Rnw:33-36 ################################################### library(GEOsearch) library(org.Hs.eg.db) library(org.Mm.eg.db) ################################################### ### code chunk number 2: GEOsearch.Rnw:39-41 ################################################### Oct4alias <- TermAlias("Oct4 RNA-seq") Oct4alias ################################################### ### code chunk number 3: GEOsearch.Rnw:50-52 ################################################### Oct4searchres <- GEOSearchTerm(Oct4alias) head(Oct4searchres) ################################################### ### code chunk number 4: GEOsearch.Rnw:61-63 ################################################### Oct4keywordfreq <- KeyWordFreq(Oct4searchres) head(Oct4keywordfreq) ################################################### ### code chunk number 5: GEOsearch.Rnw:72-73 ################################################### SampleDetail(c("GSE69322","GSE64008"))