### R code from vignette source 'estimation.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: estimation.Rnw:37-43 ################################################### library (Frames2) data(DatA) data(DatB) head (DatA, 3) head (DatB, 3) ################################################### ### code chunk number 2: estimation.Rnw:54-62 ################################################### data(PiklA) data(PiklB) yA <- with(DatA, data.frame(Feed, Clo, Lei)) yB <- with(DatB, data.frame(Feed, Clo, Lei)) Hartley(yA, yB, PiklA, PiklB, DatA$Domain, DatB$Domain) FB(yA, yB, PiklA, PiklB, DatA$Domain, DatB$Domain) ################################################### ### code chunk number 3: estimation.Rnw:68-70 ################################################### Hartley(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain) FB(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain) ################################################### ### code chunk number 4: estimation.Rnw:75-77 ################################################### summary(Hartley(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain)) ################################################### ### code chunk number 5: estimation.Rnw:82-86 ################################################### Hartley(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, 0.95) FB(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, 0.95) ################################################### ### code chunk number 6: estimation.Rnw:91-93 ################################################### BKA(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$ProbB, DatB$ProbA, DatA$Domain, DatB$Domain) ################################################### ### code chunk number 7: estimation.Rnw:97-98 ################################################### Compare(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain) ################################################### ### code chunk number 8: estimation.Rnw:104-108 ################################################### SFRR(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$ProbB, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191) CalSF(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$ProbB, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191) ################################################### ### code chunk number 9: estimation.Rnw:113-119 ################################################### PML(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191) PEL(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191) CalDF(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191) ################################################### ### code chunk number 10: estimation.Rnw:126-133 ################################################### PEL(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191, N_ab = 601) CalSF(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$ProbB, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191, N_ab = 601) CalDF(yA, yB, DatA$ProbA, DatB$ProbB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191, N_ab = 601) ################################################### ### code chunk number 11: estimation.Rnw:141-151 ################################################### PEL(yA, yB, PiklA, PiklB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191, xsAFrameA = DatA$Inc, xsBFrameA = DatB$Inc, XA = 4300260) CalSF(yA, yB, PiklA, PiklB, DatA$ProbB, DatB$ProbA, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191, xsAFrameB = DatA$M2, xsBFrameB = DatB$M2, XB = 176553) CalDF(yA, yB, PiklA, PiklB, DatA$Domain, DatB$Domain, N_A = 1735, N_B = 1191, xsAFrameA = DatA$Inc, xsBFrameA = DatB$Inc, xsAFrameB = DatA$M2, xsBFrameB = DatB$M2, XA = 4300260, XB = 176553)