### R code from vignette source 'examples.rnw'

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### code chunk number 1: preliminaries
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library(MSwM)
set.seed(2341)


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### code chunk number 2: examples.rnw:50-51
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data(example)


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### code chunk number 3: examples.rnw:55-56
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plot(ts(example))


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### code chunk number 4: examples.rnw:63-65
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mod=lm(y~x,example)
summary(mod)


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### code chunk number 5: fig1_3
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qqnorm(resid(mod))
qqline(resid(mod))


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### code chunk number 6: fig1_4
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acf(resid(mod))


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### code chunk number 7: examples.rnw:88-90
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mod.mswm=msmFit(mod,k=2,p=1,sw=c(TRUE,TRUE,TRUE,TRUE),control=list(parallel=FALSE))
summary(mod.mswm)


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### code chunk number 8: examples.rnw:97-98
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plot(mod.mswm)


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### code chunk number 9: fig1_6
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plotDiag(mod.mswm,which=2)


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### code chunk number 10: fig1_7
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plotDiag(mod.mswm,which=3)


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### code chunk number 11: pp1m3
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   plotProb(mod.mswm,which=1)


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### code chunk number 12: pp2m3
###################################################
   plotProb(mod.mswm,which=2)


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### code chunk number 13: pp3m3
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   plotReg(mod.mswm,expl="x")


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### code chunk number 14: examples.rnw:156-158
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data(traffic)
plot(ts(traffic[2:4]),main="Traffic")


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### code chunk number 15: examples.rnw:165-167
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model=glm(NDead~Temp+Prec,traffic,family="poisson")
summary(model)


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### code chunk number 16: examples.rnw:172-174
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m1=msmFit(model,k=2,sw=c(TRUE,TRUE,TRUE),family="poisson",control=list(parallel=FALSE))
summary(m1)


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### code chunk number 17: examples.rnw:177-178
###################################################
intervals(m1)


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### code chunk number 18: examples.rnw:182-183
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plot(m1)


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### code chunk number 19: fig2_3
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plotDiag(m1,which=2)


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### code chunk number 20: fig2_4
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plotDiag(m1,which=3)


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### code chunk number 21: pp1m1
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   plotProb(m1,which=2)